Sch475_00430 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sp.
Strain	SCC-2136
Entry name	Sch 47554
Contig	AJ628018
Start / Stop / Direction	56,595 / 57,194 / + [in whole cluster] 56,595 / 57,194 / + [in contig]
Location	56595..57194 [in whole cluster] 56595..57194 [in contig]
Type	CDS
Length	600 bp (199 aa)

Annotation

Category	5.1 general function
Product	putative oxidoreductase
Product (GenBank)	hypothetical protein
Gene	schA22
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	schA22
Reference	ACC Q2HR15 PmId [17085966] Angucyclines Sch 47554 and Sch 47555 from Streptomyces sp. SCC-2136: cloning, sequencing, and characterization. (Mol Cells. , 2006) comment angucyclines Sch 47554 and Sch 47555の生合成に関連したentire gene clusterのクローニング、シークエンス、配列解析からの特徴づけ。 SchA22(199aa): Hypothetical protein 本文コメントなし。
Related Reference	ACC Q9ZGB0 NITE Lando_00300 PmId [15812784] Generation of novel landomycins M and O through targeted gene disruption. (Chembiochem. , 2005) [22454092] Elucidation of post-PKS tailoring steps involved in landomycin biosynthesis. (Org Biomol Chem. , 2012) comment Blast 31st, id53%, 1e-49 Streptomyces cyanogenus_lanZ4 Reductase homolog LanZ5とtwo-component monooxygenase systemを形成している。 monooxygenase_LanZ5にFMNH2を供給するNADPH-dependent FMN reductase. -- [PMID:15812784](2005) lanGT3, Z2, Z3, GT4, Z4, Z5にpolar effectが起きる株作成。この株は側鎖に2つの糖を含み、11-OHを欠くlandomycin F産生。この株をlanZ4 and lanZ5で補完すると11-OHのあるlandomycin D産生。 lanZ4 and lanZ5以外で補完するとlandomycins F, M, O(すべて11-OHなし)産生。 landomycin M and Oは6-OHも欠いているが、これはC-11 OH基欠損によるnegativeな影響の可能性あり。 -- [PMID: 22454092](2012) PKS後仕立て反応に関与するとされるLanM2, E, V, Z4, Z5に関する調査。 lanZ4 and lanZ5はlan clusterで翻訳共役。 LanZ4が還元したcofactorをLanZ5が利用する共依存であると仮定。 S. lividans TK64においてminimal PKSと共にgenesを発現して産物解析。 minimal PKS + lanZ4 + lanZ5 → UWM6(PKSのみと同じ）よってPKSの直後の反応ではない。各genesをE.coliで発現、精製して活性測定。 FMN and NADPHがLanZ4の自然な基質であることを確認。 LanZ4 and LanZ5は、 tetrangomycin → 11-hydroxytetrangomycin(shunt産物) また、LanZ4 and LanZ5は急速に 11-deoxylandomycinone → tetrangulol + anhydrolandomycinone(少量) の変換をするが、LanZ5のみだとゆっくりになり、 11-deoxylandomycinone → tetrangulolのみよって、LanZ5は11-deoxylandomycinoneをhydroxylateするのを好まない。ここで見られる5,6-dehydrationは副反応で、糖残基がないときにのみ起こる。 "combinatorial biosynthetic enzymology"において、UWM6もrabelomycinもlandomycin生合成経路の中間体ではないこと、prejadomycinが landomycin生合成の一般的な経路中間体であることを確認。結果を総合して改訂経路を提唱。 LanGT2による最初のglycosylationの後に、LanZ5はLanZ4によって還元されたFMNを使って優先的に11- hydroxylationする。それから順々にglycosylationして、landomycin Aのようなlandomycinone骨格を持ったlandomycinsを形成する。副反応の5,6-dehydrationにより、landomycin副産物が産生される。 --- 同じlan cluster geneであるlanOのほうが上位(Blast 14th, id54%, 3e-54)にhitしているが、機能は実験確認されていない。
	ACC Q6T1C6 PmId [15123249] Generation of new landomycins by combinatorial biosynthetic manipulation of the LndGT4 gene of the landomycin E cluster in S. globisporus. (Chem Biol. , 2004) comment Blast 33rd, id51%, 5e-48 Streptomyces globisporus Putative reductase LndZ4 landomycin E産生株Streptomyces globisporus 1912にあるhomologue LndZ4/LndZ5における[PMID:15812784]と同様の実験報告。
	ACC Q07923 PmId [15184374] Crystal structure and functional characterization of yeast YLR011wp, an enzyme with NAD(P)H-FMN and ferric iron reductase activities. (J Biol Chem. , 2004) comment Blast 341st, id31%, 7e-11, gapあり Saccharomyces cerevisiae_LOT6 NAD(P)H-dependent FMN reductase LOT6(EC 1.5.1.29) FMN binding site保存あり(2/2) function; Has several reductase activities that are NAD(P)H-dependent and involve FMN as a cofactor, ferricyanide being the best substrate for reduction. May be involved in ferric iron assimilation.

Sequence

>putative oxidoreductase [hypothetical protein]
MSDLNDSPLQVAALVGSTRGGRFGPVVADWLLSQIAQRKDMEVDLVDLVETPLPTVMPAF
GEQLPDEDMALLGAVAPRMESADAFIIITPEYNHSYPAALKNAIDWHNPQWHAKPVAFVS
YGGISGGLRAVEHLRLVLAELNAMTIRNTVSFHNYGDKFDSDGKPLDPDCDVAAKALLDQ
LAWWGEALRDARTARPYTG

>putative oxidoreductase [hypothetical protein]
ATGAGTGACCTGAACGACAGCCCTCTGCAGGTGGCGGCCCTCGTCGGCAGCACGAGGGGC
GGACGCTTCGGTCCGGTCGTGGCCGACTGGCTGCTGAGCCAGATCGCCCAGCGCAAGGAC
ATGGAGGTCGACCTCGTCGACCTGGTCGAGACGCCCCTGCCGACCGTCATGCCGGCTTTC
GGGGAGCAACTTCCGGACGAGGACATGGCTCTGCTAGGCGCGGTCGCCCCGCGCATGGAG
TCGGCCGACGCCTTCATCATCATCACGCCGGAGTACAACCACAGTTATCCGGCGGCCCTG
AAGAACGCGATCGACTGGCACAACCCGCAGTGGCACGCCAAGCCCGTCGCCTTCGTCTCC
TACGGCGGCATCTCCGGCGGCCTGCGCGCCGTCGAGCACCTGCGGCTGGTCCTCGCCGAG
CTGAACGCCATGACGATCCGCAACACCGTCAGCTTCCACAACTACGGCGACAAGTTCGAC
TCGGACGGCAAGCCCCTCGACCCGGACTGTGACGTCGCGGCCAAGGCCCTGCTCGACCAA
CTGGCCTGGTGGGGAGAGGCGCTTCGGGACGCCCGCACCGCTCGTCCGTACACCGGCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR005025 NADPH-dependent FMN reductase (Domain) PF03358 FMN_red
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Sch475_00420 Sch475_00440