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Gilvo_00070 : CDS information

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Organism
StrainGö 3592
Entry nameGilvocarcin
Contig
Start / Stop / Direction10,000 / 9,257 / - [in whole cluster]
10,000 / 9,257 / - [in contig]
Locationcomplement(9257..10000) [in whole cluster]
complement(9257..10000) [in contig]
TypeCDS
Length744 bp (247 aa)
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Category3.2 modification methylation
Productoxidoreductase/C-12 O-methyltransferase
Product (GenBank)hypothetical protein
Gene
Gene (GenBank)gilM
EC number
Keyword
  • quinone reduction
  • hemiacetal formation
Note
Note (GenBank)
  • GilM
Reference
ACC
PmId
[12822997] The complete gene cluster of the antitumor agent gilvocarcin V and its implication for the biosynthesis of the gilvocarcins. (J Am Chem Soc. , 2003)
[22800463] Roles of the synergistic reductive O-methyltransferase GilM and of O-methyltransferase GilMT in the gilvocarcin biosynthetic pathway. (J Am Chem Soc. , 2012)
comment
[PMID: 12822997](2003)
gilvocarcin(gil) gene cluster同定のためにクローニングされたcos-G9B3をS.lividans TK24に導入すると、wildレベルのgilvocarcins V and M産生あり。よってgilvocarcin生合成のための完全なclusterが含まれている。

cos-G9B3をサブクローニングしてシークエンス。32.9kbpに26ORFsあり。
supporting info. Table 1
GilM(247aa): Unknown

配列解析のみ
closest homolog=Rv2675c(38%)

---
[PMID: 22800463](2012)
GilMT and GilMの調査。
recombinant enzymesを使った合成中間体とのin vitro実験。

GilMT反応由来の産物5とGilMを反応させて産物を解析。
GilMはgilvocarcinsのtetracyclic coreを構築するために一連の反応を触媒する。

産物5
↓quinone還元
↓hemiacetal形成
demethyl-defuco-pregilvocarcin M
↓O-methylation
defuco-pregilvocarcin M

「GilMはGilRの反応によるFADH2供給を受けて還元的触媒を媒介する。
GilMの反応により、FADH2はGilRのためのFADへとリサイクルされる。」
と仮定し、defuco-gilvocarcin Mの産生量が産物5 + GilMより、産物5 + GilM + GilRで10倍増えることから、GilMはGilRと相乗的に働くことが確認されたと述べている。

この珍しい相乗効果により、polyketide由来defuco-gilvocarcin chromphoreの生合成は最終的に完了する。

defuco-pregilvocarcin M
↓GilR: FAD-dependent oxidoreductase
defuco-gilvocarcin M

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selected fasta
>oxidoreductase/C-12 O-methyltransferase [hypothetical protein]
MPTGSTEKIPFEKLYQDGEKSGPLMPWNIGGPQPAVRAICDRGGFRGHVLDLGCGLGDNA
LYLASRGLRVSAVDISEVAVQCGRDKARDHGVSVDFQVTDAFRLAESGVRYDAVLDSAFF
HTLPQEEVPRYTELLRTLCKEGAELHLFTFSKELTPDYPGPRRISEPELREAFGADWDIK
VIEATRYHSSLPPEAVAQMVDPRTFEVNAPTDNLAAQMVDEAGNVVSHIWHMHAVLRPQA
TRSESPA
selected fasta
>oxidoreductase/C-12 O-methyltransferase [hypothetical protein]
ATGCCAACGGGCAGCACGGAGAAGATCCCCTTCGAGAAGCTCTACCAGGACGGGGAGAAG
TCAGGCCCCCTCATGCCGTGGAACATCGGCGGCCCGCAGCCGGCCGTACGCGCGATCTGT
GATCGCGGCGGCTTCCGCGGGCACGTGCTCGATCTGGGCTGCGGGCTCGGAGACAACGCG
CTCTACCTGGCTTCCCGGGGGCTGCGGGTCTCCGCGGTCGACATCTCGGAGGTCGCCGTC
CAGTGCGGGCGCGACAAGGCCCGGGACCACGGCGTGAGCGTCGACTTCCAGGTGACCGAC
GCCTTCCGCCTCGCGGAGTCCGGTGTCCGGTACGACGCCGTCCTGGACAGCGCCTTCTTC
CACACGCTGCCGCAGGAGGAGGTGCCGCGCTACACGGAGCTCCTGCGGACCCTGTGCAAG
GAGGGGGCCGAGCTGCACCTGTTCACCTTCTCGAAGGAGCTGACCCCCGACTACCCGGGT
CCGCGCCGCATCTCCGAACCGGAGTTGCGGGAGGCGTTCGGCGCCGACTGGGACATCAAG
GTGATCGAGGCGACGCGGTACCACAGCTCGCTGCCGCCGGAGGCCGTCGCGCAGATGGTC
GACCCGCGGACCTTCGAGGTGAACGCCCCCACCGACAACCTCGCCGCCCAGATGGTGGAC
GAAGCCGGGAACGTCGTCTCCCACATCTGGCACATGCATGCCGTACTGCGTCCGCAGGCA
ACCCGATCGGAGAGCCCGGCATGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR008854 TPMT family (Family)
[25-185] 1e-15 PF05724
PF05724   TPMT
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Gilvo_00060 Gilvo_00060   Gilvo_00080 Gilvo_00080
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