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微生物 : Herpetosiphon aurantiacus

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Herpetosiphon aurantiacus
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 ATCC 23779=DSM 785
他株番号
参考文献
5669912
Herpetosiphon aurantiacus gen. et sp. n., a new filamentous gliding organism. (J Bacteriol. 1968)
22675585
Complete genome sequence of the filamentous gliding predatory bacterium Herpetosiphon aurantiacus type strain (114-95(T)). (Stand Genomic Sci. 2011)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHaur_4765
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseHaur_0597
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IHaur_2962
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseHaur_1230
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHaur_0708
Bioplastic degradation(NFUNC_0015)
必須B
PHAZ2
(NRULE_0080)
Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymeraseHaur_2770
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseHaur_2115
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHaur_0777
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHaur_0890 Haur_0259 Haur_1722 Haur_3163 Haur_2901
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHaur_2901 Haur_3163 Haur_0259 Haur_0890 Haur_1722
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinHaur_2900
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinHaur_2267
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseHaur_1306
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Haur_1306
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDHaur_2423
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseHaur_1586
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseHaur_1304
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFHaur_0245
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseHaur_2828
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSHaur_3808
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTHaur_3807

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA16523
ローカスタグHAUR
INSDC entriesCP000875
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数3
サイズ(bp) 6,785,430
遺伝子数 5,278
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Herpetosiphon aurantiacus gen. et sp. n., a new filamentous gliding organism. (J Bacteriol. 1968) PMID: 5669912
  • Complete genome sequence of the filamentous gliding predatory bacterium Herpetosiphon aurantiacus type strain (114-95(T)). (Stand Genomic Sci. 2011) PMID: 22675585

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
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gz
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TSV
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2.0 MB 1.8 MB 1.2 MB 398.7 KB