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Aran_00160 : CDS information

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Organism
StrainTü303
Entry nameAranciamycin
Contig
Start / Stop / Direction21,987 / 21,568 / - [in whole cluster]
21,987 / 21,568 / - [in contig]
Locationcomplement(21568..21987) [in whole cluster]
complement(21568..21987) [in contig]
TypeCDS
Length420 bp (139 aa)
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Category3.3 modification reduction
Productputative C-12 oxygenase
Product (GenBank)
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
  • anthraquinone
Note
  • orf16
Note (GenBank)
Reference
PmId
[17357167] Cloning and heterologous expression of the aranciamycin biosynthetic gene cluster revealed a new flexible glycosyltransferase. (Chembiochem. , 2007)
comment
UniProt entryなし。

---
aranciamycin生合成gene cluster(ara-cluster)のクローニングとシークエンス報告。

ORF16(139aa): oxidoreductase

配列解析から、ORF16はaranciamycinoneのC-12に酸素を導入するanthrone-type oxygenaseをコードするかもしれないと提唱されている。
Related Reference
ACC
O54259
NITE
Nogl_00350
PmId
[19255477] Expression, purification and crystallization of the cofactor-independent monooxygenase SnoaB from the nogalamycin biosynthetic pathway. (Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. , 2009)
[20052967] Crystal structure of the cofactor-independent monooxygenase SnoaB from Streptomyces nogalater: implications for the reaction mechanism. (Biochemistry. , 2010)
comment
Blast 1st, 58%, 3e-22
Streptomyces nogalater_snoaB
SnoaB
[DoBISCUIT]12-deoxynogalonic acid C-12 oxygenase

--
[PMID: 19255477](2009)
SnoaBは、
12-deoxy-nogalonic acid → nogalonic acid
へのposition12でのoxygenationを触媒する12-deoxy-nogalonic acid oxygenaseである。

prosthetic group, cofactor or metal ionの助けなしにoxygenation反応を実行するsmall cofactor-free oxygenasesのfamilyに属する。
methinonine→selenomethionine置換したmutantでoxygenase activityを測定して、wildと比較している。

--
[PMID: 20052967](2010) abstract
vitroでの(18)O2実験で、基質に取り込まれた酸素原子が酸素分子に由来することを確認。
結晶構造解析、site-directed mutagenesis実験により酵素反応に重要な残基を同定し、反応メカニズムを提唱。
ACC
Q8VWB4
PmId
[12399480] Expression, purification, and characterization of AknX anthrone oxygenase, which is involved in aklavinone biosynthesis in Streptomyces galilaeus. (J Bacteriol. , 2002)
comment
Blast 2nd, id53%, 2e-21
Streptomyces galilaeus(3AR-33)_aknX
AknX

AknXをE.coliで過剰発現、精製、酵素活性測定。
emodinanthrone → anthraquinone emodinへ変換するanthrone oxygenase activity確認あり。
TcmHのようなoxygen activationのための補欠分子族を持たないので、peroxy anion intermediateを介した異なるメカニズムが提唱されている。

anthranol anionの形成で反応は始まり、それは固定された向きでTrp-67とのπ-π複合体形成によって安定化される。それからhydroperoxyanthroneがdioxygen添加によって形成され、続いてanthraquinone形成のためにdehydrateされる、と提唱されている(Fig9)。

close this sectionSequence

selected fasta
>putative C-12 oxygenase
MAGPRSALPPRPFEPLSSGADHDGGRGFEPARQEATLVITFVNRFDVHGSPAEFERVFDR
TSLFFSAQPGFLRHRLLRHADQPGKYVNVAEWESRAAFEQALRQPEFAPHARDLRELSTS
DPQLYVSALERSEPQRPHA
selected fasta
>putative C-12 oxygenase
GTGGCCGGCCCTCGATCGGCCTTGCCACCACGGCCGTTCGAGCCCCTGTCGAGCGGTGCC
GACCACGATGGTGGTCGTGGATTCGAGCCCGCCCGGCAGGAGGCAACTCTGGTGATCACC
TTCGTCAACCGCTTCGACGTGCACGGCTCCCCCGCCGAGTTCGAGCGCGTCTTCGACCGG
ACCTCGCTGTTCTTCAGCGCCCAGCCCGGCTTTCTGCGGCACCGGCTGCTGCGCCACGCG
GACCAGCCCGGCAAGTACGTCAACGTTGCGGAGTGGGAGAGCCGCGCGGCCTTCGAACAG
GCGTTGCGTCAGCCGGAGTTCGCTCCGCACGCCCGGGACCTGCGGGAACTGAGCACCAGC
GATCCCCAGCTGTACGTCAGCGCCCTCGAGCGCTCCGAGCCGCAGCGGCCGCACGCATGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR007138 Antibiotic biosynthesis monooxygenase (Domain)
[39-112] 1.2e-17 PF03992
PF03992   ABM
IPR011008 Dimeric alpha-beta barrel (Domain)
[38-139] 9.6e-20 SSF54909
SSF54909   Dimeric alpha+beta barrel
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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