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Oxzol_00010 : CDS information

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Organism
StrainJA3453
Entry nameOxazolomycin
Contig
Start / Stop / Direction5,702 / 6,727 / + [in whole cluster]
5,702 / 6,727 / + [in contig]
Location5702..6727 [in whole cluster]
5702..6727 [in contig]
TypeCDS
Length1,026 bp (341 aa)
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Category5.1 general function
Productputative esterase
Product (GenBank)lipase
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
  • It is supposed that this ORF is not involved in oxazolomycin biosynthesis.
Note (GenBank)
  • ozm orf -6
Reference
ACC
comment
UniProt登録されている[PMID:16707707]ではFigも含め、Oxzol_00010について記載なし。
続報にも見当たらない。
Related Reference
ACC
O52270
PmId
[9464382] ( , )
comment
Pseudomonas sp. B11-1
Lipase(lipP)

クローニングして酵素精製、活性を調べている。

アミノ酸配列は、 Antarctic Moraxella TA144由来のLipase 2 や哺乳類hormone-sensitive　lipaseなどのcold-adapted lipasesが持つGXSXG（GDSAG) motifを保存しており、おそらくActive siteはSerであると推測をしている。<=Rever_00220もGDSAG(150-154)で保存されている。

また、Zn2+, Cu2+, Fe3+,　Hg2+で活性阻害を受けることや、酵素の温度依存性に関しても調べている。
ACC
Q8NKS0
PmId
comment
Pyrobaculum calidifontis
Esterase(Pc-est)

超好熱古細菌のesteraseを分離、アミノ酸配列を調べたところmammalian hormone-sensitive lipasesと30%の相同性があった。
lipase活性を調べたが、esteraseとの明確な差異が分からなかった。
carboxylesteraseとタイトルではしているが、最終的にはesteraseで落ち着いている。

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selected fasta
>putative esterase [lipase]
MEADVPPARERPVLERRTRAFAEAYACPPVGTSDEAASRTRMAALWDGGGLDEPDVEEEW
LALPGPDGERVRVRILRPAGAAGTPGAPGTPGAAGREEEPLPVVLYLHALGWMLTDAYAH
RQLLSDLVLGADAAVVVPEYEGPRDARHPHAVERAHTVARWLARHGAECGLDGSRMAVVG
ASAGAQQAAALTLVARERGGPHLRHQVLVCPVTDAAMDTPSYRHFEDGYFLGRSAMRGYW
QRYAPDRASRADGVVSPLRAPLGGLRGLPPALVLTAEADVLRDEGEAYAARLREADVPVV
SIRYQGTIHGFLLFDLLRATEASRAARIQVTDTLHAALHGA
selected fasta
>putative esterase [lipase]
GTGGAAGCAGACGTTCCCCCCGCCAGGGAGAGACCTGTCCTCGAACGGCGGACGCGGGCC
TTCGCCGAGGCGTACGCCTGCCCCCCGGTGGGAACGTCCGACGAGGCCGCGTCCCGTACG
CGCATGGCGGCGCTCTGGGACGGGGGCGGTCTCGACGAACCGGACGTCGAGGAGGAGTGG
CTGGCCCTGCCGGGGCCCGACGGCGAGCGCGTCAGGGTACGCATCCTGCGCCCGGCGGGA
GCGGCGGGCACACCGGGGGCGCCGGGCACACCCGGAGCGGCGGGACGGGAGGAGGAACCC
CTCCCCGTCGTGCTCTACCTGCACGCCCTCGGCTGGATGCTCACCGACGCCTACGCCCAC
CGGCAGCTCCTCTCCGACCTCGTCCTCGGCGCCGACGCGGCCGTGGTCGTCCCCGAGTAC
GAGGGGCCGCGCGACGCCAGGCACCCCCACGCCGTGGAGCGCGCCCACACCGTCGCCCGA
TGGCTCGCGCGGCACGGTGCCGAGTGCGGCCTCGACGGGAGCCGGATGGCCGTCGTCGGG
GCCAGCGCGGGCGCCCAGCAGGCTGCCGCCCTCACCCTGGTGGCGCGGGAGCGGGGCGGC
CCGCACCTCCGCCACCAGGTGCTCGTCTGCCCGGTGACGGATGCCGCGATGGACACGCCG
TCGTACCGCCACTTCGAGGACGGGTACTTCCTCGGGCGCTCCGCGATGCGCGGCTACTGG
CAGCGGTACGCGCCCGACCGGGCGAGCCGCGCGGACGGCGTGGTCTCCCCGCTGCGCGCG
CCGCTCGGCGGCCTGCGCGGTCTGCCGCCGGCGCTGGTGCTCACGGCCGAGGCCGATGTG
CTCCGCGACGAGGGGGAGGCGTACGCGGCGCGGCTGCGGGAGGCGGACGTACCCGTCGTG
TCGATCCGCTACCAGGGCACGATCCACGGCTTCCTGCTCTTCGACCTGCTGCGGGCCACC
GAGGCCTCCAGGGCGGCCCGCATCCAGGTGACGGACACCCTGCACGCGGCCCTGCACGGG
GCCTAG

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR013094 Alpha/beta hydrolase fold-3 (Domain)
[104-312] 1e-52 PF07859
PF07859   Abhydrolase_3
SignalP
[1-22] 0.136 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
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