Chart_00040 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces chartreusis
Strain	HKI-249
Entry name	Chartreusin
Contig	AJ786382
Start / Stop / Direction	4,169 / 3,402 / - [in whole cluster] 4,169 / 3,402 / - [in contig]
Location	complement(3402..4169) [in whole cluster] complement(3402..4169) [in contig]
Type	CDS
Length	768 bp (255 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	putative cyclase
Product (GenBank)	ChaG protein
Gene
Gene (GenBank)	chaG
EC number
Keyword	2nd and 3rd ring
Note	The N-terminal position was modified from original INSDC entry.
Note (GenBank)
Reference	ACC Q4R0M8 PmId [15911378] Biosynthesis of the antitumor agent chartreusin involves the oxidative rearrangement of an anthracyclic polyketide. (Chem Biol. , 2005) comment chartreusin生合成clusterの解析論文。異種性にclusterを発現してchartreusin産生を確認。 ChaG: Cyclase (2nd + 3rd ring) 配列解析に基づき、機能予測している。線状polyketidesの2つめ（とおそらく3つめも）のcomplete cyclizationに必要なタンパクに似ている。
Related Reference	ACC Q9RN54 NITE Nogl_00250 PmId [11683270] The entire nogalamycin biosynthetic gene cluster of Streptomyces nogalater: characterization of a 20-kb DNA region and generation of hybrid structures. (Mol Genet Genomics. , 2001) [12715874] Studies on a second and third ring cyclization in anthracycline biosynthesis. (J Antibiot (Tokyo). , 2003) comment Blast 3rd, id67%, 2e-93 Streptomyces nogalater_snoaM Putative polyketide cyclase -- [PMID: 11683270](2001) S. nogalater genomic DNA fragmentの配列解析と、異種性発現による産物解析。 nogalamycin生合成に関する20ORFsが明らかになった。 snoaM: polyketide cyclase snoaMは、aknW, orf1, dpsY, mtmYなどpolyketide cyclaseと有意な類似性あり。 promoter下にsnoaMを含むplasmid pSYE66は、S.peucetius mutant D2を相補し、D2の特徴的な産物である間違って環化されたanthracycline代謝産物(UWM5)の代わりに、anthracycline glycosidesを産生させることができる。 --- [PMID: 12715874](2003) cyclase gene_dpsYにpoint mutationがあるanthracycline非産生Streptomyces peucetius mutant D2は、putative cyclase gene S. galilaeus_aknWまたはS. nogalater_snoaMを含んだplasmidで相補され、daunomycinsを産生した。内在性cyclaseを持つS. lividans TK24株でsnoaMを含んだplasmidを発現すると、10倍のauramycinoneを産生をもたらした。内在性活性による影響のないS. coelicolor CH999では、snoaMを含んだplasmidでのみ、auramycinoneが形成される。
	ACC Q9L4U2 NITE Acla_00250 PmId [12715874] Studies on a second and third ring cyclization in anthracycline biosynthesis. (J Antibiot (Tokyo). , 2003) comment Blast 4th, id64%, 1e-92 Streptomyces galilaeus_aknW Putative cyclase 異種性遺伝子発現によるanthracycline生合成での2nd and 3rd ring cyclizationの研究に焦点を合わせた論文。 cyclase gene_dpsYにpoint mutationがあるanthracycline非産生Streptomyces peucetius mutant D2は、putative cyclase gene S. galilaeus_aknWまたはS. nogalater_snoaMを含んだplasmidで相補され、daunomycinsを産生した。
	ACC O68500 NITE Adria_00160 PmId [9573189] The Streptomyces peucetius dpsY and dnrX genes govern early and late steps of daunorubicin and doxorubicin biosynthesis. (J Bacteriol. , 1998) [10419974] The Streptomyces peucetius dpsC gene determines the choice of starter unit in biosynthesis of the daunorubicin polyketide. (J Bacteriol. , 1999) comment Blast 13th, id60%, 6e-87 Streptomyces peucetius_dpsY Polyketide cyclase -- [PMID: 9573189](1998) daunorubicin(DNR),doxorubicin(DXR)生合成に関与。mutantが別の変換体であるUWM5を蓄積することから、合成系初期の12-deoxyaklanonic acid(aklanonic acid)形成反応を触媒すると考えられる。 -- 同じ著者らの続報 [PMID: 10419974](1999) pWHM1011: tcmJ+dpsABCDGEF = UWM5 pWHM1012: tcmJ+dpsABCDGEFY = AA dpsYがないとshunt産物UWM5産生。 dpsYがあるとaklanonic acid(AA)産生。

Sequence

>putative cyclase [ChaG protein]
MRLIDLSSPIDATSWEPDPIEHSIMTPAQGARHLVAEMEQHFGLSLDPDDLPDGEFLNND
TLTLTTHVGTHVDAPTHYGSTAAYGKPKTIDQVPLEWFYRPGVVLDLTAAGVGSVDARFI
AAELDRVGHEVRPYDIVLLRTGAEEWSGTQRYFTDFTGLDGSAVHYLLDLGVRVIGTDAF
SLDAPFTHIMERYADTGDRALLWPAHFAGREREYCQIERLANLGALPSSGFSVVCFPVRV
ARAGAGWARAVAVLD

>putative cyclase [ChaG protein]
ATGCGCCTGATCGACCTGTCCTCCCCGATCGACGCCACGTCATGGGAGCCGGACCCGATC
GAGCACTCGATCATGACCCCGGCGCAGGGGGCCCGGCACCTGGTCGCGGAGATGGAGCAG
CACTTCGGCCTGTCCCTGGACCCCGACGACCTGCCGGACGGCGAGTTCCTCAACAACGAC
ACGCTGACCCTGACGACCCACGTCGGCACCCATGTCGACGCCCCGACCCACTACGGCTCC
ACGGCGGCGTACGGGAAGCCGAAGACCATCGACCAGGTACCGCTGGAGTGGTTCTACCGT
CCGGGCGTGGTGCTGGACCTCACGGCGGCCGGCGTGGGGAGCGTCGACGCCCGCTTCATC
GCCGCCGAGCTCGACCGCGTCGGGCACGAGGTGCGGCCGTACGACATCGTGCTGCTGCGC
ACGGGGGCCGAGGAGTGGAGCGGTACGCAGCGCTACTTCACGGACTTCACCGGGCTGGAC
GGGTCGGCCGTGCACTACCTCCTCGACCTGGGGGTCCGGGTCATCGGCACGGACGCGTTC
AGCCTCGACGCCCCGTTCACCCACATCATGGAGCGCTACGCCGACACCGGGGACCGGGCT
CTGCTGTGGCCGGCGCACTTCGCGGGCCGGGAGCGGGAGTACTGCCAGATCGAGCGACTG
GCCAATCTCGGTGCCCTGCCCTCCTCCGGTTTCTCGGTCGTCTGCTTCCCGGTGCGGGTC
GCCCGTGCCGGAGCGGGCTGGGCACGCGCTGTCGCGGTCCTCGATTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR007325 Putative cyclase (Family) PF04199 Cyclase
SignalP	Bacteria, Gram-positive
TMHMM	No significant hit

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