Pyolu_00090 Pyolu_00090   Pyolu_00110 Pyolu_00110

Pyolu_00100 : CDS information

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Organism
StrainPf-5
Entry namePyoluteorin
Contig
Start / Stop / Direction21,917 / 22,699 / + [in whole cluster]
21,917 / 22,699 / + [in contig]
Location21917..22699 [in whole cluster]
21917..22699 [in contig]
TypeCDS
Length783 bp (260 aa)
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Category1.4 Other
Productputative thioesterase
Product (GenBank)putative thioesterase
Gene
Gene (GenBank)pltG
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
  • PltG
Reference
ACC
PmId
[10094695] Characterization of the pyoluteorin biosynthetic gene cluster of Pseudomonas fluorescens Pf-5. (J Bacteriol. , 1999)
comment
pyoluteorin生合成clusterの5'側 pltM-pltGについての論文
pltG: thioesterase @ termination of resorcinol synthesis

pltGによってコードされるputative thioesteraseはたぶんpolyketide組み立ての終結を担う。
PltG内に同定されたthioesteraseに特徴的なmotifは、十分に延伸されたpolyketide基質とPltCのACP domainの間に形成されたthioesterを加水分解することが予測される。
しかしpyoluteorin合成gene clusterの外側境界を同定できていないので、他に候補があるのかもしれない。
Related Reference
ACC
Q6W5Q5
NITE
FR008_00110
PmId
[18836004] Selective removal of aberrant extender units by a type II thioesterase for efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. strain FR-008. (Appl Environ Microbiol. , 2008)
comment
192nd(Q6W5Q5) 34%, 6e-28
Streptomyces sp. FR-008_fscTE
FscTE
[FR008_00110]type II thioesterase

fscTEはputative type II thioesterase (TEII)をコードする。
fscTE deletionでFR-008/candicidin産生は約90%減。
type I thioesteraseを不活化させたとき、FscTEは成熟伸長したpolyketideの放出を代償することができなかった。

FscTE and TylOのHydrolytic activitiesは、
propionyl-S-N-acetylcysteamine > methylmalonyl-S-N-acetylcysteamine
acetyl-S-N-acetylcysteamine > malonyl-S-N-acetylcysteamine

したがって、TEII はacyl carrier proteins(ACP)に結合するnon-elongatable residuesを選択的に除去することにより、効果的なpolyketide生合成を維持することが結論付けられる。

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selected fasta
>putative thioesterase [putative thioesterase]
MGTPSRVAKDAWFPYASRPRGKMRLFTFPYAGSGASVFHRWFLPLYDQVDLYALQLPGRE
GRSQEACYSDMQAAANDVADCLEQFGDDIPCCFFGHSMGALLAFAVAGVLQERRLPMPQQ
LMLSGMVAPHVRQRVAPLHQLPAEQAIAALQAMGGVPAVVLAEEDLMQMYLPIIQADIQM
VYSYAGAQPQPLDTRMICLSGAQDLIAPPAQMQQWRRYTLGGFEQFVFAGGHFFLDAQVM
SRVKTVLGSALHNQPGSLAV
selected fasta
>putative thioesterase [putative thioesterase]
ATGGGAACTCCATCACGCGTGGCCAAGGACGCCTGGTTTCCCTATGCCAGCCGGCCTCGG
GGCAAGATGCGCCTGTTCACCTTTCCCTATGCCGGGAGTGGGGCCTCGGTCTTTCATCGC
TGGTTCCTGCCCCTGTACGACCAGGTCGACCTGTATGCCTTGCAGTTGCCGGGCCGCGAG
GGTCGCAGCCAGGAGGCCTGCTACAGCGACATGCAGGCGGCGGCCAATGACGTGGCCGAC
TGCCTGGAGCAGTTTGGCGATGACATCCCCTGCTGTTTCTTCGGCCACAGCATGGGCGCC
TTGCTGGCCTTTGCGGTCGCCGGTGTGCTGCAGGAGCGGCGGTTGCCGATGCCGCAGCAA
CTGATGCTCTCGGGCATGGTTGCGCCCCATGTGCGGCAACGGGTAGCACCGCTGCACCAG
CTGCCGGCAGAGCAGGCCATCGCCGCGCTGCAGGCCATGGGGGGCGTGCCGGCGGTGGTG
CTGGCCGAGGAGGACCTGATGCAGATGTACCTGCCCATCATTCAGGCCGACATACAGATG
GTCTACTCCTACGCCGGTGCCCAGCCGCAGCCGCTGGACACCCGCATGATCTGCCTGAGC
GGCGCCCAGGACCTGATTGCGCCGCCTGCGCAGATGCAGCAGTGGCGGCGCTACACCCTG
GGCGGCTTCGAGCAGTTCGTGTTTGCCGGTGGCCATTTCTTTCTCGACGCCCAGGTCATG
TCGCGGGTCAAAACAGTGCTGGGCAGCGCCCTGCACAATCAGCCTGGCAGTCTGGCGGTG
TGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001031 Thioesterase (Domain)
[24-239] 8.1e-37 PF00975
PF00975   Thioesterase
IPR020802 Polyketide synthase, thioesterase domain (Domain)
[26-247] 0.0057 SM00824
SM00824   Thioesterase
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Pyolu_00090 Pyolu_00090   Pyolu_00110 Pyolu_00110
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