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Meili_00910 : CDS information

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Organism
StrainNS3226
Entry nameMeilingmycin
Contig
Start / Stop / Direction182,934 / 183,905 / + [in whole cluster]
182,934 / 183,905 / + [in contig]
Location182934..183905 [in whole cluster]
182934..183905 [in contig]
TypeCDS
Length972 bp (323 aa)
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Category5.1 general function
Productputative carbohydrate kinase
Product (GenBank)carbohydrate kinase
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
  • orf80
Reference
ACC
PmId
[20348291] Cloning of separate meilingmycin biosynthesis gene clusters by use of acyltransferase-ketoreductase didomain PCR amplification. (Appl Environ Microbiol. , 2010)
comment
Meilingmycin Biosynthesis Gene Clustersを同定した文献。

Table1.
Orf80(323 a.a): carbohydrate kinase

Orf80自体の機能実験は無し。
詳細な記載は無く、meilingmycin biosynthesisへの関与は不明。
Related Reference
ACC
P42414
PmId
[18310071] myo-Inositol catabolism in Bacillus subtilis. (J Biol Chem. , 2008)
comment
153rd(P42414) 30%, 6e-38
B.subtilis_iolC
5-dehydro-2-deoxygluconokinase(EC 2.7.1.92)
(2-deoxy-5-keto-D-gluconate kinase)

Bacillus subtilisのmyo-Inositol Catabolismに関する文献。
iolB, iolCを共にE. coliで発現させると5DG存在下でのkinase activityが上昇することを確認している。
また、His-tagを付けたiolBをE. coliで発現させて精製し、5DGを器質とさせたところ5DGの他にDKGも存在していることをNMRによって確認している。故にiolBを5DGからDKGへと変換するisomeraseであるとしている。また、アミノ酸配列の相同性結果も踏まえて、iolCがDKG よりDKGPを生成するkinaseであると結論付けている。

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selected fasta
>putative carbohydrate kinase [carbohydrate kinase]
MPFEVLTMGRVGVDVYPLQTGVGLAEVTSFGKYLGGSPTNVAVAAARYGRTSAVITKTGA
DPFGDFVRTALDGYGVDTRFVGTSDIAPTPVTFCEIFPPDDFPLYFYRLPKAPDLDIHPE
ELGLAAVRDARIFWVTGTGLSEEPSRTATLAALEHRAKAGTTVFDLDWRPMFWKSAAGGD
PAGARAYYAKALRHTTVAVGNLDECEVATGEREPYAAAKALLDAGVELAVVKQGPKGVLA
MDRDGSAVEVPPVPVEVVNGLGAGDAFGGALCHGLLSGWDTRRTVSFANAAGALVAGRLA
CSEAMPTEAEVAAALRETADDGR
selected fasta
>putative carbohydrate kinase [carbohydrate kinase]
ATGCCGTTCGAAGTACTGACCATGGGCCGCGTCGGAGTGGACGTGTATCCGCTCCAAACG
GGCGTGGGGCTGGCCGAGGTCACCTCGTTCGGCAAGTACCTCGGCGGCAGCCCGACCAAT
GTCGCGGTGGCCGCCGCCCGGTACGGGCGCACCTCGGCCGTGATCACCAAGACGGGCGCG
GACCCGTTCGGGGACTTCGTCCGCACGGCCCTGGACGGATACGGCGTCGACACCCGCTTC
GTCGGTACGTCGGATATCGCGCCGACCCCCGTGACCTTCTGCGAGATCTTCCCGCCGGAC
GACTTCCCGCTCTACTTCTACCGGCTGCCCAAGGCACCCGACCTGGACATCCATCCCGAG
GAGCTGGGCCTGGCAGCGGTGCGCGACGCCCGGATCTTCTGGGTCACCGGCACCGGGCTG
AGCGAGGAGCCGAGCCGTACGGCCACCCTCGCCGCGCTCGAGCACCGGGCGAAGGCGGGC
ACGACGGTGTTCGACCTCGACTGGCGGCCCATGTTCTGGAAGAGCGCGGCCGGGGGTGAC
CCCGCCGGGGCCCGTGCTTACTACGCGAAGGCCCTGCGCCACACCACCGTCGCCGTCGGG
AATCTCGACGAATGCGAGGTGGCGACCGGTGAGCGCGAGCCGTACGCCGCCGCGAAGGCG
CTGCTCGACGCCGGGGTGGAGCTGGCCGTGGTCAAGCAGGGCCCGAAGGGTGTGCTGGCC
ATGGACCGGGACGGCTCCGCCGTCGAGGTCCCGCCGGTGCCGGTGGAGGTGGTGAACGGC
CTGGGCGCCGGTGACGCGTTCGGTGGCGCGCTGTGCCACGGGCTGCTGTCCGGCTGGGAC
ACCCGGCGCACGGTGTCCTTCGCCAACGCCGCCGGTGCGCTCGTGGCCGGCCGCCTGGCC
TGCTCGGAGGCGATGCCGACCGAGGCCGAGGTGGCGGCGGCGCTGCGCGAGACGGCCGAT
GACGGCCGATGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR011611 PfkB (Domain)
[5-307] 2.1e-50 PF00294
PF00294   PfkB
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Meili_00900 Meili_00900   Meili_00920 Meili_00920
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