Halsto_00040 : CDS information
Location
Organism | Streptomyces halstedii |
---|---|
Strain | HC34 |
Entry name | Halstoctacosanolide |
Contig | AB241068 |
Start / Stop / Direction | 50,682 / 66,650 / + [in whole cluster] 50,682 / 66,650 / + [in contig] |
Location | 50682..66650 [in whole cluster] 50682..66650 [in contig] |
Type | CDS |
Length | 15,969 bp (5,322 aa) |
Annotation
Category | 1.1 PKS |
---|---|
Product | polyketide synthase |
Product (GenBank) | type I polyketide synthase |
Gene | |
Gene (GenBank) | hlsD |
EC number | |
Keyword | |
Note | |
Note (GenBank) | |
Reference |
|
PKS/NRPS Module
10 | methylmalonyl-CoA | |
11 | malonyl-CoA | |
12 | malonyl-CoA |
Sequence
>polyketide synthase [type I polyketide synthase] MSNEDRLRHFLNEVTSELIDTRQRLNDVTAAAEEPLAIVGMACQYPGDVRSPEDLWKLVA EGRDGISEFPTERGWDVDGLYHPDPEHQGTSYTREGGFLHRAGEFDAGFFGISPREALAM DPQQRLLLETSWEAIESAGIDPLSLKGSSTGVFTGVMYHDYSTQLRTVPDGVEAFLGTGN AGSVVSGRIAYVLGAEGPAVTIDTACSSSLVALHLACQALRQGDCTMALAGGVTVMATPG TFVDFSRQRGLAVDGRCKSFAAAADGTGWAEGVGVLVVERLSDAERLGHPILAVVRSSAV NQDGASNGLTAPNGPSQERVIRQALSAAGLSTADVDAVEAHGTGTNLGDPIEAQALLATY GQGRPEGRPLRLGSLKSNIGHTQAAAGVAGVIKMVMALRHGVLPATLHVDEPTPHVDWAS GAVELLTEAMPWPEVGRPRRAAVSSFGISGTNAHIVVEQAPESQIEVAASREETPAGSVA WVVSGHGVDGVQAQAARLREWVLEHPQHSVTDIGFSLLSSRSLHRDRLVVLGSDRQVLVD GLAAAAEGSPWPGLVQSSGDVSLNRAVFVFPGQGSQWVGMGRELYASSPVFRARLDECAA ALDPLVEWSLIDVVRGGSGAPGLERVDVVQPVLWAVMVSLAAVWESWGVVPAAVVGHSQG EIAAACVAGALSVEDAARVVALRSRAVRAMAGDGAMVSVALPAAEAEALTGDGVSLAAVN GPSSVVLSGDRSALTPVVEGLTAQGVRTKWVPVDYASHSAHMDRIHDELLEILSGIEPKT SRIPLYSTVSAEVIDTSVMDAGYWFDNIRGTVRFHETVQALITDGLTAFVEISPHPVLAM SVQDTLDQAEATGLSIGTLRRDENEHETFLTAAAQLFVAGLSIDWHTAAFADLDTRRVDL 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>polyketide synthase [type I polyketide synthase] ATGAGCAACGAAGACCGACTTCGGCATTTCCTCAACGAAGTGACCTCCGAGCTGATCGAC ACGCGTCAGCGGCTCAATGACGTCACGGCCGCCGCTGAAGAGCCACTGGCTATTGTGGGA ATGGCCTGCCAATATCCAGGTGATGTAAGGTCGCCGGAGGACCTGTGGAAATTGGTCGCC GAGGGACGCGACGGGATATCCGAGTTCCCGACGGAACGCGGCTGGGACGTGGACGGTCTC TACCACCCCGACCCGGAGCACCAGGGCACTTCGTACACTCGTGAGGGCGGCTTCCTGCAC CGCGCCGGTGAGTTCGATGCGGGCTTCTTCGGGATCTCGCCGCGTGAGGCGCTGGCGATG GACCCCCAGCAGCGTCTCCTCCTGGAAACCTCCTGGGAGGCGATCGAGAGCGCGGGAATC GACCCGCTCTCCCTGAAGGGCAGCTCGACCGGTGTCTTCACCGGTGTCATGTACCACGAC TACTCGACCCAACTGCGGACCGTGCCCGATGGAGTCGAGGCATTCCTCGGCACGGGCAAC GCGGGCAGTGTCGTGTCCGGGCGAATCGCCTATGTGCTCGGCGCCGAGGGCCCGGCAGTG ACCATTGACACGGCCTGCTCATCGTCCCTGGTAGCCCTGCATTTGGCATGTCAGGCCCTG CGCCAGGGCGACTGCACCATGGCGCTGGCCGGTGGTGTCACCGTGATGGCGACGCCGGGA ACATTTGTGGATTTCAGCCGTCAGCGGGGTCTGGCGGTGGACGGCCGGTGCAAGTCCTTC GCCGCCGCTGCGGACGGTACCGGCTGGGCCGAGGGCGTCGGTGTACTGGTGGTGGAGCGG CTCTCGGACGCGGAGCGCCTGGGCCACCCGATCCTTGCGGTGGTCCGTTCCAGTGCGGTG 