Chart_00215 : CDS information

close this sectionLocation

Organism
StrainHKI-249
Entry nameChartreusin
Contig
Start / Stop / Direction18,677 / 19,348 / + [in whole cluster]
18,677 / 19,348 / + [in contig]
Location18677..19348 [in whole cluster]
18677..19348 [in contig]
TypeCDS
Length672 bp (223 aa)
Click on the icon to see Genetic map.

close this sectionAnnotation

Category3.3 modification reduction
Productputative NAD(P)H--quinone oxidoreductase
Product (GenBank)
GenechaX
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
  • two-component system
  • hydroxylate
Note
Note (GenBank)
Reference
PmId
[15911378] Biosynthesis of the antitumor agent chartreusin involves the oxidative rearrangement of an anthracyclic polyketide. (Chem Biol. , 2005)
comment
ChaXとして登録されている(Q4R0L1)は、読み枠が間違っている。

---
[PMID: 15911378](2005)
chartreusin生合成clusterの解析論文。
異種性にclusterを発現してchartreusin産生を確認。

ChaX: Hydroxylase

配列解析に基づき、機能予測している。
putative hydroxylases AclQ, SnoaWに似ている。
Related Reference
ACC
Q9RN62
NITE
Nogl_00170
PmId
[22633406] SnoaW/SnoaL2: a different two-component monooxygenase. (Chem Biol. , 2012)
[22633415] Discovery of a two-component monooxygenase SnoaW/SnoaL2 involved in nogalamycin biosynthesis. (Chem Biol. , 2012)
comment
Blast 5th, id58%, 2e-49
Streptomyces nogalater_snoaW
Putative hydroxylase
[DoBISCUIT]NAD(P)H--quinone oxidoreductase

---
[PMID: 22633415](2012)
Comment in [PMID: 22633406](2012)

snoaL2 または snoaWの不活化による産物解析から、1-OH化にはSnoaW/SnoaL2の両方が必要であることがわかった。

精製されたSnoaW/SnoaL2を使ったvitroでの実験、hydroperoxy intermediateの存在を確認するH2O2の検出から、

1) 非定型SDR酵素 SnoaWがmonoglycosylated anthracycline substrate(3',4'-demethoxy-nogalose-nogalamycinone) → dihydroquinoneへの還元をする

2) 酸素との反応のために基質を活性化し、hydroperoxy intermediateを形成する

3) hydroxylase SnoaL2によってプロトン化して最終産物(3',4'-demethoxy-nogalose-1-hydroxy-nogalamycinone)を得る

という新しいtwo-component monooxygenase systemを提唱している。
この反応はO2とNAD(P)Hの存在下で起こる。

SnoaWは基質としてnogalamycinone aglyconeよりmonoglycosylated anthracyclineを好むので、nogalamycin生合成におけるC-1 hydroxylationはある程度後期段階で発生する。

close this sectionSequence

selected fasta
>putative NAD(P)H--quinone oxidoreductase
MTYLVTGASGHVGREVTRQLAAAGHEVRAMTRTPGRTPAPDDVEVVAGDLTRPDSLDEAL
RGIERMYLFPVPETASEVVARAVRAGVRRIVVLSSSSVHDETTHSGAHHRAVERAVEDSG
VEWTFVRPDEFANNLLWKWGHSIRAEGVVRAPYPEARRALIHERDVAAVAAAALMTDGHA
GARYELTGPELLDQPEQVARIAGVTGTGIRFEEVTPRGRAGGE
selected fasta
>putative NAD(P)H--quinone oxidoreductase
ATGACGTATCTGGTGACCGGCGCGTCAGGACACGTCGGCAGAGAGGTGACACGGCAATTG
GCGGCGGCGGGGCACGAAGTGCGGGCGATGACCCGTACCCCGGGGCGGACCCCCGCCCCC
GACGACGTAGAGGTCGTCGCCGGCGACCTGACCCGGCCGGACAGCCTGGACGAGGCGTTG
CGGGGGATCGAGCGGATGTATCTGTTCCCGGTGCCGGAGACGGCGTCCGAAGTCGTCGCA
CGGGCGGTGCGGGCCGGCGTGCGCCGCATCGTGGTGCTGTCGTCCAGCTCGGTGCACGAC
GAGACCACCCACAGCGGGGCCCACCACCGGGCAGTGGAACGCGCCGTCGAGGACAGCGGC
GTCGAGTGGACCTTCGTACGGCCCGACGAGTTCGCCAACAACCTGCTGTGGAAGTGGGGG
CACTCGATCCGCGCCGAGGGCGTGGTCCGTGCTCCGTATCCCGAGGCCCGGCGCGCGCTG
ATCCACGAGAGGGACGTGGCGGCGGTGGCGGCCGCGGCCCTGATGACGGACGGTCACGCC
GGCGCCCGCTACGAGCTGACCGGACCAGAACTGCTGGACCAGCCGGAGCAGGTCGCCCGT
ATCGCCGGGGTCACGGGCACCGGCATCCGCTTCGAGGAGGTGACCCCGCGGGGCCGCGCG
GGAGGAGAATGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09
show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
 [1-190]  1.4e-43 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   no description
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Page top