Teicp2_00450 : CDS information

Location

Organism	Actinoplanes teichomyceticus
Strain	ATCC 31121 (=NBRC 13999)
Entry name	Teicoplanin
Contig	AJ605139
Start / Stop / Direction	79,108 / 80,205 / + [in whole cluster] 79,108 / 80,205 / + [in contig]
Location	79108..80205 [in whole cluster] 79108..80205 [in contig]
Type	CDS
Length	1,098 bp (365 aa)

Annotation

Category	2.1 modification addition of extender units
Product	putative aminotransferase
Product (GenBank)	HpgT aminotransferase
Gene	tcp36 hpgT
Gene (GenBank)	tcp36
EC number	2.6.1.-
Keyword	Hpg Dpg
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q70AX2 PmId [14702401] Organization of the teicoplanin gene cluster in Actinoplanes teichomyceticus. (Microbiology. , 2004) comment ATCC 31121株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。 tcp ORF36: Aminotransferase HpgT 配列解析のみ。ORF36は、p-hydroxyphenylglyoxylate and 3,5-dihydroxyphenylglyoxylateにアミノ基を移してp-hydroxyphenylglycine (HPG) and dihydroxyphenylglycine (DPG)にするTyr-dependent aminotransferase HpgTをコードする。
Related Reference	ACC Q6ZZH0 NITE Teicp_00380 PmId [15113000] Biosynthetic gene cluster of the glycopeptide antibiotic teicoplanin: characterization of two glycosyltransferases and the key acyltransferase. (Chem Biol. , 2004) comment DSM 43866株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。 tei orf23: HpgT 配列解析のみ。 (S)-4-hydroxyphenylglycine (Hpg)合成を触媒する4つの酵素のうちのひとつ。Orf23 (HpgT, a pyridoxal phosphate-dependent transaminase) はamino donorとしてTyrを使用し、4-hydroxyphenylglyoxylateにアミノ基を移してHpgを産生する。また、3,5-dihydroxyphenylglycine (Dpg)の合成にも関与する。 Hpg, Dpgどちらの合成でも最後のstepとして割り当てられている。
	ACC O52815 NITE Chlor_00180 PmId [11137816] Biosynthesis of L-p-hydroxyphenylglycine, a non-proteinogenic amino acid constituent of peptide antibiotics. (Chem Biol. , 2000) comment BLAST id45%, C末余る Amycolatopsis orientalis PCZA361.25 --- [PMID: 11137816](2000) L-p-hydroxyphenylglycine(Hpg)はvancomycinグループの抗生物質のaglyconeで構造的役割をする。L-Hpgを生合成する経路に提唱された酵素の特徴づけを、chloroeremomycin生合成gene clusterのタンパクで確認している。 ORF17は多くのamino acid transaminasesに配列相同性があるので、p-hydroxybenzoylformate → L-Hpgへの変換を触媒するp-hydroxyphenylglycine transaminase (HpgT)であると仮定。 ORF17はHmoと同様にN末maltose binding protein(MBP) fusion proteinとして発現、精製し、補酵素PLPと共にアッセイに使用した。まず、HpgTにより L-Hpg + p-hydroxyphenylpyruvate → p-hydroxybenzoylformate + tyrosine をもたらす逆方向反応が実証された。次に順方向が検討され、p-hydroxymandelate(Hmo基質), L-tyrosine, Hmo, HpgTでの反応で、p-hydroxybenzoylformate(Hmo産物) と L-Hpgが形成された。また、HmaS基質であるp-hydroxybenzoylformateがHpgTの反応に関与することから、HmaS, Hmo, HpgTの3酵素による触媒サイクルが確立された。その他のアミノ供与体またはアミノ受容体で、HpgTの基質特異性が検討されている。3-Cl-L-tyrosineもアミノ供与体として受け入れられる。 prephenate ↓　prephenate dehydrogenase (ORF1) p-hydroxyphenylpyruvate ↓　4-hydroxymandelate synthase (ORF21, HmaS) L-p-hydroxymandelate ↓　p-hydroxymandelate oxidase (ORF22, Hmo) p-hydroxybenzoylformate ↓　L-p-hydroxyphenylglycine transaminase (ORF17, HpgT) + L-Tyr L-p-hydroxyphenylglycine + p-hydroxyphenylpyruvate --- [PMIDなし]Biosynthesis of the di-meta-hydroxyphenylglycine constituent of the vancomycin-group antibiotic chloroeremomycin. Chemical Communications(2001) 発現、精製してN末His-tag付きタンパクとして得たHpgT(ORF17)を L-di-meta-hydroxyphenylglycine (L-DHPG)、PLPなどと反応させると、di-meta-hydroxyphenylglyoxylic acidがもたらされた。この結果から、HpgTは既に報告されたp-hydroxyphenylglycine生合成での役割に加えて、L-DHPGへのアミノ基転移も担うことが示される。 --- （参照）Dpg(L-DHPG)生合成に関する論文で提唱されている経路は、 malonyl-CoA ×4 ↓ type III PKS DpgA 3,5-dihydroxyphenylacetyl-CoA precursor ↓ dehydratases DpgB/D 3,5-dihydroxyphenylacetyl-CoA(DPA-CoA) ↓ dioxygenase DpgC 3,5-dihydroxyphenylglyoxylate(DPGx) ↓ aminotransferase DpgT(HpgT/Pgat) Dpg
	ACC Q939Y4 NITE Balhi_00210 PmId [11495926] A polyketide synthase in glycopeptide biosynthesis: the biosynthesis of the non-proteinogenic amino acid (S)-3,5-dihydroxyphenylglycine. (J Biol Chem. , 2001) comment BLAST id46%, C末余る Amycolatopsis balhimycina_pgat Phenylglycine amino transferase balhimycinのaglycone構成アミノ酸(S)-3,5-dihydroxyphenylglycine(Dpg)の生合成についての報告。 DpgA, DpgB, DpgC, and DpgDによって産生される3,5-dihydroxyphenylglyoxylic acidにアミノ基を転移してDpgをもたらすtransaminase geneとしてpgatを調査。pgatは、chloroeremomycin生合成gene clusterの4-hydroxyphenylglycine (Hpg) aminotransferase gene hpgTに相当する。 in-frame deletionでPgatを不活化したmutant株JR1は、抗菌活性のある化合物を産生せず、3,5-dihydroxyphenylglyoxylic acidをwild株の10倍多く蓄積した。よってPgatはDpg生合成に関与する。また、mutant株JR1はHpg と Dpgの両方の補充でのみbalhimycin産生を回復したので、Hpg と Dpgの生合成に関与する二重機能が想定される。

