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Chth_00080 : CDS information

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Organism
StrainDSM 40725
Entry nameChlorothricin
Contig
Start / Stop / Direction12,179 / 11,913 / - [in whole cluster]
12,179 / 11,913 / - [in contig]
Locationcomplement(11913..12179) [in whole cluster]
complement(11913..12179) [in contig]
TypeCDS
Length267 bp (88 aa)
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Category3.4 other modification
Productacyl carrier protein
Product (GenBank)ChlB2
Gene
Gene (GenBank)chlB2
EC number
Keyword
  • 5-chloro-6-methyl-O-methylsalicylic acid
  • modification base
Note
Note (GenBank)
  • discrete ACP
Reference
ACC
PmId
[16793515] Genetic characterization of the chlorothricin gene cluster as a model for spirotetronate antibiotic biosynthesis. (Chem Biol. , 2006)
[19266533] Dissection of two acyl-transfer reactions centered on acyl-S-carrier protein intermediates for incorporating 5-chloro-6-methyl-O-methylsalicyclic acid into chlorothricin. (Chembiochem. , 2009)
comment
[PMID: 16793515](2006)
chlorothricin(CHL) gene clusterに関する文献。

chlB2(88 aa): discrete ACP
chlB2 自体の機能解析は行われていないが、相同性よりdiscrete ACP proteinであると予想している。

---
[PMID: 19266533](2009)
異種性発現、精製したChlB1 ACP domain, ChlB2, ChlB3, ChlB6を使い、ChlB1(PKS)-ACPからChlB2(ACP)への6-methylsalicylyl transferがChlB3によるものであり、ChlB6ではできないことをHPLCで確認している。6-methylsalicylic acid(6-MSA)では活性が検出されないので、ChlB1(PKS)-ACPから6-MSAとして放出されることなく、直接ChlB2(ACP)へ移動される。
Related Reference
ACC
Q9X3R0
NITE
Pyolu_00030
PmId
[11880032] Conversion of L-proline to pyrrolyl-2-carboxyl-S-PCP during undecylprodigiosin and pyoluteorin biosynthesis. (Chem Biol. , 2002)
comment
<PltL, Pseudomonas fluorescens, BLAST 6; id=36%>

PltLをクローニング、E.coliで過剰発現。非特異的なB.subtilisのPPTaseであるSfpと共に発現するとholo-PCPが得られた。
holo-PCP(PltL)がPltFによってaminoacylateされることも確認。

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selected fasta
>acyl carrier protein [ChlB2]
MTAEEYAAKLIPFIQENLLPKDSGITVDASTPLLELGVLDSLKTAILMNYIRGELGVVIP
PEQLSSSNFASPGTIVTVIHDLAASNAG
selected fasta
>acyl carrier protein [ChlB2]
ATGACAGCAGAAGAATACGCGGCGAAACTCATCCCGTTCATTCAGGAGAACCTTCTGCCG
AAGGACTCCGGCATCACGGTGGACGCCTCGACGCCGCTTCTGGAGCTGGGAGTTCTCGAC
TCGCTCAAGACGGCGATCCTGATGAACTACATACGCGGCGAACTGGGCGTCGTCATCCCT
CCCGAGCAGCTCAGCAGCAGCAATTTCGCCTCGCCCGGGACCATCGTCACGGTCATCCAC
GACCTCGCCGCCTCGAACGCCGGCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
[2-83] 7.60000011115813e-08 SSF47336
SSF47336   ACP_like
[26-65] 4.5e-06 PF00550
PF00550   PP-binding
[4-82] 2.9e-12 G3DSA:1.10.1200.10
G3DSA:1.10.1200.10   ACP_like
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Chth_00070 Chth_00070   Chth_00090 Chth_00090
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