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Spino_00100 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 18538
Entry nameSpinosyn
Contig
Start / Stop / Direction13,547 / 12,696 / - [in whole cluster]
13,547 / 12,696 / - [in contig]
Locationcomplement(12696..13547) [in whole cluster]
complement(12696..13547) [in contig]
TypeCDS
Length852 bp (283 aa)
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Category3.4 other modification
Productcyclase
Product (GenBank)methyltransferase-like protein
Gene
Gene (GenBank)spnL
EC number
Keyword
  • C-3 and C-14
Note
Note (GenBank)
  • involved in spinosyn aglycone biosynthesis; possibly involved in polyketide bridging
Reference
ACC
PmId
[11358695] Cloning and analysis of the spinosad biosynthetic gene cluster of Saccharopolyspora spinosa. (Chem Biol. , 2001)
[11386361] A cluster of genes for the biosynthesis of spinosyns, novel macrolide insect control agents produced by Saccharopolyspora spinosa. (Antonie Van Leeuwenhoek. , 2000)
[21544146] Enzyme-catalysed [4+2] cycloaddition is a key step in the biosynthesis of spinosyn A. (Nature. , 2011)
comment
[PMID: 11358695](2001)
spinosad biosynthetic gene clusterの報告。
spnL(284aa): polyketide bridging?

SpnLのMutantはAglycon以降の化合物からSpynosynAを産生することができる。
そのためこのORFはPKSの形成過程に関与していると推測される。

--
[PMID: 11386361](2000)
同じ著者らの先行論文。
spnL: Aglycone modification?

---
[PMID: 21544146](2011)
使用している株はNRRL 18537.
spnF, spnL, and spnMをE.coli発現、精製、産物測定により活性確認。

SpnJで修飾されたaglycone 3は、SpnMでのみ3環aglycone 8をもたらす。
この3環aglycone 8は、SpnF or SpnLと反応させても予測された4環aglycone 4を形成せず。

3環aglycone 8 + SpnG + dTDP-beta-L-rhamnoseで、rhamnoseの付いた3環中間体10が形成される。
3環aglycone 8 + SpnG + dTDP-beta-L-rhamnose + SpnLで、rhamnoseの付いた4環中間体が得られる。

よって、rhamnoseの付いた3環中間体10がSpnLの基質であり、perhydro-as-indacene coreを生成するためC-3 and C-14間で最終環化を触媒すると強く示唆される。
SpnLによって触媒されるC-C結合形成は、Rauhut-Currier mechanismに関与するかもしれない。

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selected fasta
>cyclase [methyltransferase-like protein]
MESIFDALAHGRPLHHGYWAGGYREDAGATPWSDAADQLTDLFIDKAALRPGAHLFDLGC
GNGQPVVRAACASGVRVTGITVNAQHLAAATRLANETGLAGSLEFDLVDGAQLPYPDGFF
QAAWAMQSVVQIVDQAAAIREVHRILEPGGRFVLGDIITRVRLPEEYAAVWTGTTAHTLN
SFTALVSEAGFEILEVTDLTAQTRCMVSWYVDELLRKLDELAGVEPAAVGTYQQRYLGDI
AAKHGPGPAQLIAAVAEYRKHPDYARNEESMGFMLLQARKKQS
selected fasta
>cyclase [methyltransferase-like protein]
GTGGAGTCCATCTTCGATGCGTTGGCGCACGGGCGTCCCCTGCACCACGGTTACTGGGCG
GGCGGGTATCGGGAGGATGCCGGTGCCACACCGTGGTCGGATGCTGCCGACCAACTGACC
GACCTGTTCATCGACAAGGCCGCGCTCCGTCCCGGAGCGCACCTGTTCGACCTGGGCTGC
GGCAATGGGCAGCCCGTAGTCCGTGCGGCATGCGCCAGCGGCGTTCGAGTCACCGGAATC
ACCGTGAACGCCCAGCATCTCGCCGCCGCCACCAGGCTCGCCAACGAGACCGGACTGGCC
GGCAGTCTTGAGTTCGATCTAGTCGACGGCGCCCAGCTGCCCTACCCGGACGGTTTCTTT
CAGGCCGCATGGGCGATGCAGTCCGTCGTGCAGATCGTGGACCAGGCCGCCGCGATCCGC
GAGGTCCACCGAATCCTGGAACCCGGCGGCCGGTTCGTCCTCGGAGACATCATCACTCGG
GTTCGACTCCCGGAAGAGTACGCGGCGGTTTGGACGGGCACGACCGCCCATACCTTGAAC
AGCTTCACGGCGCTGGTCAGCGAAGCCGGGTTCGAGATTCTCGAAGTCACCGACCTCACG
GCACAGACCAGGTGCATGGTCTCCTGGTACGTCGACGAGTTGCTCCGGAAACTCGATGAG
CTCGCCGGCGTCGAGCCTGCGGCTGTCGGCACCTACCAGCAACGCTACTTGGGAGACATC
GCGGCGAAGCACGGACCGGGACCAGCACAGCTGATCGCCGCGGTTGCGGAATACCGGAAA
CATCCGGATTACGCCAGAAACGAGGAAAGCATGGGTTTCATGCTCCTGCAGGCTCGAAAG
AAGCAGTCCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR013216 Methyltransferase type 11 (Domain)
[57-154] 3.7e-16 PF08241
PF08241   Methyltransf_11
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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