Aver_00180 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces avermitilis
Strain	ATCC 31267 (=NBRC 14893)
Entry name	Avermectin
Contig	AB032523
Start / Stop / Direction	80,252 / 79,209 / - [in whole cluster] 9,297 / 8,254 / - [in contig]
Location	complement(79209..80252) [in whole cluster] complement(8254..9297) [in contig]
Type	CDS
Length	1,044 bp (347 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	putative dTDP-hexose C-3 ketoreductase
Product (GenBank)	dTDP-4-keto-6-deoxy-L-hexose 2,3-reductase
Gene
Gene (GenBank)	aveBVIII
EC number
Keyword	L-oleandrose axial-OH
Note
Note (GenBank)	function in oleandrose biosynthesis
Reference	ACC Q9S0N9 PmId [10449723] Organization of the biosynthetic gene cluster for the polyketide anthelmintic macrolide avermectin in Streptomyces avermitilis. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 1999) [11451669] Insights about the biosynthesis of the avermectin deoxysugar L-oleandrose through heterologous expression of Streptomyces avermitilis deoxysugar genes in Streptomyces lividans. (Chem Biol. , 2001) comment [PMID:10449723](1999) avermectin生合成gene clusterの報告。 AveBVIII: dTDP-4-keto-6-deoxy-L-hexose 2,3-reductase この論文で実験確認しているわけではない。 --- [PMID: 11451669](2001) avrI/aveBVIII: dTDP-4-keto-6-deoxy-L-hexose 3-ketoreductase oleandroseとmycaroseの生合成を参照して、6-deoxyhexoses形成共通2stepsの後は、avrG/aveBVI(encoding a C-2,3-dehydratase) and avrI/aveBVIII (encoding a C-3-ketoreductase)が関連するC-2 deoxygenationが起こると言っている。 S.lividansでS.avermitilis avrBCDEFGHIを発現させて外因性aglyconeと反応させて産物解析。 delta-avrIではmono- or di-demethylated disaccharidesを持つavermectin A1a derivativesも産生するが、ふつうのavermectin A1aも産生可能。代替経路がある模様。 delta-avrHIではdelta-Hと同じくavermectins A1a1 and A1a2を産生。 avermectins A1a1 and A1a2は、C-3でmethyl化されていないsugar(L-olivose, L-digitoxose)を持ったavermectin derivatives。
Related Reference	ACC Q9XC70 PmId [16448097] A two-stage one-pot enzymatic synthesis of TDP-L-mycarose from thymidine and glucose-1-phosphate. (J Am Chem Soc. , 2006) comment 12th(Q9XC70) 61%, 1e-107 Streptomyces fradiae_tylCII(tylC1) NDP-hexose 2,3-enoyl reductase TylCII -- [PMIDなし]Biosynthesis of Mycarose: Isolation and Characterization of Enzymes Involved in the C-2 Deoxygenation. J Am Chem Soc 1999 TylX3をdTDP-D-glucoseを4,6-dehydrataseで処理した基質と反応するとmaltol産生。これは予測された不安定なdehydration産物の分解の結果であると示唆される。 TylX3にTylC1, NADPHを加えて反応すると、C-3 OH基がaxialなdTDP-2,6-dideoxy-D-glycero-D-glycero-4-hexuloseを産生。この産物のC-2のHはequatrial positionであることが重水素の取り込みで確認されたので、C-2の立体配置は保持されており、水素化物がNADPHから不安定中間体のC-3 positionへ移されることがほのめかされる。 -- [PMID:16448097]上記論文の引用あり。
Related Reference	ACC Q9F833 NITE Megalo_00090 PmId [17571859] Characterization of the heterodimeric MegBIIa:MegBIIb aldo-keto reductase involved in the biosynthesis of L-mycarose from Micromonospora megalomicea. (Biochemistry. , 2007) comment 17th(Q9F833) 60%, 1e-97 Micromonospora megalomicea subsp. nigra_megDVII(megBIIb) [Megalo_00090]dTDP-hexose 3-ketoreductase component megDVII→megBIIb megBII→megBIIa vivoでのdTDP-sugar中間体の解析が示したのは、MegBIIaも、そのhomologueであるMegBIIbも、それ自身による完全な活性型酵素ではないということ。 C3-ketoreductase activityはMegBIIa and MegBIIbの両方の存在下のみ観察されたことから活性型複合体形成が示唆された。 MegBIIa and MegBIIb が1:1 heterodimeric complexを形成する相互作用をすることが同時精製とsize exclusion chromatography experimentsで確かめられた。 L-mycarose pathwayの他の生合成遺伝子と共にmegBIIa and megBIIbを含むmycarose operonが構築され、E.coliでの生物変換実験によってテストされ、高レベルのmycarosyl-erythronolide Bが産生された。 MegBIIaは活性残基を欠いている。 MegBIIbはC末が不完全で、EryBIIのC末で置きかえるとself-dimerizationし、活性を持つ。 MegBIIaは、MegBIIbの構造安定性を維持するための足場として働くと示唆される。

