| Category | 5.1 general function |
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| Product | putative oxidoreductase |
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| Product (GenBank) | UrdO |
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| Gene | |
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| Gene (GenBank) | urdO |
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| EC number | |
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| Keyword | |
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| Note | |
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| Note (GenBank) | |
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| Reference | - ACC
- Q9RP96
- PmId
[10658661] Two new tailoring enzymes, a glycosyltransferase and an oxygenase, involved in biosynthesis of the angucycline antibiotic urdamycin A in Streptomyces fradiae Tu2717. (Microbiology. , 2000) - comment
- urdamycin生合成clusterの追加クローニング。
urdOについては配列解析のみ。
short-chain alcohol dehydrogenase familyに属すると示唆される。
NAD(P)Hdependent dehydrogenasesに共通するmotifを持つLanO、LanZ4によく似ている。
urdamycinのpolyketide部分の生合成のときにreductaseとして働くかもしれない。
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| Related Reference | - ACC
- Q9ZGB0
- NITE
- Lando_00300
- PmId
[15812784] Generation of novel landomycins M and O through targeted gene disruption. (Chembiochem. , 2005)
[22454092] Elucidation of post-PKS tailoring steps involved in landomycin biosynthesis. (Org Biomol Chem. , 2012) - comment
- Blast 27th, id57%, 1e-53
Streptomyces cyanogenus_lanZ4
Reductase homolog
LanZ5とtwo-component monooxygenase systemを形成している。
monooxygenase_LanZ5にFMNH2を供給するNADPH-dependent FMN reductase.
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[PMID:15812784](2005)
lanGT3, Z2, Z3, GT4, Z4, Z5にpolar effectが起きる株作成。
この株は側鎖に2つの糖を含み、11-OHを欠くlandomycin F産生。
この株をlanZ4 and lanZ5で補完すると11-OHのあるlandomycin D産生。
lanZ4 and lanZ5以外で補完するとlandomycins F, M, O(すべて11-OHなし)産生。
landomycin M and Oは6-OHも欠いているが、これはC-11 OH基欠損によるnegativeな影響の可能性あり。
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[PMID: 22454092](2012)
PKS後仕立て反応に関与するとされるLanM2, E, V, Z4, Z5に関する調査。
lanZ4 and lanZ5はlan clusterで翻訳共役。
LanZ4が還元したcofactorをLanZ5が利用する共依存であると仮定。
S. lividans TK64においてminimal PKSと共にgenesを発現して産物解析。
minimal PKS + lanZ4 + lanZ5 → UWM6(PKSのみと同じ）
よってPKSの直後の反応ではない。
各genesをE.coliで発現、精製して活性測定。
FMN and NADPHがLanZ4の自然な基質であることを確認。
LanZ4 and LanZ5は、
tetrangomycin → 11-hydroxytetrangomycin(shunt産物)
また、LanZ4 and LanZ5は急速に
11-deoxylandomycinone → tetrangulol + anhydrolandomycinone(少量)
の変換をするが、LanZ5のみだとゆっくりになり、
11-deoxylandomycinone → tetrangulolのみ
よって、LanZ5は11-deoxylandomycinoneをhydroxylateするのを好まない。
ここで見られる5,6-dehydrationは副反応で、糖残基がないときにのみ起こる。
"combinatorial biosynthetic enzymology"において、UWM6もrabelomycinもlandomycin生合成経路の中間体ではないこと、prejadomycinがlandomycin生合成の一般的な経路中間体であることを確認。
結果を総合して改訂経路を提唱。
LanGT2による最初のglycosylationの後に、LanZ5はLanZ4によって還元されたFMNを使って優先的に11-hydroxylationする。それから順々にglycosylationして、landomycin Aのようなlandomycinone骨格を持ったlandomycinsを形成する。
副反応の5,6-dehydrationにより、landomycin副産物が産生される。
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同じlan cluster geneであるlanOのほうが上位(Blast 7th, id61%, 2e-63)にhitしているが、機能は実験確認されていない。
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- ACC
- Q6T1C6
- PmId
[15123249] Generation of new landomycins by combinatorial biosynthetic manipulation of the LndGT4 gene of the landomycin E cluster in S. globisporus. (Chem Biol. , 2004) - comment
- Blast 26th, id57%, 4e-54
Streptomyces globisporus
Putative reductase LndZ4
landomycin E産生株Streptomyces globisporus 1912にあるhomologue LndZ4/LndZ5における[PMID:15812784]と同様の実験報告。
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- ACC
- Q07923
- PmId
[15184374] Crystal structure and functional characterization of yeast YLR011wp, an enzyme with NAD(P)H-FMN and ferric iron reductase activities. (J Biol Chem. , 2004) - comment
- Blast 284th, id32%, 3e-09, C末イマイチ, T-coffee gapあり
Saccharomyces cerevisiae_LOT6
NAD(P)H-dependent FMN reductase LOT6(EC 1.5.1.29)
function; Has several reductase activities that are NAD(P)H-dependent and involve FMN as a cofactor, ferricyanide being the best substrate for reduction. May be involved in ferric iron assimilation.
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Urd_00080
Location
![[7-153] 5.40000000000002e-40 PF03358](../../img/H.gif "[7-153] 5.40000000000002e-40 PF03358"){kind=small}
