Meili_00250 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces nanchangensis
Strain	NS3226
Entry name	Meilingmycin
Contig	FJ952082
Start / Stop / Direction	57,429 / 58,421 / + [in whole cluster] 57,429 / 58,421 / + [in contig]
Location	57429..58421 [in whole cluster] 57429..58421 [in contig]
Type	CDS
Length	993 bp (330 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	cyclase/dehydratase
Product (GenBank)	post-polyketide modification protein
Gene
Gene (GenBank)	meiC
EC number
Keyword	spiroketal moiety
Note
Note (GenBank)	similar to AveC; MeiC
Reference	ACC Q6YL51 PmId [20348291] Cloning of separate meilingmycin biosynthesis gene clusters by use of acyltransferase-ketoreductase didomain PCR amplification. (Appl Environ Microbiol. , 2010) [23294008] Spiroketal formation and modification in avermectin biosynthesis involves a dual activity of AveC. (J Am Chem Soc. , 2013) comment Meilingmycin Biosynthesis Gene Clustersを同定した文献。 Table1. MeiC(330a.a.): PKS modification meiCに関してはdeletion mutantを作成し、meilingmycin biosynthesisに必須の遺伝子であることが示されている。機能はホモログaveCからの推測のみで、C-23でのketo基の完全還元によって、C-22とC-23の飽和結合を生じるかもしれないとしている。しかし、aveCでも機能は明確に示されていない模様。 --- [PMID: 23294008](2013) abstract: AveCはdihydroxy-ketone polyketide中間体の立体特異的なspiroketalizationと、spiroketal多様性の位置特異的な飽和特性を決定する任意のdehydrationを触媒するdual functionを持つ。 MeiCはAveCのspirocyclase活性を置換できるが、独立したdehydratase活性を欠く。 AveC and MeiCによって媒介されるin vitroでの生体内変換とin vivoでの相補の比較解析、産物同定などで実証している模様。
Related Reference	ACC Q9S0R6 NITE Aver_00060 PmId [10449723] Organization of the biosynthetic gene cluster for the polyketide anthelmintic macrolide avermectin in Streptomyces avermitilis. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 1999) [15721808] Semi-synthetic DNA shuffling of aveC leads to improved industrial scale production of doramectin by Streptomyces avermitilis. (Metab Eng. , 2005) [18824353] Engineering of avermectin biosynthetic genes to improve production of ivermectin in Streptomyces avermitilis. (Bioorg Med Chem Lett. , 2008) [23294008] Spiroketal formation and modification in avermectin biosynthesis involves a dual activity of AveC. (J Am Chem Soc. , 2013) comment <Streptomyces avermitilis_AveC, BLAST 2, id=53%> --- [PMID:10449723](1999) avermectin生合成gene clusterの報告。 AveC: ? 塩基配列解析から、aveCはaveA2と翻訳共役であると示唆される。 aveCのmutationはC22-23でbeta-hydroxy carbonを含むcomponent 2の産生を導くが、AveC推定AA配列とputative dehydrataseのactive site motifの間に相同性はない。したがって、AveCの機能は明らかでない。Postpolyketide修飾に関与するのかもしれない。 --- [PMID: 15721808](2005)abstract aveC shuffled gene(bestは10 mutations)は、avermectin analogであるdoramectin(CHC-B1)のCHC-B2に対する比率を増やす。 --- [PMID: 18824353](2008) aveCの発現量はivermectin(avermectin BのC22-23が還元されている化合物)の収量を左右する。 ivermectin産生株ではaveC発現量が少ない。この株でaveC過剰発現するとivermectin収量は2倍に増える。 avermectin生合成におけるAveCの機能と、AveC and AveA2 DH2 domainとの関係を調査中。 --- [PMID: 23294008](2013) abstract: AveCはdihydroxy-ketone polyketide中間体の立体特異的なspiroketalizationと、spiroketal多様性の位置特異的な飽和特性を決定する任意のdehydrationを触媒するdual functionを持つ。 MeiCはAveCのspirocyclase活性を置換できるが、独立したdehydratase活性を欠く。 AveC and MeiCによって媒介されるin vitroでの生体内変換とin vivoでの相補の比較解析、産物同定などで実証している模様。

Sequence

>cyclase/dehydratase [post-polyketide modification protein]
MTDLVDEDRPEAVGRADTVRGLRVFTLPVTLWACVGALVLGLQVYVFAAWLADSGYRIEK
ASPARGGGDSERIADVLIPLLSVVGAVVLAVCLYRRCRARRRLTFDASLFIGLLSASWQS
PLMNWINPVLASNVNVFGAVASWGPYVPGWQGAGAHQEAELPLATLSICMTAMMAAVACG
KGMGLAAARWPRLGPLRLIALGFLLVVLLDIAEPLVSFAGVSVWTRAVPELTIWSGHWYQ
FPLYQMVASALFGASLGAARHFRNRRGETCLESGTALLPEGPRPWVRLLAVVGGANISIA
LYTGAHILFSLMDGAPPDRLPEFFRPAAGY

>cyclase/dehydratase [post-polyketide modification protein]
ATGACCGATCTCGTCGACGAAGACCGGCCGGAGGCCGTCGGCCGGGCCGATACCGTACGC
GGCCTGCGGGTGTTCACCCTTCCCGTAACACTGTGGGCGTGTGTCGGCGCGCTGGTGCTG
GGACTTCAGGTGTACGTGTTCGCCGCCTGGCTCGCCGACAGCGGCTACCGCATCGAGAAG
GCGTCCCCGGCCAGGGGCGGTGGGGACTCGGAGCGGATCGCCGATGTGCTGATCCCGCTG
CTGTCCGTGGTGGGAGCGGTGGTCCTCGCAGTGTGTCTGTACCGGAGGTGTCGGGCCAGG
AGGCGGCTGACGTTCGACGCGTCGCTCTTCATCGGGCTGCTGTCGGCCAGTTGGCAGAGT
CCCTTGATGAACTGGATCAATCCGGTGCTCGCGTCAAACGTCAATGTGTTCGGAGCGGTG
GCCTCGTGGGGGCCGTATGTGCCCGGTTGGCAGGGGGCGGGGGCGCACCAGGAGGCCGAG
CTGCCGCTGGCGACCCTGAGCATCTGTATGACGGCCATGATGGCCGCCGTGGCCTGCGGC
AAGGGCATGGGTCTTGCCGCCGCCCGGTGGCCGCGGCTGGGGCCGCTCCGGCTGATCGCG
CTCGGCTTTCTGCTCGTCGTGCTCCTCGACATCGCCGAGCCGCTGGTGTCCTTCGCGGGC
GTCTCCGTGTGGACGCGGGCAGTGCCCGAGCTGACCATCTGGAGTGGGCACTGGTATCAG
TTCCCGCTGTATCAGATGGTGGCTTCGGCGCTCTTCGGCGCCTCTTTGGGGGCCGCGCGC
CACTTTCGCAACCGGCGCGGCGAAACGTGTCTGGAGTCCGGGACGGCCCTCCTACCGGAG
GGCCCGAGGCCATGGGTCCGGCTGCTGGCGGTGGTGGGCGGGGCCAACATCAGCATCGCC
CTCTACACCGGCGCACACATCCTGTTCTCGCTGATGGACGGCGCTCCCCCGGACCGGCTC
CCCGAATTCTTCCGTCCGGCGGCCGGCTACTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro	No significant hit
SignalP	Bacteria, Gram-positive Eukaryota
TMHMM	Transmembrane 5

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