Chart_00020 Chart_00020   Chart_00040 Chart_00040

Chart_00030 : CDS information

close this sectionLocation

Organism
StrainHKI-249
Entry nameChartreusin
Contig
Start / Stop / Direction3,360 / 2,239 / - [in whole cluster]
3,360 / 2,239 / - [in contig]
Locationcomplement(2239..3360) [in whole cluster]
complement(2239..3360) [in contig]
TypeCDS
Length1,122 bp (373 aa)
Click on the icon to see Genetic map.

close this sectionAnnotation

Category2.3 modification addition of sugar moiety
Productputative glycosyltransferase
Product (GenBank)ChaGT2 protein
Gene
Gene (GenBank)chaGT2
EC number
Keyword
  • D-digitalose
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[15911378] Biosynthesis of the antitumor agent chartreusin involves the oxidative rearrangement of an anthracyclic polyketide. (Chem Biol. , 2005)
comment
chartreusin生合成clusterの解析論文。
異種性にclusterを発現してchartreusin産生を確認。

ChaGT2: Glycosyl transferase

配列解析に基づき、2つめのsugar moiety(NDP-digitalose)を付着させるGlycosyl transferaseであると予測されている。

ChaGT2は知られた二次代謝経路由来のGlycosyl transferaseにとても低い類似性しか示さない。
1,2-glycosidic linkagesが普通である細胞壁合成に関連したGlycosyl transferaseに似ている。
ChaGT2は二次代謝で前例のない2-glycosyl transferaseを示すだろうから、この結果は当然である。
Related Reference
ACC
Q9T1D6
PmId
comment
Blast list外、id37.29%, 3e-49
Shigella phage SfX_gtrB
Bactoprenol glucosyl transferase(EC 2.4.1.-)

Shigella flexneriの生産するO-antigen modificationに関与するgeneのひとつ(clusterに含まれる)。
UDP-glucoseのglucoseをlipid carrierへ移す。in vitroで酵素活性確かめている。

close this sectionSequence

selected fasta
>putative glycosyltransferase [ChaGT2 protein]
MRTDAETPQAHDTPDLYRALALGDYVLGRTPLHIAARTAGFSADEMLRLVRSRVDVPADP
APGPPGPREPLLSVVVPVFNNATTLRELHRRLRGALTPIGTFEILFVDDGSIDGSADLIG
ELHREDPSVRLLRLSRNFGQQAALSAGLDVARGAAVVMLDADLQDPPELIGDLVERWRAG
HEVVYMVRRNRKEGPLKRLAYAVFYRVFRYLADIEVPLSSGDFALLDRRVVAVLRSMPER
SRFLRGLRSWSGFRQAAVEYDRARRPSGESQYTLRRLAKLAADGLLGFSSVPLRLVSTLG
LATAAAGAVMVVLVLLARLSALSLPVGWASTISVVLLVGGAQLTTIGMVGAYIARIYHEV
KKRPLYIVMERLG
selected fasta
>putative glycosyltransferase [ChaGT2 protein]
ATGCGCACCGACGCCGAAACGCCCCAGGCACACGACACGCCCGACCTGTATCGCGCGCTC
GCCCTGGGTGACTACGTGCTGGGCCGGACGCCCCTGCACATCGCCGCCCGGACCGCCGGA
TTCTCCGCCGACGAGATGCTGCGCCTGGTGCGCTCACGCGTCGACGTTCCGGCCGACCCG
GCACCAGGCCCTCCCGGACCCCGGGAGCCGCTGCTGTCGGTGGTCGTCCCGGTCTTCAAC
AACGCCACCACCCTGCGTGAACTGCACCGCCGTCTGCGCGGGGCGCTCACCCCGATCGGC
ACCTTCGAGATCCTGTTCGTCGACGACGGCAGCATCGACGGCTCGGCCGACCTCATCGGC
GAACTGCACCGCGAGGACCCGTCGGTCCGGCTGCTCCGGCTGTCGCGCAACTTCGGCCAG
CAGGCGGCCCTGAGCGCCGGGCTGGACGTCGCCCGGGGCGCGGCGGTCGTCATGCTGGAC
GCCGACCTCCAGGACCCGCCCGAGCTGATCGGCGACCTCGTCGAGCGCTGGCGGGCGGGC
CACGAGGTCGTCTACATGGTCCGCAGGAACCGCAAGGAAGGGCCGCTCAAGCGCCTGGCC
TACGCGGTCTTCTACCGGGTCTTCCGATACCTCGCGGACATCGAAGTGCCCCTGTCCAGC
GGGGACTTCGCGCTCCTGGACCGCCGTGTGGTGGCCGTGCTGCGCTCGATGCCGGAGCGC
AGCAGGTTCCTGCGCGGGTTGCGCAGCTGGTCGGGGTTCCGGCAGGCCGCCGTCGAGTAC
GACCGCGCCCGCCGGCCGTCCGGCGAGTCCCAGTACACCCTGCGCCGGCTGGCCAAGCTC
GCCGCGGACGGACTGCTCGGCTTCTCCAGCGTTCCGCTGCGGCTGGTGTCCACGCTCGGC
CTCGCGACCGCCGCCGCCGGAGCCGTGATGGTGGTCCTGGTGCTGCTGGCCCGGCTCAGC
GCCTTGTCGCTGCCGGTGGGCTGGGCCTCCACGATCTCCGTGGTCCTCCTCGTCGGCGGA
GCCCAGCTCACCACCATCGGCATGGTCGGCGCCTACATCGCGCGGATCTACCACGAGGTC
AAGAAACGTCCTCTGTACATCGTCATGGAACGGCTGGGGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001173 Glycosyl transferase, family 2 (Domain)
[73-231] 1.3e-26 PF00535
PF00535   Glycos_transf_2
SignalP
[1-37] 0.048 Signal
Eukaryota   
TMHMM
[295-317] Transmembrane (i-o) [332-354] Transmembrane (o-i)
Transmembrane 2   
Chart_00020 Chart_00020   Chart_00040 Chart_00040
Page top