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Resis_00040 : CDS information

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Organism
StrainHKI-237
Entry nameResistomycin
Contig
Start / Stop / Direction1,964 / 3,013 / + [in whole cluster]
1,964 / 3,013 / + [in contig]
Location1964..3013 [in whole cluster]
1964..3013 [in contig]
TypeCDS
Length1,050 bp (349 aa)
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Category3.2 modification methylation
Productdimethyltransferase
Product (GenBank)RemG protein
Gene
Gene (GenBank)remG
EC number2.1.1.-
Keyword
  • C-geminal
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[14982421] A gene cluster encoding resistomycin biosynthesis in Streptomyces resistomycificus; exploring polyketide cyclization beyond linear and angucyclic patterns. (J Am Chem Soc. , 2004)
[17914826] Geminal tandem C-methylation in the discoid resistomycin pathway. (J Am Chem Soc. , 2007)
comment
[PMID:14982421](2004)
resistomycin生合成gene cluster全体を異種性発現により同定。

RemG: Methyltransferase

PKS後の修飾として、bis-nor-resistomycinはgeminal bis-methylationを受ける。既報の13C-labeling実験でresistomycinの両方のgem methyl基がS-adenosyl methionine(SAM)に由来することがわかっている。remG, remHにはprobable SAM-binding methylTFに特徴的なmotifが保存されているので、この反応に関与することが示唆される。

---
[PMID: 17914826](2007)
delta-remGH, delta-remH, delta-remGを作成。相補実験もしている。

delta-remGHはresistomycin非産生。remGH、remGで相補可能だがremHでは相補不可。
delta-remGもresistomycin非産生。remGで相補可能。
delta-remHはresistomycin産生可能。

remGを欠いたmutantでは不安定な化合物2を検出。
この化合物2がgeminal bis-methylationを欠いている構造であることを確認。

よってRemGのみがresistomycinに2つのmethyl基を導入するのに必要とされる。
また、化合物2の構造から、このmethylationはresistomycin生合成経路の最後のステップであると示される。

E.coliでMalE fusion proteinとして発現したRemGを使って化合物2からの変換をみようとしたが、化合物2が不安定なためできていない。

type II PKS systemにおけるmethyltransferasesとの系統解析あり。
RemGは新しいグループに示される。

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selected fasta
>dimethyltransferase [RemG protein]
MTTTQDLDTQAGQASPDGDSSRVHTILTAYLQSKAVFAALDLGVFEALEKSPRTVAELAD
ELGLEKRPTRALLVALKGLDLVRAENGGYRNSDEASRYLVAGRPEYMGGFAAHQNSHFGH
FSRLDEAVRTNTSLNQRVLKQGYRDQGAAAGEGREGTGRLIQAMRVSSRLQAGKLAAAVP
LAGVRRVVDLGCGSGDYSIALASHHPELRVTALDYPAVTDLARANVREAGLEDRIEVRPA
DIMADAWPETDAVLLSHVLDGYGPERAAHLVKRIHAHLPDGGRLLVHSHMPALATGLFPA
MFGLILLVNTEEGEVRDVDEIRAWVEGAGFRDIATRNVSQLSGLLTATK
selected fasta
>dimethyltransferase [RemG protein]
GTGACGACCACTCAGGACCTCGACACCCAGGCCGGCCAGGCCTCCCCCGACGGCGACTCC
TCCAGGGTCCACACCATCCTGACCGCCTACCTCCAGTCCAAGGCCGTGTTCGCGGCCCTC
GACCTCGGGGTCTTCGAGGCGCTGGAGAAGAGCCCGCGCACGGTGGCCGAACTGGCCGAC
GAACTGGGCCTGGAGAAACGTCCCACCCGCGCCCTGCTCGTCGCCCTCAAGGGCCTGGAC
CTGGTGCGCGCCGAGAACGGCGGCTACCGCAACTCCGACGAGGCGAGCCGCTATCTCGTC
GCCGGGCGGCCCGAGTACATGGGCGGGTTCGCCGCGCACCAGAACTCCCACTTCGGCCAC
TTCTCCCGCCTCGACGAGGCCGTACGCACCAACACCTCGCTCAACCAGCGGGTCCTCAAG
CAGGGTTACCGCGACCAGGGCGCCGCGGCCGGCGAGGGCCGCGAGGGCACCGGGCGGCTC
ATCCAGGCCATGCGGGTCAGCTCCCGGCTGCAGGCGGGCAAGCTGGCCGCCGCGGTCCCG
CTGGCCGGCGTCCGCCGGGTCGTCGACCTGGGCTGCGGCTCGGGCGACTACTCGATCGCC
CTCGCCTCCCACCACCCCGAGCTGCGTGTCACGGCCCTCGACTACCCCGCGGTGACCGAC
CTGGCCCGCGCCAACGTGCGCGAGGCCGGCCTCGAGGACCGGATCGAGGTCAGGCCCGCC
GACATCATGGCGGACGCCTGGCCGGAGACGGACGCGGTCCTCCTCTCCCACGTCCTCGAC
GGCTACGGCCCCGAGCGCGCCGCGCACCTGGTCAAGCGCATCCACGCCCATCTGCCCGAC
GGCGGAAGGCTGTTGGTGCACTCCCACATGCCGGCCCTGGCCACCGGCCTCTTCCCGGCC
ATGTTCGGGCTGATCCTCCTGGTCAACACCGAGGAGGGCGAGGTCCGGGACGTGGACGAG
ATCCGCGCCTGGGTGGAGGGCGCCGGGTTCCGGGACATCGCCACCCGCAACGTCTCCCAG
CTCTCCGGTCTGCTCACGGCCACCAAGTAG

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001077 O-methyltransferase, family 2 (Domain)
[93-325] 2.7e-26 PF00891
PF00891   Methyltransf_2
IPR011991 Winged helix-turn-helix transcription repressor DNA-binding (Domain)
[21-95] 1.3e-20 G3DSA:1.10.10.10
G3DSA:1.10.10.10   Wing_hlx_DNA_bd
IPR016461 O-methyltransferase, caffeic acid-type (Family)
[1-349] 1.30000067202732e-05 PIRSF005739
PIRSF005739   O-mtase
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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