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Bena_00150 : CDS information

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Organism
StrainA2991200
Entry nameBenastatin
Contig
Start / Stop / Direction14,041 / 13,292 / - [in whole cluster]
14,041 / 13,292 / - [in contig]
Locationcomplement(13292..14041) [in whole cluster]
complement(13292..14041) [in contig]
TypeCDS
Length750 bp (249 aa)
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Category3.3 modification reduction
Productketoreductase
Product (GenBank)BenL protein
Gene
Gene (GenBank)benL
EC number
Keyword
  • pentangular
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[17439117] Molecular analysis of the benastatin biosynthetic pathway and genetic engineering of altered fatty acid-polyketide hybrids. (J Am Chem Soc. , 2007)
[17625850] Biosynthesis of pentangular polyphenols: deductions from the benastatin and griseorhodin pathways. (J Am Chem Soc. , 2007)
comment
[PMID:17439117](2007)
Benastatin A and B生合成をコードする全遺伝子座のクローニング、シークエンス。
flanking regionsの削除とS. albus, S. lividansでの異種性発現によってclusterが同定されている。

BenL: ketoreductase

配列解析のみ。
C19-keto基の還元に関連するかもしれない。

--
[PMID:17625850](2007)
benL不活化は6-hydroxy benastatin and bequinostatin derivativesなどを形成。
これら産物はすべてD-ring構造をエノール化しているので、BenLは明らかにKRとして機能する。
相補により、比率は異なるがwildの産物特性を回復する。

また芳香族polyketides生合成に関連するKRsの系統解析も実施。
以上から、BenLがpentangular pathwaysでC-19 KRとして機能すると述べている。

この論文でのC-19というpositionは修飾前の線状polyketideでの位置。
提唱経路では、keto基還元は環化後に起こるとされている。
環化後のpositionだとC-6に相当する。

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selected fasta
>ketoreductase [BenL protein]
MNLPLTGRHALVTGGSRGIGKAIVLALARAGADVLACHQNPSAQADQLALELKRTEGDHH
LLQADITDPADVDRLVNEAKTRYGSLEIVVHNAGVISHVPLPQLELAEWHRVLDTSLTAA
FAVVQKTLPLYGERASVILIGSRSAARGIALRSHYTAAKAGLEGFARSAAKELGGRGVRV
NVIAPGVIDSDDAKAIPAEQRAQLVARYGDKTALGRLGEPDEIAGAAVFLAGDLSSYVTG
QTINVDGGI
selected fasta
>ketoreductase [BenL protein]
GTGAATCTCCCCCTCACCGGCAGGCACGCGCTCGTCACAGGCGGCAGTCGAGGCATTGGA
AAGGCCATCGTGCTCGCCCTCGCCCGGGCAGGAGCCGATGTTCTGGCCTGCCACCAGAAC
CCGAGTGCGCAAGCGGACCAGTTGGCCCTGGAGCTGAAAAGGACGGAAGGCGACCACCAC
CTGCTGCAGGCCGACATCACCGACCCGGCCGACGTCGATCGGCTGGTGAATGAGGCGAAG
ACCAGGTACGGCTCGCTGGAGATCGTCGTGCACAACGCCGGCGTGATCAGCCATGTCCCG
CTGCCGCAGCTGGAGTTGGCGGAATGGCACAGGGTGCTGGACACCAGCCTGACCGCGGCC
TTCGCGGTGGTGCAAAAGACGCTTCCGCTGTACGGGGAACGGGCCTCCGTCATATTGATC
GGCTCCCGGTCCGCGGCTCGCGGTATCGCTCTGCGGAGTCACTACACGGCGGCCAAGGCG
GGCCTGGAAGGCTTCGCCCGCTCGGCCGCGAAGGAGCTGGGCGGACGCGGGGTGCGCGTC
AACGTGATCGCACCCGGAGTGATCGACAGCGACGACGCCAAGGCGATCCCGGCCGAACAA
CGCGCCCAACTGGTCGCCCGTTACGGCGACAAGACCGCGCTCGGGCGGCTCGGCGAGCCG
GATGAGATCGCCGGCGCCGCGGTCTTCCTCGCCGGCGACCTCTCCTCATACGTGACAGGC
CAGACGATCAACGTGGACGGGGGGATCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002198 Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (Family)
[84-95] 3.49999851148921e-07 PR00080 [155-174] 3.49999851148921e-07 PR00080
PR00080   SDRFAMILY
IPR002347 Glucose/ribitol dehydrogenase (Family)
[9-26] 1.20000117458134e-36 PR00081 [84-95] 1.20000117458134e-36 PR00081 [155-174] 1.20000117458134e-36 PR00081 [176-193] 1.20000117458134e-36 PR00081 [213-233] 1.20000117458134e-36 PR00081
PR00081   GDHRDH
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[3-248] 1.29999999999998e-78 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
IPR020904 Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site (Conserved_site)
[142-170] PS00061
PS00061   ADH_SHORT
SignalP
[1-32] 0.408 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
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