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CCTGGTCTGGAGCGGGTGGATGTGGTTCAGCCCGTGTTGTGGGCGGTGATGGTGTCGCTG GCGGCGGTGTGGGAGTCGTGGGGTGTTGTTCCGGCTGCTGTGGTGGGTCATTCGCAGGGT GAGATTGCTGCTGCGTGTGTGGCGGGGGCGCTGTCGGTGGAGGATGCGGCGCGGGTTGTG GCGTTGCGGAGCCGTGCCGTGCGGGCGATGGCGGGTGACGGTGCGATGGTGTCGGTCGCG CTCCCTGCCGCTGAGGCTGAGGCGTTGACCGGGGACGGTGTGTCGCTGGCGGCTGTCAAT GGGCCGTCGTCGGTGGTGCTGTCGGGGGACCGGTCTGCCCTCACTCCCGTGGTGGAGGGA CTGACTGCTCAGGGTGTGCGGACGAAGTGGGTGCCGGTGGACTACGCGTCCCACTCGGCC CATATGGACCGCATCCATGACGAGCTGCTGGAGATCCTGTCCGGGATCGAGCCCAAGACC TCCCGTATCCCGCTCTACTCCACGGTGTCGGCCGAGGTCATCGACACGTCGGTCATGGAT GCCGGCTACTGGTTCGACAACATCCGGGGCACCGTCCGCTTCCACGAGACCGTCCAGGCC CTGATCACCGACGGACTGACCGCCTTCGTGGAGATATCCCCGCACCCCGTCCTGGCGATG AGCGTCCAGGACACCCTTGACCAGGCCGAAGCCACCGGTCTCTCCATCGGAACCCTCCGC CGCGACGAGAACGAACACGAGACCTTCCTCACCGCCGCCGCCCAACTCTTCGTCGCCGGG CTTTCCATCGACTGGCACACGGCCGCCTTCGCCGACCTCGACACCCGCCGAGTCGACCTC CCTACCTACGCCTTCCAACGGGATCACTACTGGTTGCCCGCCGGCGGTGGGCAGACTGGT GACGCGGGATCGTTGGGCCTGGGCGCGGTCGGACACCCTCTGCTGGGCGCGGCCGTGTCG 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ACTGCCGAGCAGGCCACGTCTCCCGCGTACTGGGTTGGGCATGTCCGTAAGCCCGTCCGA TTCCACCAGGCGGTGACCTACCTCGCCGAGCAGGGTGTTAGTGCCTTCCTGGAGTTGGGC CCTGATGGTGTGCTCAGCGCCATGGTGCGGAACAGCCTGGTCGATGGCGAGGTGATTGCC ACGCCGTTGCTGCGGTCCGGGCGTGCGGAGCCTGAGACGGCGTTGACGGCGCTGGCCGAG CTGTTTGTCGCGGGTGTGGCGGTGGAGTGGTCTGCGGTGCTTGGTGGCGGGGAGAGTGGG CGGCGGGTCGAGCTGCCGACGTACGCCTTCCAACGTGAGAGGTACTGGCTGGAGTCCGGG GCTGCGGCTGCGGCTGAGCCGGCGGTTGGTGGGGTTATCGCCCACGGTATGGATGCTGGT TTTTGGGGTGCGGTGGAGCGGGGGGATGTGGAGGGTTTGGCTGGGGTGTTGGGGTCTGGG GTGTCGGTGGATGTGTGGGGTGAGGTGTTGCCGGAGTTGTCGTCGTGGTGGTTGGGGCGG CGGGCTCGGTCGGTGGTGGAGGGGTGGCGGTATCGGGTGGAGTGGCGTCGGGTGGGTGGT GGGTTGTTGTCGGGTGGTGGTGGGTTGTCGGGGACGTGGGTGGTGGTGGTTCCGGTGGGG GTGGATGTGGGGTTGGTGGATGGGTGTGTGGGTGCGTTGGTGGGGTGTGGTGTGCGGGTG GTTGTGGTGGGTGTGGATGTGGGTGTGTTGGGTGATGTGGAGGGGTTGGGTTCGTTGGTG GTGGGTGGTTTGCCGGAGGGTGTGGGTGTGGGTGATGTGTCGGGTGTGGTGTCGTTGTTG GGGTTGGTGGAGGGGTGGTTTGAGGGGTTGGGTGGTGTGTCGTTGGGTGTGGTGGGGACG TTGGGGTTGGTGCGGGCGTTGGGTGGTGTGGGTGTGGTGGCTCCGTTGTGGTGTGTGACG CGGGGTGCTGTGGGTGTGGGTGGTGGGGATGTGGTGGTGTCTCCGGTGCAGGGTTTGGTG TGGGGGTTGGGTCGGGTGGTGGGTTTGGAGCATCCGGAGCGGTGGGGTGGTGTGGTTGAT CTGCCGGTGTCGGTGGATGGTCGGGGTTGGGAGCGTTTCTGTTCGGTGTTGGCGGGTGGT GGTGAGGATCAGGTGGCGGTGCGGTCGTCGGGTGTGTTCGTACGACGTCTGGTTCCGGCC CCGGCTGCGGTCTCGGGTGGGGGTTGGGTTGGTGGGTTGTCGGGTGGGTCGGTGGTGGTG ACGGGTGGTACGGGTGTGTTGGGTGGTCGTGTGGCGCGTTGGTTGGCCGGGTGTGGTGTG GGTCGTTTGGTGTTGGTGAGTCGTTCGGGTGCTGCGGGTGTGGGTGTTGATGGGTTGGTT GGGGAGTTGGAGGGGTTGGGTGTGGTGGTGGATGTGGTGGCGTGTGATGTTGCGGATCGT GAGGCGATGGCGGGGGTTTTGGGTGGGGTGTCGGGGGAGTTTCCGTTGCGGGCGGTGGTG CATGCGGCGGGTGCGAGTGGGATGGGTGCGTTGGAGGGGTTGGGTGTGGAGGAGTTTGCG