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Aureo_00030 : CDS information

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Organism
StrainHKI-227
Entry nameAureothin
Contig
Start / Stop / Direction4,858 / 5,868 / + [in whole cluster]
4,858 / 5,868 / + [in contig]
Location4858..5868 [in whole cluster]
4858..5868 [in contig]
TypeCDS
Length1,011 bp (336 aa)
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Category2.2 modification addition of starter unit
Productpara-aminobenzoate N-oxygenase
Product (GenBank)putative N-oxidase
Gene
Gene (GenBank)aurF
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[14700630] Iteration as programmed event during polyketide assembly; molecular analysis of the aureothin biosynthesis gene cluster. (Chem Biol. , 2003)
[15038705] Biosynthetic origin of the rare nitroaryl moiety of the polyketide antibiotic aureothin: involvement of an unprecedented N-oxygenase. (J Am Chem Soc. , 2004)
[18458342] In vitro reconstitution and crystal structure of p-aminobenzoate N-oxygenase (AurF) involved in aureothin biosynthesis. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2008)
[20798054] Four-electron oxidation of p-hydroxylaminobenzoate to p-nitrobenzoate by a peroxodiferric complex in AurF from Streptomyces thioluteus. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2010)
[21678538] A ribonucleotide reductase-like electron transfer system in the nitroaryl-forming N-oxygenase AurF. (Chembiochem. , 2011)
[24973817] Characterization of the N-oxygenase AurF from Streptomyces thioletus. (Bioorg Med Chem. , 2014)
[26588098] Computational Examination on the Active Site Structure of a (Peroxo)diiron(III) Intermediate in the Amine Oxygenase AurF. (Inorg Chem. , 2015)
comment
[PMID: 14700630](2003)
aureothin生合成gene clusterの同定論文。

AurF: amine oxidase

AurFは既知のタンパクやmotifとの相同性はないが、S.lividans ZX1における異種性発現によってaureothin生合成に関与するN-oxidaseであることが確かめられた(unpublished data)。

--
そのunpublished dataの報告
[PMID: 15038705](2004) abstract
クローニング、異種性発現、不活化実験により、N-oxugenease AurFがp-aminobenzoate(PABA)→p-nitrobenzoate(PNBA)への合成を担うことが明らかになった。
また、ラベリング実験により、PNBAがPKS starter unitであることも示されている。

--
その後、di-iron enzymeであるという報告、di-manganese enzymeであるという報告、両者の矛盾をとりなすようなheterodinuclear Mn/Fe cofactorを含むという提唱もある。

これらをふまえて検討した[PMID: 18458342](2008)では、
AurFはnon-heme di-iron monooxygenaseであり、hydroxylamineとnitroso intermediatesを介して、aminoarenes→nitroarenesへの連続的酸化を触媒する、としている。

(Q70KH9)に登録されているが、ATCC12310で実験している可能性あり。

--
メカニズムに関して続報あり。
Bollinger JM Jr.らによる[PMID:20798054](2010)、aur clusterを同定したHertweck C.らによる[PMID:21678538](2011)など。

---
[PMID: 24973817](2014)
クローニングで使用したplasmidはPMID: 18458342などと同一とのことなので、S. thioletus → S. thioluteus の間違いと思われる。

最適条件下でのAurFの特徴づけ。最適pHは5.5と珍しく低い。
active siteや基質特異性の調査、構造モデリングもしている。

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selected fasta
>para-aminobenzoate N-oxygenase [putative N-oxidase]
MREEQPHLATTWAARGWVEEEGIGSATLGRLVRAWPRRAAVVNKADILDEWADYDTLVPD
YPLEIVPFAEHPLFLAAEPHQRQRVLTGMWIGYNERVIATEQLIAEPAFDLVMHGVFPGS
DDPLIRKSVQQAIVDESFHTYMHMLAIDRTRELRKISERPPQPELVTYRRLRRVLADMPE
QWERDIAVLVWGAVAETCINALLALLARDATIQPMHSLITTLHLRDETAHGSIVVEVVRE
LYARMNEQQRRALVRCLPIALEAFAEQDLSALLLELNAAGIRGAEEIVGDLRSTAGGTRL
VRDFSGARKMVEQLGLDDAVDFDFPERPDWSPHTPR
selected fasta
>para-aminobenzoate N-oxygenase [putative N-oxidase]
ATGCGAGAAGAGCAGCCGCACTTGGCAACCACCTGGGCCGCCCGGGGGTGGGTCGAGGAG
GAGGGCATCGGCAGCGCGACCCTGGGCCGGCTGGTGCGCGCCTGGCCACGCCGCGCGGCG
GTGGTCAACAAGGCGGACATCCTGGACGAGTGGGCCGACTACGACACGCTCGTCCCCGAC
TACCCGCTGGAGATCGTGCCGTTCGCCGAGCACCCCCTGTTCCTCGCGGCCGAACCGCAC
CAGCGGCAGCGCGTGTTGACCGGGATGTGGATCGGCTACAACGAGCGCGTCATCGCCACC
GAGCAGCTCATCGCCGAGCCCGCCTTCGACCTCGTGATGCACGGCGTGTTCCCGGGCAGC
GACGACCCGCTCATCCGCAAGAGCGTGCAGCAGGCCATCGTGGACGAGAGCTTCCACACC
TATATGCACATGCTCGCCATCGACCGCACCCGCGAGCTGCGCAAGATCAGCGAACGGCCG
CCGCAGCCCGAACTCGTCACCTACCGGCGGCTGCGCCGGGTCCTGGCGGACATGCCCGAG
CAGTGGGAGCGGGACATCGCCGTCCTCGTCTGGGGCGCGGTGGCCGAGACCTGCATCAAC
GCCCTGCTGGCGCTGCTGGCCCGGGACGCGACCATCCAGCCCATGCACTCCCTGATCACC
ACCCTGCACCTGCGGGACGAGACGGCGCACGGCTCGATCGTCGTCGAGGTCGTCCGCGAG
CTGTACGCCCGGATGAACGAGCAGCAGCGCCGCGCCCTCGTCCGGTGCCTGCCGATCGCG
CTGGAGGCGTTCGCCGAACAGGACCTGTCCGCGCTGCTCCTCGAACTGAACGCGGCGGGC
ATCCGCGGCGCCGAGGAGATCGTGGGGGACCTGCGGTCGACGGCCGGCGGAACGCGGCTC
GTCCGCGACTTCTCCGGCGCCCGGAAGATGGTCGAGCAGCTCGGCCTGGACGACGCCGTC
GACTTCGACTTCCCGGAGCGGCCCGACTGGTCGCCCCACACGCCGCGTTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR025859 P-aminobenzoate N-oxygenase AurF (Family)
[24-316] 1.39999999999997e-83 PF11583
PF11583   AurF
SignalP
[1-34] 0.112 Signal
Eukaryota   
TMHMM No significant hit
Aureo_00020 Aureo_00020   Aureo_00040 Aureo_00040
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