Asco_00070 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces hygroscopicus subsp. ascomyceticus
Strain	ATCC 14891 (=NBRC 13981)
Entry name	Ascomycin
Contig	AF235504
Start / Stop / Direction	8,156 / 8,824 / + [in whole cluster] 8,156 / 8,824 / + [in contig]
Location	8156..8824 [in whole cluster] 8156..8824 [in contig]
Type	CDS
Length	669 bp (222 aa)

Annotation

Category	2.1 modification addition of extender units
Product	putative O-methyltransferase
Product (GenBank)	FkbG
Gene
Gene (GenBank)	fkbG
EC number	2.1.1.-
Keyword	methoxymalonyl-ACP
Note
Note (GenBank)	O-methyl transferase
Reference	ACC Q9KIE7 PmId [10863099] The FK520 gene cluster of Streptomyces hygroscopicus var. ascomyceticus (ATCC 14891) contains genes for biosynthesis of unusual polyketide extender units. (Gene. , 2000) [15179529] Engineered biosynthesis of 16-membered macrolides that require methoxymalonyl-ACP precursors in Streptomyces fradiae. (Appl Microbiol Biotechnol. , 2004) comment [PMID:10863099](2000) FK520 gene clusterの報告。 fkbG: hydroxymalonyl-ACP methylation methoxymalonyl-ACP合成に関与すると相同性などから提唱している。 hydroxymalonyl-ACP→methoxymalonyl-ACP best homologyは高等植物のcaffeoyl-CoA O-methyltransferaseに対してであり、これはFkbGの基質がacyl thioester化合物であるという考えを支持する。 --- [PMID:15179529](2004) S.hygroscopicus由来fkbG-Kを導入することにより、S. fradiaeはmalonyl-CoA, methylmalonyl-CoA, ethylmalonyl-CoAに加えてmethoxymalonyl-ACPもPKS前駆体として利用できるようになることを、midecamycin PKS genes（最後から2番目の縮合ステップでmethoxymalonateを要求）の異種性発現産物で確認している。
Related Reference	ACC Q8KUG5 NITE Ansam_00190 PmId [11996558] Functional expression of genes involved in the biosynthesis of the novel polyketide chain extension unit, methoxymalonyl-acyl carrier protein, and engineered biosynthesis of 2-desmethyl-2-methoxy-6-deoxyerythronolide B. (J Am Chem Soc. , 2002) comment 42nd(Q8KUG5) 60%, 1e-47 Actinosynnema pretiosum subsp. auranticum_asm17 O-methyltransferase S. lividansで、AT domainsのひとつがmethoxymalonateに特異的なATで置換されているerythromycin PKSのカセットとasm13-17を同時発現すると、予測された位置にmethoxymalonateが取り込まれた6-deoxyerythronolide Bの派生体が産生された。よって、asm13-17はmethoxymalonyl-ACP生合成に十分である。また、methyltransferaseをコードするasm17を削除すると、そのhydroxy類似体ではなく6-deoxyerythronolide Bが得られたので、伸長unitのmethylationはその取り込みのために必要である。
Related Reference	ACC P28034 PmId [1894629] Molecular cloning, induction and taxonomic distribution of caffeoyl-CoA 3-O-methyltransferase, an enzyme involved in disease resistance. (J Biol Chem. , 1991) [9037150] Structure of the parsley caffeoyl-CoA O-methyltransferase gene, harbouring a novel elicitor responsive cis-acting element. (Plant Mol Biol. , 1997) comment 163rd(P28034) 41%, 8e-32 Petroselinum crispum (Parsley)(パセリ) Caffeoyl-CoA O-methyltransferase(EC 2.1.1.104) caffeoyl-CoA-specific 3-O-methyltransferaseの活性測定あり。

Sequence

>putative O-methyltransferase [FkbG]
MANQITLSDTLLAYVRKVSLRDDEVLSRLRAQTAELPGGGVLPVQAEEGQFLEFLVRLTG
ARQVLEIGTYTGYSTLCLARGLAPGGRVVTCDVMPKWPEVGERYWEEAGVADRIDVRIGD
ARTVLTGLLDEAGAGPESFDMVFIDADKAGYPAYYEAALPLVRRGGLIVVDNTLFFGRVA
DEAVQDPDTVAVRELNAALRDDDRVDLAMLTTADGVTLLRKR

>putative O-methyltransferase [FkbG]
ATGGCTAATCAGATAACCCTGTCCGACACGCTGCTCGCTTACGTACGGAAGGTGTCCCTG
CGCGATGACGAGGTGCTGAGCCGGCTGCGCGCGCAGACGGCCGAGCTGCCGGGCGGTGGC
GTACTGCCGGTGCAGGCCGAGGAGGGACAGTTCCTCGAGTTCCTGGTGCGGTTGACCGGC
GCGCGTCAGGTGCTGGAGATCGGGACGTACACCGGCTACAGCACGCTCTGCCTGGCCCGC
GGATTGGCGCCCGGGGGCCGTGTGGTGACGTGCGATGTCATGCCGAAGTGGCCCGAGGTG
GGCGAGCGGTACTGGGAGGAGGCCGGGGTTGCCGACCGGATCGACGTCCGGATCGGCGAC
GCCCGGACCGTCCTCACCGGGCTGCTCGACGAGGCGGGCGCGGGGCCGGAGTCGTTCGAC
ATGGTGTTCATCGACGCCGACAAGGCCGGCTACCCCGCCTACTACGAGGCGGCGCTGCCG
CTGGTACGCCGCGGCGGGCTGATCGTCGTCGACAACACGCTGTTCTTCGGCCGGGTGGCC
GACGAAGCGGTGCAGGACCCGGACACGGTCGCGGTACGCGAACTCAACGCGGCACTGCGC
GACGACGACCGGGTGGACCTGGCGATGCTGACGACGGCCGACGGCGTCACCCTGCTGCGG
AAACGGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR002935 O-methyltransferase, family 3 (Family) PF01596 Methyltransf_3
SignalP	Bacteria, Gram-negative Eukaryota
TMHMM	No significant hit

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