Pikro_00080 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces venezuelae
Strain	ATCC 15439
Entry name	Pikromycin
Contig	AF079762
Start / Stop / Direction	39,867 / 41,075 / + [in whole cluster] 119 / 1,327 / + [in contig]
Location	39867..41075 [in whole cluster] 119..1327 [in contig]
Type	CDS
Length	1,209 bp (402 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	glycosyltransferase helper protein
Product (GenBank)	putative tautomerase
Gene
Gene (GenBank)	desVIII
EC number
Keyword	desosamine
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q9ZGH8 PmId [9770448] A gene cluster for macrolide antibiotic biosynthesis in Streptomyces venezuelae: architecture of metabolic diversity. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 1998) [15161264] Characterization of the glycosyltransferase activity of desVII: analysis of and implications for the biosynthesis of macrolide antibiotics. (J Am Chem Soc. , 2004) [15358425] New olivosyl derivatives of methymycin/pikromycin from an engineered strain of Streptomyces venezuelae. (FEMS Microbiol Lett. , 2004) [20695498] Characterization of glycosyltransferase DesVII and its auxiliary partner protein DesVIII in the methymycin/picromycin biosynthetic pathway. (Biochemistry. , 2010) [26552796] In vivo investigation to the macrolide-glycosylating enzyme pair DesVII/DesVIII in Saccharopolyspora erythraea. (Appl Microbiol Biotechnol. , 2016) comment [PMID: 9770448](1998) 12員環骨格を持つMethymycin and Neomethymycinと、14員環骨格を持つNarbomycin and Pikromycinの生合成で共有されるclusterの同定。 DesVIII: Tautomerase? --- [PMID:15161264](2004) abstract glycosyltransferase DesVII のin vitro活性を実証。十分な活性を得るには、塩基性pHと追加タンパク成分DesVIII を必要とする。 --- [PMID:15358425](2004) 内因性deoxusugar(dTDP-D-desosamine)の生合成に関する全体的なgene clusterを削除し、dTDP-4-keto-6-deoxyglucose(内因性のdesosamine中間体)またはdTDP-D-olivose(外因性)の生合成に必要な遺伝子で置換したS.venezuelae mutant株において、'sugar-flexible' glycosyltransferase(DesVII) は12員環と14員環両方のmacrolactonesがquinovose or olivoseでglycosylateされた10-deoxymethynolide and narbonolideを産生した。またこれらのglycosylationにはDesVII に加えてDesVIII も必須であることが確認されている。 --- [PMID:20695498](2010) DesVII はglycosyltransferases活性のために追加protein componentであるDesVIII を必要とする。 recombinant DesVIII proteinの追加でDesVII によるglycosylation効率を改善。量はとても少ないが、desVIII はそのhomolog dnrQによって置換されうる。 DesVII/DesVIII 複合体の形成はvivoでの両遺伝子の同時発現を必要とし、vitroでの個々に産生されたタンパクの混合では完全には達成されない。 DesVII と DesVIII の比率は1:1で、複合体はheterodimersの3量体[(αβ)3]として存在する。 DesVII/DesVIII 複合体の触媒効率は、DesVII のみのときより少なくとも2×10(3)倍高い。よって、DesVIII はタンパク産生のときDesVII の折りたたみを補助し、触媒中きつく結合したままにすることが示唆される。

Sequence

>glycosyltransferase helper protein [putative tautomerase]
MTDDLTGALTQPPLGRTVRAVADRELGTHLLETRGIHWIHAANGDPYATVLRGQADDPYP
AYERVRARGALSFSPTGSWVTADHALAASILCSTDFGVSGADGVPVPQQVLSYGEGCPLE
REQVLPAAGDVPEGGQRAVVEGIHRETLEGLAPDPSASYAFELLGGFVRPAVTAAAAAVL
GVPADRRADFADLLERLRPLSDSLLAPQSLRTVRAADGALAELTALLADSDDSPGALLSA
LGVTAAVQLTGNAVLALLAHPEQWRELCDRPGLAAAAVEETLRYDPPVQLDARVVRGETE
LAGRRLPAGAHVVVLTAATGRDPEVFTDPERFDLARPDAAAHLALHPAGPYGPVASLVRL
QAEVALRTLAGRFPGLRQAGDVLRPRRAPVGRGPLSVPVSSS

>glycosyltransferase helper protein [putative tautomerase]
GTGACCGACGACCTGACGGGGGCCCTCACGCAGCCCCCGCTGGGCCGCACCGTCCGCGCG
GTGGCCGACCGTGAACTCGGCACCCACCTCCTGGAGACCCGCGGCATCCACTGGATCCAC
GCCGCGAACGGCGACCCGTACGCCACCGTGCTGCGCGGCCAGGCGGACGACCCGTATCCC
GCGTACGAGCGGGTGCGTGCCCGCGGCGCGCTCTCCTTCAGCCCGACGGGCAGCTGGGTC
ACCGCCGATCACGCCCTGGCGGCGAGCATCCTCTGCTCGACGGACTTCGGGGTCTCCGGC
GCCGACGGCGTCCCGGTGCCGCAGCAGGTCCTCTCGTACGGGGAGGGCTGTCCGCTGGAG
CGCGAGCAGGTGCTGCCGGCGGCCGGTGACGTGCCGGAGGGCGGGCAGCGTGCCGTGGTC
GAGGGGATCCACCGGGAGACGCTGGAGGGTCTCGCGCCGGACCCGTCGGCGTCGTACGCC
TTCGAGCTGCTGGGCGGTTTCGTCCGCCCGGCGGTGACGGCCGCTGCCGCCGCCGTGCTG
GGTGTTCCCGCGGACCGGCGCGCGGACTTCGCGGATCTGCTGGAGCGGCTCCGGCCGCTG
TCCGACAGCCTGCTGGCCCCGCAGTCCCTGCGGACGGTACGGGCGGCGGACGGCGCGCTG
GCCGAGCTCACGGCGCTGCTCGCCGATTCGGACGACTCCCCCGGGGCCCTGCTGTCGGCG
CTCGGGGTCACCGCAGCCGTCCAGCTCACCGGGAACGCGGTGCTCGCGCTCCTCGCGCAT
CCCGAGCAGTGGCGGGAGCTGTGCGACCGGCCCGGGCTCGCGGCGGCCGCGGTGGAGGAG
ACCCTCCGCTACGACCCGCCGGTGCAGCTCGACGCCCGGGTGGTCCGCGGGGAGACGGAG
CTGGCGGGCCGGCGGCTGCCGGCCGGGGCGCATGTCGTCGTCCTGACCGCCGCGACCGGC
CGGGACCCGGAGGTCTTCACGGACCCGGAGCGCTTCGACCTCGCGCGCCCCGACGCCGCC
GCGCACCTCGCGCTGCACCCCGCCGGTCCGTACGGCCCGGTGGCGTCCCTGGTCCGGCTT
CAGGCGGAGGTCGCGCTGCGGACCCTGGCCGGGCGTTTCCCCGGGCTGCGGCAGGCGGGG
GACGTGCTCCGCCCCCGCCGCGCGCCTGTCGGCCGCGGGCCGCTGAGCGTCCCGGTCAGC
AGCTCCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001128 Cytochrome P450 (Family) PF00067 p450 G3DSA:1.10.630.10 Cyt_P450 SSF48264 Cytochrome_P450 IPR002397 Cytochrome P450, B-class (Family) PR00359 BP450
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Pikro_00070 Pikro_00090