Fren_00170 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces roseofulvus
Strain	AK24158
Entry name	Frenolicin
Contig	AF058302
Start / Stop / Direction	18,830 / 19,825 / + [in whole cluster] 18,830 / 19,825 / + [in contig]
Location	18830..19825 [in whole cluster] 18830..19825 [in contig]
Type	CDS
Length	996 bp (331 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	putative cyclase/dehydratase
Product (GenBank)	aromatase
Gene	frnQ fren-ORF4
Gene (GenBank)	frnQ
EC number
Keyword	1st ring
Note
Note (GenBank)	FrnQ; actVII homolog; ORF4 of Bibb et al
Reference	ACC Q54999 PmId [8181754] Cloning, sequencing and deduced functions of a cluster of Streptomyces genes probably encoding biosynthesis of the polyketide antibiotic frenolicin. (Gene. , 1994) comment frenolicin biosynthesis gene clusterにある6ORFの同定。 ORF4: bifunctional cyclase/dehydrase 配列解析のみ。 actVII homolog.
Related Reference	ACC Q02055 NITE Actino_00210 PmId [11851466] Genetic Contributions to Understanding Polyketide Synthases. (Chem Rev. , 1997) comment Blast 7th, id46％, 8e-62 Streptomyces coelicolor_actVII Actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase [Actino_00210]cyclase/dehydratase(1st ring) -- [Pubmed登録なし]Engineered Biosynthesis of Novel Polyketides: actVII and actIV Genes Encode Aromatase and Cyclase Enzymes, Respectively. J. Am. Chem. Soc., 1994, 116 (24), pp 10855-10859 act minimal PKS, KR(actIII ), actVII, actIV の様々な組み合わせのrecombinantsによって産生されたpolyketides構造を測定。 minimal PKS = SEK4 minimal PKS + act KR = mutactin minimal PKS + act KR + actVII = SEK34 minimal PKS + act KR + actVII + actIV = DMAC ActVII は1st carbocyclic ringの2つのdehydrationsを触媒することを担うaromataseとして機能する。 ActIV は2つめのringを形成するための分子内aldol縮合を触媒するcyclaseである。 ActVII homologsは、gra, fren, tcm, gris生合成clusterにある。 ActIV homologsは、gra, fren, gris生合成clusterにある。 -- [PMID:11851466](1997) 上記PMIDなし論文がRef採用されているレビュー。 ActVII とgra, fren homologsはdidomain aromataseで、9-KRで還元されたC9-OH基を含み、2分子の水を除去をする。対して、N末だけActVII と似ているmonodomain aromatase_tcmNは、非還元polykeideを合成するPKSのcomponentである。

Sequence

>putative cyclase/dehydratase [aromatase]
MTTTTTGHQRPGSAEHSARLAAPPASAYELVADVTRWPLLFTPCLHAEVLESGPGTERVR
LWALTGEQVRGWTSRRTLDSEGLRVGFRQEDSAPPLAAMGGEWRFTEEGEDTRAVLAHDW
TLTEPGAAPHRWVTETLDRNSTAEIGAVTAWAARTHAAGGADALLFSFTDSLDIAAPAPD
VYAFLDAADQWPARLPHVSRVAFSTTPATPLTAGAEVQHLEMETRADDGTRHLTRSIRLG
FAGRLLVYKQTTLPAPLLGHAGSWALEPLPGGGTRVTARHRVALDPDAVTERFGAGTTLA
AARDTVRALLGGNSRRTLEAARAHTESAGER

>putative cyclase/dehydratase [aromatase]
ATGACCACCACCACGACCGGGCACCAGCGCCCCGGCTCCGCCGAACACTCCGCGCGCCTC
GCCGCCCCGCCCGCCTCCGCCTACGAACTCGTCGCCGACGTGACGCGCTGGCCCCTCCTC
TTCACCCCGTGCCTGCACGCCGAGGTGCTGGAGAGCGGTCCCGGCACCGAACGCGTGCGG
CTGTGGGCCCTCACCGGCGAGCAGGTGCGCGGCTGGACCTCGCGGCGCACCCTCGACAGC
GAGGGCCTGCGCGTCGGCTTCCGCCAGGAGGACAGCGCCCCGCCGCTCGCCGCGATGGGC
GGGGAGTGGCGCTTCACCGAGGAGGGCGAGGACACGCGCGCCGTACTCGCGCACGACTGG
ACGCTCACCGAGCCGGGCGCCGCACCGCACCGCTGGGTCACCGAGACACTCGACCGCAAC
AGCACCGCCGAGATCGGGGCCGTGACCGCCTGGGCCGCGCGCACCCACGCGGCGGGCGGC
GCCGACGCGCTGCTCTTCTCCTTCACCGACAGCCTCGACATCGCCGCCCCCGCGCCCGAC
GTGTACGCCTTCCTCGACGCCGCCGACCAGTGGCCCGCGCGGCTCCCGCACGTCAGCCGG
GTCGCCTTCTCGACCACCCCGGCGACGCCGCTCACGGCGGGCGCGGAGGTGCAGCACCTG
GAGATGGAGACGCGCGCGGACGACGGCACGCGCCACCTCACCCGCTCGATCCGCCTCGGC
TTCGCGGGCCGTCTCCTCGTCTACAAGCAGACCACGTTGCCCGCCCCGCTCCTCGGCCAC
GCCGGCTCCTGGGCGCTGGAGCCGCTGCCCGGCGGCGGCACCCGGGTCACCGCCCGCCAC
CGGGTGGCACTCGACCCGGACGCCGTGACCGAACGCTTCGGCGCGGGGACCACGCTCGCG
GCGGCGCGGGACACGGTACGGGCGCTGCTCGGCGGCAACAGCAGGCGCACCCTGGAGGCG
GCCCGCGCCCACACCGAGTCGGCGGGGGAGCGATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR005031 Streptomyces cyclase/dehydrase (Family) PF03364 Polyketide_cyc IPR019587 Polyketide cyclase/dehydrase (Family) PF10604 Polyketide_cyc2 IPR023393 START-like domain (Domain) G3DSA:3.30.530.20 G3DSA:3.30.530.20
SignalP	Eukaryota Bacteria, Gram-positive Bacteria, Gram-negative
TMHMM	No significant hit

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