GGTGTGGTGGGGGCGAAGGTGGGTGGGGCTGTGGTTTTGGATGAGTTGGTGGGTGGGGTG CCGTTGGTGTTGTTTTCGTCGGGTGCTGGTGTGTGGGGTGGTGGTGGTCAGGGTGCGTAT TCGGCTGCGAATGCGTTTTTGGATGGGTTGGCGGAGTATCGGCGGGGTCGTGGGTTGCCG GCTGTGTCGATCGCGTGGGGCCCGTGGGCCGACGGCGGAATGGCTCATGGACCGGAAGGA TCCCAGGACCAGTTGGTCAGCCGAGGCTTCGTTCCGCTCGATCCCGATATCGCCATCGCG GCGATGGAGGAGGCCATCGAGAAGGACGAGACCACCATCACCGTCGCCGACATCGACTGG GCGAAGTTCTACCCCGCGTTCGCCCTGGCCCGCCCCCGGCCGCTGCTGCACGAAATACCG GAGGTGGCCGCGCTCCTCGCCGAGGATGAGGCCGGCGTCCCCGAGAAGGGAGCCGTATCG GCTCTCGCCGAGCGTCTGAACAGCCTGACCGATGGCGAACAGCGCCAGGCGGTGCTGGAT ATGGTCCGCACGGAAGTAGCCGCCGTGCTCAACCATGCGCATGCCGAGAACATCGTCGAG ACTCGGACATTCCGTGAACTCGGCTTTGACTCACTCACCGCCGTTGAACTGCGTAACCGA CTCAACAGCGCTACAGGGTTGCGGCTTCCGGCAACGCTGATATTCGATTACCCCACCTGC GAGGCGATCTCCGATCATCTGTGCAAGGAACTCCTGGGTAGTTCATTCGGAGCGATGACG ACATCGGCCGTTCAGAGCGATTTCTGGTCGGCACTGCAACAAGTCGACTACCAGAAGCTC CAGGACGCCGGAGTGGTGGCCATGGTCATGGGGCTGCTGGATGGTGAACCGGCCGAGAAG ACCGTGGAAGAGGAGCCGGAGCCCCGACCCGAGATCGATGAGATGGACGCGGTCGAGCTG CTCAATCTGGCTCTCCGCAACAAGATGCAACGCAACTCCGCAGCGGATTCTCAGGGAGAA GAGGGGTAA
Feature
BLASTP Database:UniProtKB:2011_09 |
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InterPro Database:interpro:38.0 |
IPR001227 Acyl transferase domain (Domain)
IPR002364 Quinone oxidoreductase/zeta-crystallin, conserved site (Conserved_site)
IPR006162 Phosphopantetheine attachment site (PTM)
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
IPR011032 GroES-like (Domain)
IPR013149 Alcohol dehydrogenase, C-terminal (Domain)
IPR013154 Alcohol dehydrogenase GroES-like (Domain)
IPR013968 Polyketide synthase, KR (Domain)
IPR014030 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal (Domain)
IPR014031 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (Domain)
IPR014043 Acyl transferase (Domain)
IPR015083 Polyketide synthase, docking (Domain)
IPR016035 Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (Domain)
IPR016036 Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (Domain)
IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain)
IPR016039 Thiolase-like (Domain)
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
IPR018201 Beta-ketoacyl synthase, active site (Active_site)
IPR020801 Polyketide synthase, acyl transferase domain (Domain)
IPR020806 Polyketide synthase, phosphopantetheine-binding domain (Domain)
IPR020807 Polyketide synthase, dehydratase domain (Domain)
IPR020841 Polyketide synthase, beta-ketoacyl synthase domain (Domain)
IPR020842 Polyketide synthase/Fatty acid synthase, KR (Domain)
IPR020843 Polyketide synthase, enoylreductase (Domain)
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SignalP | No significant hit |
TMHMM | No significant hit |