Sequence

>putative dTDP-hexose C-3 ketoreductase [dTDP-4-keto-6-deoxy-L-hexose 2,3-reductase]
MMPTTAEPAPVQSDSNSSAPLHTELGRTRLRISRLALGTVNIGGRVEEPEARRLMDHALA
QGITLFDTANTYGWRVHKGYTEEVIGRWLADRPARREQVVLATKVGDPMGSGPNDHGLSV
RNIVAACDASLRRLRTDWIDLYQLHHIDRRAGWDEVWQAMDLLITQGKVRYVGSSNFAGW
DIASAQEAARRRNALGLASEQCVYNLVTRHAELEVIPAASAYGVGVLVWSPLHGGLLGGV
LRKTRENTAVKSAQGRAVEALEHHRTTIAAYEDVCADHGLDPAHVGMAWVLSRPGVTGLV
IGPRTEQHVDGALHALRTPLPEPVLARLEELFPPVGRGGSAPDAWLS

>putative dTDP-hexose C-3 ketoreductase [dTDP-4-keto-6-deoxy-L-hexose 2,3-reductase]
ATGATGCCTACGACGGCCGAGCCCGCACCCGTCCAGTCCGACAGCAACAGCAGTGCTCCC
CTCCACACCGAACTGGGCAGGACCCGGCTGAGGATCAGCCGACTGGCGCTCGGAACGGTC
AACATCGGCGGACGGGTGGAGGAGCCCGAAGCGCGCCGACTGATGGATCACGCCCTGGCT
CAGGGCATCACCCTGTTCGACACCGCCAACACCTACGGCTGGCGCGTCCACAAGGGGTAC
ACCGAAGAGGTCATCGGCAGGTGGCTGGCGGACCGCCCCGCCCGGCGTGAGCAGGTGGTG
CTGGCCACCAAGGTCGGCGATCCGATGGGCAGCGGCCCCAACGATCACGGACTGTCCGTA
CGCAATATCGTGGCCGCCTGCGACGCCTCGCTGCGCCGACTGCGCACCGACTGGATCGAC
CTGTACCAGCTGCACCACATCGACCGCCGCGCCGGCTGGGACGAGGTGTGGCAGGCGATG
GACCTGCTCATCACGCAGGGCAAGGTGCGCTACGTCGGCTCCTCCAACTTCGCGGGCTGG
GACATCGCTTCCGCCCAGGAGGCGGCCCGGCGGCGCAACGCCCTGGGCCTCGCCTCCGAG
CAGTGCGTCTACAACCTCGTGACCCGACACGCCGAGCTGGAAGTCATCCCCGCCGCGTCC
GCCTACGGTGTCGGCGTCCTGGTCTGGTCGCCACTGCACGGCGGCCTGCTCGGCGGTGTC
CTGCGCAAGACGCGGGAGAACACCGCGGTCAAGTCGGCACAGGGCCGGGCCGTCGAGGCC
CTGGAGCACCACCGCACCACCATCGCGGCGTACGAGGACGTGTGCGCGGACCACGGCCTC
GACCCCGCCCATGTCGGCATGGCCTGGGTGCTGTCGCGGCCCGGCGTGACCGGGCTGGTC
ATCGGGCCGCGCACCGAACAGCACGTGGACGGGGCACTGCACGCCCTGCGCACCCCGCTG
CCCGAGCCCGTCCTGGCCCGCCTGGAGGAGCTGTTCCCCCCGGTCGGCCGCGGCGGATCC
GCCCCCGACGCCTGGCTGTCCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR023210 NADP-dependent oxidoreductase domain (Domain) G3DSA:3.20.20.100 Aldo/ket_red SSF51430 Aldo/ket_red PF00248 Aldo_ket_red
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

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