Enter_00030 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces maritimus
Strain
Entry name	Enterocin
Contig	AF254925
Start / Stop / Direction	3,163 / 2,672 / - [in whole cluster] 3,163 / 2,672 / - [in contig]
Location	complement(2672..3163) [in whole cluster] complement(2672..3163) [in contig]
Type	CDS
Length	492 bp (163 aa)

Annotation

Category	5.4 hypothetical protein
Product	hypothetical protein
Product (GenBank)	EncG
Gene
Gene (GenBank)	encG
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q9KHL2 PmId [11137817] Cloning, sequencing and analysis of the enterocin biosynthesis gene cluster from the marine isolate 'Streptomyces maritimus': evidence for the derailment of an aromatic polyketide synthase. (Chem Biol. , 2000) comment enterocin と wailupemycinsの生合成をコードするgene clusterの同定。 EncG: Unknown EncGは、type II PKS pathwaysで見られるタンパクのfamilyに相同がある。このfamilyにはMtmX(mithramycin), DpsH(daunorubicin), ActVI-ORFA(actinorhodin), Gra-ORF31 (granaticin)が含まれる。
Related Reference	ACC Q2PA04 NITE Stref_00110 PmId [16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006) comment Blast 14th, id35%, 9e-17 Streptomyces steffisburgensis_stfX Cyclase [DoBISCUIT]hypothetical protein StfXはpolyketideの4番目の環化をすると考えられていたが、stfX不活化mutantでも4th ring cyclizationされたcompound 1を検出。よってこの環化は自発的に発生し、StfXはこの過程を促進するとされている。
	ACC Q9ZAT9 NITE Adria_00050 PmId [9864344] Doxorubicin overproduction in Streptomyces peucetius: cloning and characterization of the dnrU ketoreductase and dnrV genes and the doxA cytochrome P-450 hydroxylase gene. (J Bacteriol. , 1999) [10631513] A two-plasmid system for the glycosylation of polyketide antibiotics: bioconversion of epsilon-rhodomycinone to rhodomycin D. (Chem Biol. , 1999) comment Blast 20th, id36%, 3e-12, N末50aaほど余る Streptomyces peucetius_dpsH(dnmW) Daunorubicin biosynthesis enzyme [DoBISCUIT]hypothetical protein --- [PMID: 9864344](1999) dpsH::aphII mutantは、有意な量のRHOを蓄積したが、daunorubicin (DNR) or doxorubicin (DXR)はしなかった。(TLC and HPLC analysis) このmutantでの相補実験もしたがdpsH geneの役割についての明白な結論に到達できなかった。 dpsHはdaunosamine生合成またはRHOへのdaunosamine付着に関連する可能性あり？ --- [PMID: 10631513](1999) dpsH(dnmW) geneの役割の再評価をしている。 dpsH in-frame mutantは、RHOの蓄積が増える(160-273%)が、DNR(23-34%) and DXR(10-24%)の産生もまだいくらかある。よってdpsHは、anthracycline glycosides RHOD, DNR and DXRの形成において、重要ではあるが絶対的に必要ではない。これを受けてdpsH→dnmWへ改名している。 DiscussionにdnmQ or dnmWどちらかの欠損は厳しくdTDP-daunosamineの形成を減らす、との記述があるがdTDP-daunosamine量を測定している実験の記載はなく由来不明。
	ACC Q53925 NITE Actino_00020 PmId [17227452] Possible involvement of ActVI-ORFA in transcriptional regulation of actVI tailoring-step genes for actinorhodin biosynthesis. (FEMS Microbiol Lett. , 2007) comment Blast 38th, id31%, 2e-06 Streptomyces coelicolor_ORFA Hydroxylacyl-CoA dehydrogenase [DoBISCUIT]hypothetical protein actVI-ORFA mutantはactinorhodin産生減少、中間体(S)-DNPAとshunt産物(S)-NHABを蓄積。相補で回復。また、同じmutantでactVI-ORF1発現量が減少。相補で回復。よってActVI-ORFAは、post-PKS tailoring enzymeであるactVI-ORF1の発現を通してactinorhodin産生に影響を与えるregulatory roleを持つ可能性あり。

Sequence

>hypothetical protein [EncG]
MTTAGADPTQAEESALTQAPHKPEETAALFAEIQQFYGRHMRAMDEGRVEDWTGDFMPDA
VFATNARPEPQRGRAEIARNAEAAARQLQEKGILRRHCVTTLELQQASGLTLLAKTYALI
TKTVVGGRSELEFVCTCEDVLVRNEGRWFIRHRQVFRDDLPKR

>hypothetical protein [EncG]
GTGACTACGGCAGGAGCTGACCCGACCCAAGCAGAGGAGAGCGCCTTGACACAGGCCCCG
CACAAGCCGGAGGAGACCGCGGCGTTGTTCGCAGAGATTCAGCAGTTCTACGGGCGCCAC
ATGCGGGCCATGGACGAAGGCCGAGTGGAGGACTGGACCGGCGACTTCATGCCCGACGCG
GTCTTCGCGACCAACGCCCGACCCGAGCCCCAGCGCGGGCGGGCCGAGATCGCCCGAAAC
GCGGAGGCCGCAGCGCGGCAGCTGCAGGAGAAGGGCATCCTGCGCCGCCACTGCGTCACC
ACCCTGGAACTCCAGCAGGCGAGTGGACTGACGCTCCTGGCCAAGACCTACGCCCTGATC
ACCAAGACGGTGGTGGGAGGCCGGTCGGAGCTGGAGTTCGTGTGTACCTGCGAGGACGTG
CTCGTCCGGAACGAGGGCCGATGGTTCATCCGGCACCGCCAGGTCTTCCGGGACGATCTC
CCCAAGAGGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	No significant hit
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Enter_00020 Enter_00040