Dauno_00220 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sp.
Strain	C5
Entry name	Daunorubicin
Contig	U50973
Start / Stop / Direction	147 / 1 / - [in whole cluster] 3,050 / 3,196 / + [in contig]
Location	complement(1..147) [in whole cluster] 3050..3196 [in contig]
Type	CDS
Length	147 bp (48 aa)

Annotation

Category	4.1 transcriptional regulator
Product	putative transcriptional regulator(fragment)
Product (GenBank)	DauI
Gene
Gene (GenBank)	dauI
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q55079 PmId [8655530] Isolation and characterization of a gene from Streptomyces sp. strain C5 that confers the ability to convert daunomycin to doxorubicin on Streptomyces lividans TK24. (J Bacteriol. , 1996) [7928998] Isolation and sequence analysis of polyketide synthase genes from the daunomycin-producing Streptomyces sp. strain C5. (J Bacteriol. , 1994) [9098068] Minimal Streptomyces sp. strain C5 daunorubicin polyketide biosynthesis genes required for aklanonic acid biosynthesis. (J Bacteriol. , 1997) comment [PMID: 8655530](1996) UniProt登録論文。 doxAの解析において、dauI のN末が一緒に読まれている。 dauI については配列解析による機能予測もされていない。この論文でdauI に関して引用されているのが[PMID: 7928998](1994) dauI とその下流に並ぶdauJ(dnrI and dnrJ homologs)が全長で明らかになっているが、Unpublished dataに基づいている。これらに対応するUniProt entryなし。 --- [PMID: 9098068](1997) daunorubicin (DNR), doxorubicin (DXR)の前駆体であるaklanonic acidを異種性ホストで産生するために必要な最小遺伝子は、dpsG (ACP), dauI (regulatory activator), dpsA (KS alpha), dpsB (KS beta), dpsF (aromatase), dpsE (polyketide reductase), and dauG (putative deoxyaklanonic acid oxygenase)であるということを実証している。
Related Reference	ACC P25047 NITE Adria_00210 PmId [1729206] Regulation of secondary metabolism in Streptomyces spp. and overproduction of daunorubicin in Streptomyces peucetius. (J Bacteriol. , 1992) [7868593] Functional characterization and transcriptional analysis of the dnrR1 locus, which controls daunorubicin biosynthesis in Streptomyces peucetius. (J Bacteriol. , 1995) [8971703] Purification and characterization of the DNA-binding protein DnrI, a transcriptional factor of daunorubicin biosynthesis in Streptomyces peucetius. (Mol Microbiol. , 1996) [16545946] Feedback regulation of doxorubicin biosynthesis in Streptomyces peucetius. (Res Microbiol. , 2006) [20529134] Modulation of dnrN expression by intracellular levels of DnrO and daunorubicin in Streptomyces peucetius. (FEMS Microbiol Lett. , 2010) [20158521] Daunorubicin efflux in Streptomyces peucetius modulates biosynthesis by feedback regulation. (FEMS Microbiol Lett. , 2010) comment Blast 1st, id98%, 1e-19, N末部分hit Streptomyces peucetius_dnrI Regulatory protein dnrI -- [PMID: 1729206](1992) ATCC 29050 strainでdnrI を不活化したら、RHO産生とdaunorubicin (DNR)産生ができなくなり、DNRへの抵抗性が著しく減った。 --- 同じ著者らの続報。 [PMID: 7868593](1995) dnrI::aphII mutantでは、DNR生合成におけるearly- and late-acting enzymesの両方をコードする転写物が存在しない。よってdnrI は、直接または間接的にDNR生合成遺伝子のすべてを調節している。 dnrI::aphII and dnrN::aphII strainsでresistance genes=drrAB and drrC転写物は消失。よって、dnrI はDNR抵抗性の重大なregulatorであり、dnrNはdnrI を通して間接的にその影響を発現する、と示唆される。 -- [PMID: 8971703](1996) abstract DNA-binding assays. ・dnrG-dpsABCD と dpsEF の間・dnrC gene と dnrDKPSQ の間の遺伝子間領域を含んだDNA断片へ特異的に結合する。 -- [PMID: 16545946](2006) abstract dnrI promoter活性を増やすためにはDnrO and DnrN の両方が必要であった。 -- [PMID: 20529134]や[PMID: 20158521]で、dnrO, dnrN, dnrI, DNRが関与する細胞内DNR濃度維持システムが提唱されている。 dnrI promoterにはDnrNが結合し活性化される。

Sequence

>putative transcriptional regulator(fragment) [DauI]
MQINMLGPLVAHHNGTSVTPIARKPRQVFSLLALQAGTVVPVPALMEEL

>putative transcriptional regulator(fragment) [DauI]
ATGCAGATCAATATGTTGGGCCCGCTCGTTGCACATCACAATGGCACGTCGGTGACCCCG
ATAGCCAGAAAACCCCGGCAGGTATTCTCACTGCTCGCTCTTCAGGCAGGAACCGTCGTT
CCGGTCCCCGCGCTGATGGAGGAGCTC

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001867 Signal transduction response regulator, C-terminal (Domain) PF00486 Trans_reg_C
SignalP	Bacteria, Gram-negative
TMHMM	No significant hit

first Dauno_00210