Halsto_00010
Halsto_00020 : CDS information
Location
| Organism | Streptomyces halstedii |
|---|---|
| Strain | HC34 |
| Entry name | Halstoctacosanolide |
| Contig | AB241068 |
| Start / Stop / Direction | 13,667 / 35,002 / + [in whole cluster] 13,667 / 35,002 / + [in contig] |
| Location | 13667..35002 [in whole cluster] 13667..35002 [in contig] |
| Type | CDS |
| Length | 21,336 bp (7,111 aa) |
Annotation
| Category | 1.1 PKS |
|---|---|
| Product | polyketide synthase |
| Product (GenBank) | type I polyketide synthase |
| Gene | |
| Gene (GenBank) | hlsB |
| EC number | |
| Keyword | |
| Note | |
| Note (GenBank) | |
| Reference |
|
PKS/NRPS Module
| 3 |  | malonyl-CoA |
| 4 |  | methylmalonyl-CoA |
| 5 |  | methylmalonyl-CoA |
| 6 | | malonyl-CoA |
Sequence
>polyketide synthase [type I polyketide synthase] MADEEKLQYFLRKVTVDLRESRHRVKELEGRWAEPLAVVGMACRFPGGVNSPEQLWDFVL DGRDGISGFPTERGWDLDSLYHPDPDHPGTSYASEGGFLHDAGEFDPAFFGISPREALAM EPQQRLLLQTSWEAIENAGIDPLSLKGSRTGVFVGAINQEYGPRLYDAAPDDNVEGYLLT GTANSVVSGRVAYVLGTEGPALTVDTACSSSLVALHLAGQALRQDECSMALVGGVTVMTT PTGFVEFSRQRGLAADGRCKSFAAAADGTGWAEGVGVLVVERLSDAQRLGHPVLAVIRSS AVNQDGASNGLTAPNGPSQQRVIRQALAAADLSSADVDVVEAHGTGTALGDPIEAQALLA TYGQNRPEDRPLRLGSIKSNIGHTQAAAGVAGVIKMVMALRHGVLPATLHVDGPTPHVDW TSGAVELLADTTVWPEVDRPWRAAVSSFGISGTNAHTIIEQAPPVEVGAPEPAVKGNVLV PWVVSGRGADALRAQAARLREWVLEHPEHRLVDVGHSLVVSRSAFEDRVVVLGSDRDALL DGLAAAAQGEPGPGVVVGSSAGAGGGVAFLFTGQGAQRLGMGHELAARFPVFASALDEVC VQLDAHLERPLREVLFAEPDTEAAALLDETVFTQAALFAVEVALYRLVESWSLTPDYLLG HSVGGLAAAHVAGVLSLEDAAEVVVARGRLMQALPKGGAMVSLQASEDEVLESLSGLVSI AAVNGPQAVVISGDEDAVTAVAEEWRARGRKVKRLTVSHAFHSALMEPMLATFEQVLSRV TLNAPRIPVISDSTGLPLTPEQATSPAYWTGHVRNPVLFHQAVTHLTEQGVSAFLELGPD GVLSAMTRTSVVGRDNTVVTPLLRADRDEPYSALTALAELYVNGTHVDFRAVQEGTGARL 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>polyketide synthase [type I polyketide synthase] ATGGCTGACGAGGAAAAGCTCCAGTACTTCCTGCGCAAGGTCACCGTTGACCTTCGGGAG AGCCGTCACCGGGTCAAGGAGTTGGAGGGCCGCTGGGCCGAGCCGCTGGCTGTGGTGGGC ATGGCCTGCCGCTTCCCCGGCGGTGTGAACTCCCCGGAACAGCTGTGGGATTTTGTACTT GATGGCCGGGACGGCATATCGGGATTCCCCACCGAGCGTGGCTGGGACCTCGATTCGCTC TATCACCCGGATCCGGACCACCCGGGAACCTCTTACGCCTCCGAAGGCGGATTCCTCCAT GACGCCGGGGAGTTCGACCCCGCCTTCTTCGGGATTTCGCCGCGTGAGGCGCTGGCGATG GAGCCGCAGCAGCGGCTGCTGCTCCAGACCAGTTGGGAAGCGATCGAGAACGCCGGAATC GACCCCCTCTCCCTCAAGGGCAGCAGGACCGGTGTCTTCGTCGGCGCCATCAACCAGGAA TACGGCCCCCGCCTCTACGACGCCGCGCCGGACGACAACGTCGAGGGCTATCTGCTGACC GGTACCGCCAACAGCGTGGTCTCCGGACGGGTGGCGTATGTCCTCGGCACCGAGGGCCCG GCCCTCACGGTGGACACGGCGTGTTCGTCTTCGCTGGTGGCCCTGCACCTAGCCGGTCAG GCACTGCGGCAGGACGAGTGCTCGATGGCGCTGGTCGGCGGTGTCACCGTGATGACCACA CCGACGGGATTCGTGGAGTTCAGCCGTCAGCGGGGTCTGGCGGCGGATGGCCGGTGCAAG TCGTTCGCGGCGGCTGCGGATGGTACGGGTTGGGCCGAGGGCGTCGGCGTGCTCGTGGTC GAGCGGCTGTCGGACGCGCAGCGACTGGGTCACCCCGTGCTGGCGGTGATCCGTTCGAGT 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Feature
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IPR013154 Alcohol dehydrogenase GroES-like (Domain)
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IPR014043 Acyl transferase (Domain)
IPR015083 Polyketide synthase, docking (Domain)
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IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain)
IPR016039 Thiolase-like (Domain)
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IPR018201 Beta-ketoacyl synthase, active site (Active_site)
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IPR020806 Polyketide synthase, phosphopantetheine-binding domain (Domain)
IPR020807 Polyketide synthase, dehydratase domain (Domain)
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