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Spino_00060 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 18538
Entry nameSpinosyn
Contig
Start / Stop / Direction7,083 / 8,450 / + [in whole cluster]
7,083 / 8,450 / + [in contig]
Location7083..8450 [in whole cluster]
7083..8450 [in contig]
TypeCDS
Length1,368 bp (455 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
Productglycosyltransferase
Product (GenBank)probable NDP-forosamyltransferase
Gene
Gene (GenBank)spnP
EC number
Keyword
  • D-forosamine
Note
Note (GenBank)
  • involved in forosamine addition
Reference
ACC
PmId
[11358695] Cloning and analysis of the spinosad biosynthetic gene cluster of Saccharopolyspora spinosa. (Chem Biol. , 2001)
[11386361] A cluster of genes for the biosynthesis of spinosyns, novel macrolide insect control agents produced by Saccharopolyspora spinosa. (Antonie Van Leeuwenhoek. , 2000)
[12120151] Engineered biosynthesis of novel spinosyns bearing altered deoxyhexose substituents. (Chem Commun (Camb). , 2002)
[19343260] Glycosylation engineering of spinosyn analogues containing an L-olivose moiety. (Org Biomol Chem. , 2009)
[24945604] Structural studies of the spinosyn forosaminyltransferase, SpnP. (Biochemistry. , 2014)
comment
[PMID:11358695](2001)
spinosad biosynthetic gene clusterの報告。
spnP(456aa): forosamyltransferase

spnP mutantではSpinosadを産生せず、forosamineが付加されていないpseudoaglyconeを産生する。
Feeding実験では、spnP mutantにaglyconeを添加するとrhamnoseを付加したpseudoaglyconeまでを合成する。

---
[PMID:11386361](2000)
同じ著者らの先行論文。
spnP: Forosamine attachment

---
[PMID: 12120151](2002)
[PMID: 19343260](2009)
遺伝子操作したSaccharopolyspora erythraeaをホストとして、spinosyn誘導体を作成。SpnPをglycosyltransferaseとして発現すると、forosamineの代わりにmycarose(PMID: 12120151), olivose(PMID: 19343260)が付加されたspinosyn誘導体が合成された。

---
[PMID: 24945604](2014)
S. spinosa NRRL 18537のspnPを、クローニング、発現、精製、結晶構造解析、reverse glycosyltransfer assayしている。配列alignmentで用いられているSpnPはAAG23277であり、このentryに一致する。

配列解析でSpnPは活性化のために補助タンパクを必要とするglycosyltransferasesに属することがわかったが、cluster内に補助タンパクのputative geneは見られない。

SpnPは単独で測定可能な活性があることが確認されたが、配列と構造からは補助タンパクによって促進されると示唆される。

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selected fasta
>glycosyltransferase [probable NDP-forosamyltransferase]
MILGMLPGCSIAIGEFMRVLFTPLPASSHFFNLVPLAWALRAAGHEVRVAICPNMVSMVT
GAGLTAVPVGDELDLISLAAKNELVLGSGVSFDEKGRHPELFDELLSINSGRDTDAVEQL
HLVDDRSLDDLMGFAEKWQPDLVVWDAMVCSGPVVARALGARHVRMLVALDVSGWLRSGF
LEYQESKPPEQRVDPLGTWLGAKLAKFGATFDEEIVTGQATIDPIPSWMRLPVDLDYISM
RFVPYNGPAVLPEWLRERPTKPRVCITRGLTKRRLSRVTEQYGEQSDQEQAMVERLLRGA
ARLDVEVIATLSDDEVREMGELPSNVRVHEYVPLNELLESCSVIIHHGSTTTQETATVNG
VPQLILPGTFWDESRRAELLADRGAGLVLDPATFTEDDVRGQLARLLDEPSFAANAALIR
REIEESPSPHDIVPRLEKLVAERENRRTGQSDGHP
selected fasta
>glycosyltransferase [probable NDP-forosamyltransferase]
GTGATTCTTGGCATGCTTCCCGGGTGTTCAATTGCGATCGGAGAGTTCATGCGTGTCCTG
TTCACCCCGCTGCCGGCGAGTTCGCACTTCTTCAACCTGGTGCCGTTGGCGTGGGCGTTG
CGTGCCGCGGGGCACGAGGTCCGTGTCGCCATCTGCCCGAATATGGTGTCGATGGTCACC
GGAGCAGGACTCACCGCGGTTCCCGTCGGCGACGAGCTCGACCTCATCTCCTTGGCGGCC
AAGAACGAACTCGTTCTCGGCAGCGGGGTCTCGTTCGACGAGAAGGGGCGGCATCCGGAA
CTCTTCGACGAGCTGCTGTCAATCAACTCCGGCAGAGACACGGACGCCGTGGAGCAACTC
CACCTTGTGGATGACCGATCGCTGGACGATCTCATGGGGTTCGCCGAGAAATGGCAGCCT
GATCTCGTTGTGTGGGACGCTATGGTGTGTTCGGGGCCAGTTGTGGCGCGAGCGCTCGGC
GCACGACACGTGCGGATGCTCGTCGCCCTCGATGTGTCGGGGTGGCTGCGGTCCGGTTTC
CTCGAATACCAGGAATCGAAGCCGCCTGAGCAGCGCGTCGACCCGCTCGGGACGTGGCTG
GGAGCGAAGCTCGCCAAGTTCGGAGCCACGTTCGATGAAGAGATCGTGACGGGCCAAGCG
ACCATAGATCCGATTCCATCCTGGATGCGCCTGCCTGTGGACTTGGACTACATCTCGATG
CGTTTCGTGCCGTACAACGGTCCGGCGGTGTTGCCGGAGTGGTTGCGCGAACGACCGACG
AAGCCGCGCGTCTGCATCACGCGCGGGCTGACCAAGCGGCGGCTGAGCAGGGTGACCGAA
CAGTACGGGGAGCAAAGTGACCAGGAACAAGCAATGGTGGAAAGGTTGTTGCGCGGCGCG
GCCAGGCTCGACGTCGAGGTGATCGCCACCTTGTCTGACGACGAAGTACGGGAGATGGGG
GAGTTGCCCTCGAACGTCCGGGTCCACGAATACGTACCGCTCAACGAACTGCTGGAGTCG
TGTTCAGTGATCATCCATCATGGCTCGACGACGACGCAGGAAACCGCCACGGTCAACGGC
GTACCGCAGTTGATTCTCCCTGGGACCTTCTGGGACGAATCTCGTAGGGCGGAGCTCCTA
GCCGATCGGGGAGCCGGTCTGGTCCTCGACCCCGCGACGTTTACCGAAGACGACGTGCGA
GGTCAGCTGGCCCGCCTGCTCGACGAGCCGTCGTTCGCTGCCAACGCGGCGCTGATCCGC
CGTGAAATCGAGGAAAGTCCCAGCCCGCACGACATCGTTCCACGTCTGGAAAAGCTAGTT
GCCGAACGTGAGAACCGCCGCACTGGGCAGTCTGATGGCCATCCGTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR004276 Glycosyl transferase, family 28 (Domain)
[19-145] 1.1e-16 PF03033
PF03033   Glyco_transf_28
IPR010610 Domain of unknown function DUF1205 (Domain)
[222-327] 2.80000000000001e-26 PF06722
PF06722   DUF1205
SignalP
[1-39] 0.388 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
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