Sequence

>putative aminotransferase [HpgT aminotransferase]
MESSALRKSELHPSISDPVLDTMNFLNEVTLRYPEAISFAPGRPYDGFFQTEEVLAHLRR
FLDHLADQGASPAQVRTAVYQYGPTAGQIREIIADSLRRDEGIDVPAESIVVTVGAQEAM
MLVVRALIRDPRDVLLVPSPCYVGITGVARLLDVTLGPVPESPDGFSLENVAAAIRAQRA
AGRRPRAFYLVPDHANPSGTTLSESDRAGLLHLAAKEDLLILEDTPYRLVSPGEPVRTLK
ALDRRRSVVHLGSYSKTIFPGARVGFAVADQTVVGDDGRTGLLADELSKIKSMVTVNTSS
LSQAVVAGALLAAGGRVSELNAKAAGHYGDAMRRVLDRLADRLPAARRAELGARIRTDEA
GTTGA

>putative aminotransferase [HpgT aminotransferase]
GTGGAATCGTCTGCGCTGCGCAAGTCGGAATTGCATCCGAGCATTTCGGACCCGGTTCTG
GACACGATGAATTTCCTCAACGAGGTGACCCTGCGCTATCCCGAGGCGATCTCGTTCGCG
CCGGGCCGCCCGTACGACGGCTTCTTCCAGACCGAGGAGGTCCTCGCCCACCTGCGCCGC
TTTCTCGACCACCTGGCCGACCAGGGCGCCTCGCCCGCGCAGGTGCGCACGGCGGTCTAC
CAGTACGGCCCGACCGCCGGCCAGATCCGCGAGATCATCGCCGACTCGCTGCGCCGGGAC
GAGGGGATCGACGTGCCGGCCGAGTCCATCGTGGTCACCGTCGGCGCGCAGGAGGCGATG
ATGCTGGTCGTCCGCGCGCTGATCCGTGACCCGCGGGACGTGCTGCTGGTGCCCAGCCCC
TGCTACGTGGGCATCACCGGGGTGGCCCGGCTGCTCGACGTGACGCTCGGCCCGGTGCCC
GAGTCGCCGGACGGCTTCTCCCTGGAGAACGTGGCGGCGGCGATCCGGGCGCAGCGGGCC
GCCGGGCGCCGGCCGCGAGCCTTCTACCTGGTGCCCGACCACGCCAACCCGTCCGGCACC
ACGCTGTCCGAGTCGGACCGGGCCGGGTTGCTGCACCTGGCCGCGAAGGAGGATCTGCTG
ATCCTGGAGGACACCCCGTACCGGCTGGTCAGCCCCGGCGAGCCGGTGCGCACGCTGAAG
GCGCTGGACCGCCGCCGCTCGGTGGTGCACCTGGGGTCGTACTCAAAAACGATCTTTCCG
GGCGCGCGGGTGGGCTTCGCCGTGGCCGACCAGACGGTGGTCGGCGACGACGGCCGGACC
GGCCTGCTCGCCGACGAGCTCTCGAAGATCAAGAGCATGGTGACGGTCAACACCTCGTCG
CTGAGCCAGGCGGTGGTGGCCGGCGCGCTGCTCGCGGCCGGCGGCCGGGTCTCCGAGCTG
AACGCCAAGGCGGCCGGGCACTACGGCGACGCCATGCGCCGGGTGCTCGACCGGCTCGCC
GACCGGTTGCCCGCGGCGCGGCGCGCGGAGCTGGGCGCGCGGATCCGTACCGACGAGGCG
GGGACGACGGGCGCGTAA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR004839 Aminotransferase, class I/classII (Domain) PF00155 Aminotran_1_2 IPR015421 Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (Domain) G3DSA:3.40.640.10 PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub1 IPR015424 Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (Domain) SSF53383 PyrdxlP-dep_Trfase_major
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Teicp2_00440 Teicp2_00460