Aver_00060 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces avermitilis
Strain	ATCC 31267 (=NBRC 14893)
Entry name	Avermectin
Contig	AB032367
Start / Stop / Direction	36,785 / 37,828 / + [in whole cluster] 30,787 / 31,830 / + [in contig]
Location	36785..37828 [in whole cluster] 30787..31830 [in contig]
Type	CDS
Length	1,044 bp (347 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	cyclase/dehydratase
Product (GenBank)	AveC
Gene
Gene (GenBank)	aveC
EC number
Keyword	spiroketal moiety C22-23 dehydration
Note
Note (GenBank)	involved in postpolyketide modification
Reference	ACC Q9S0R6 PmId [10449723] Organization of the biosynthetic gene cluster for the polyketide anthelmintic macrolide avermectin in Streptomyces avermitilis. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 1999) [15721808] Semi-synthetic DNA shuffling of aveC leads to improved industrial scale production of doramectin by Streptomyces avermitilis. (Metab Eng. , 2005) [18824353] Engineering of avermectin biosynthetic genes to improve production of ivermectin in Streptomyces avermitilis. (Bioorg Med Chem Lett. , 2008) [23294008] Spiroketal formation and modification in avermectin biosynthesis involves a dual activity of AveC. (J Am Chem Soc. , 2013) comment [PMID:10449723](1999) avermectin生合成gene clusterの報告。 AveC: ? 塩基配列解析から、aveCはaveA2と翻訳共役であると示唆される。 aveCのmutationはC22-23でbeta-hydroxy carbonを含むcomponent 2の産生を導くが、AveC推定AA配列とputative dehydrataseのactive site motifの間に相同性はない。したがって、AveCの機能は明らかでない。Postpolyketide修飾に関与するのかもしれない。 --- [PMID: 15721808](2005)abstract aveC shuffled gene(bestは10 mutations)は、avermectin analogであるdoramectin(CHC-B1)のCHC-B2に対する比率を増やす。 --- [PMID: 18824353](2008) aveCの発現量はivermectin(avermectin BのC22-23が還元されている化合物)の収量を左右する。 ivermectin産生株ではaveC発現量が少ない。この株でaveC過剰発現するとivermectin収量は2倍に増える。 avermectin生合成におけるAveCの機能と、AveC and AveA2 DH2 domainとの関係を調査中。 --- [PMID: 23294008](2013) abstract: AveCはdihydroxy-ketone polyketide中間体の立体特異的なspiroketalizationと、spiroketal多様性の位置特異的な飽和特性を決定する任意のdehydrationを触媒するdual functionを持つ。 MeiCはAveCのspirocyclase活性を置換できるが、独立したdehydratase活性を欠く。 AveC and MeiCによって媒介されるin vitroでの生体内変換とin vivoでの相補の比較解析、産物同定などで実証している模様。

Sequence

>cyclase/dehydratase [AveC]
MNPSEPLGLPNERVVDTRPSDATLSPEAGLNRSGALPRELLSLPVVVWAGVGLLFLALQA
YVFSRWAADGGYRLIETAGQGQGGSKDTGTTDVVYPVISVVCITAAAAWLFRRCRVERRL
LFDALLFLGLLFASWQSPLMNWFHSVLVSNASVWGAVGSWGPYVPGWQGAGPGAEAEMPL
ASASVCMSALIVTVLCSKALGWIKARRPAWRTWRLVLAVFFIGIVLGLSEPLPSASGISV
WARALPEVTLWSGEWYQFPVYQAVGSGLVCCMLGSLRFFRDERDESWVERGAWRLPQRAA
NWARFLAVVGGVNAVMFLYTCFHILLSLVGGQPPDQLPDSFQAPAAY

>cyclase/dehydratase [AveC]
GTGAACCCATCCGAGCCGCTCGGCCTGCCCAACGAACGTGTAGTAGACACCCGACCGTCC
GATGCCACGCTCTCACCCGAGGCCGGCCTGAACAGGTCAGGAGCGCTGCCCCGTGAACTG
CTGTCGTTGCCGGTGGTGGTGTGGGCCGGGGTCGGCCTGCTGTTTCTGGCCCTGCAGGCG
TACGTGTTCAGCCGCTGGGCGGCCGACGGTGGCTACCGGCTGATCGAGACGGCGGGCCAG
GGTCAGGGCGGCAGCAAGGATACGGGGACTACCGATGTGGTCTATCCCGTGATTTCCGTC
GTCTGCATCACCGCCGCGGCGGCGTGGCTCTTCCGGAGGTGCCGTGTCGAACGACGGCTG
CTGTTCGACGCCCTTCTCTTCCTCGGGCTGCTGTTCGCGAGCTGGCAGAGCCCGCTCATG
AACTGGTTCCATTCCGTTCTCGTCTCCAACGCGAGTGTGTGGGGCGCGGTGGGTTCCTGG
GGTCCGTATGTGCCCGGCTGGCAGGGGGCGGGCCCGGGTGCGGAGGCGGAAATGCCGCTG
GCGTCGGCCTCCGTCTGCATGTCGGCTCTGATCGTCACCGTGCTGTGCAGCAAGGCACTG
GGGTGGATCAAGGCCCGCCGGCCGGCATGGCGGACCTGGCGGCTGGTCCTGGCCGTGTTC
TTCATCGGCATCGTGCTCGGTCTGTCCGAGCCGCTGCCGTCCGCCTCCGGGATCAGCGTA
TGGGCCAGAGCGCTGCCCGAGGTGACCTTGTGGAGTGGCGAGTGGTACCAGTTCCCCGTG
TATCAGGCGGTCGGTTCCGGCCTGGTCTGCTGCATGCTGGGCTCGCTGCGCTTCTTCCGC
GACGAACGCGATGAGTCGTGGGTGGAACGGGGAGCCTGGCGGTTGCCGCAACGGGCAGCG
AACTGGGCGCGTTTCCTCGCCGTGGTCGGTGGGGTGAATGCCGTGATGTTCCTCTACACC
TGTTTCCATATCCTCCTGTCCCTCGTCGGTGGACAGCCGCCCGACCAACTGCCGGACTCC
TTCCAAGCGCCGGCCGCTTACTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro	No significant hit
SignalP	Eukaryota
TMHMM	Transmembrane 7

Aver_00050 Aver_00070