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Oxzol_00040 : CDS information

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Organism
StrainJA3453
Entry nameOxazolomycin
Contig
Start / Stop / Direction10,240 / 10,716 / + [in whole cluster]
10,240 / 10,716 / + [in contig]
Location10240..10716 [in whole cluster]
10240..10716 [in contig]
TypeCDS
Length477 bp (158 aa)
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Category5.1 general function
Productputative peroxiredoxin
Product (GenBank)integral membrane protein
Genebcp
Gene (GenBank)
EC number1.11.1.15
Keyword
Note
  • This ORF is not involved in oxazolomycin biosynthesis.
Note (GenBank)
  • ozm orf -3
Reference
ACC
PmId
[16707707] Utilization of the methoxymalonyl-acyl carrier protein biosynthesis locus for cloning the oxazolomycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces albus JA3453. (J Bacteriol. , 2006)
[20406823] Oxazolomycin biosynthesis in Streptomyces albus JA3453 featuring an "acyltransferase-less" type I polyketide synthase that incorporates two distinct extender units. (J Biol Chem. , 2010)
comment
[PMID:16707707]
methoxymalonyl-ACP生合成遺伝子の同定とクローニング

Orf(-3)は、methoxymalonyl-ACP生合成遺伝子であることが同定されたOzmB, OzmC, OzmD, OzmE, OzmF, OzmGと共にクローニングされたORF。


[PMID:20406823]
oxazolomycin生合成遺伝子クラスターの報告。

orf(-3): Bacterioferritin comigratory protein

生合成遺伝子の境界を決定するため、orf(-1), orf(-2), orf(-3)-orf(-5),orf(+1), orf(+2), orf(+3)-orf(+5)欠損株作製。
いずれもoxazolomycin 産生にいかなる影響も与えなかったことから、oxazolomycin生合成には関与しないと結論づけている。

このORFについて機能解析はされていない。
Related Reference
ACC
P0AE52
PmId
comment
ECOLI_BCP(P0AE52)
Putative peroxiredoxin bcp

electron donorとしてthioredoxinを用いてlinoleic acid hydroperoxideを還元したことから、thioredoxin-dependent thiol peroxidaseであることを確認。

BCPの発現レベルは、oxidative stress下で3倍以上に増加。
また、BCP null mutantは、増殖がWtに比べて遅く、oxidantに対する過感受性を示した。

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selected fasta
>putative peroxiredoxin [integral membrane protein]
MTARVAVGDTVEDFTLPDETGVPRSLGELLDDGPVVLFFYPAALTPACTAEACHFRDLAA
EFAAAGARPVGISSDGVERQMEFTERHGLGFPLLSDPDGVVRDRFGVTRGFSLAPTKRVT
FVIGRDRTVTEVVRSELRMSAHADRALEAVRRLRESAA
selected fasta
>putative peroxiredoxin [integral membrane protein]
ATGACGGCGCGCGTGGCGGTCGGCGACACCGTCGAGGACTTCACGCTGCCGGACGAGACC
GGTGTCCCGCGCAGCCTCGGCGAACTCCTCGACGACGGCCCCGTCGTGCTCTTCTTCTAT
CCGGCGGCGCTCACCCCCGCGTGCACCGCCGAGGCCTGTCACTTCCGCGATCTGGCCGCC
GAGTTCGCCGCCGCGGGCGCGCGGCCCGTGGGGATCAGCTCCGACGGGGTCGAGCGCCAG
ATGGAGTTCACCGAGCGGCACGGCCTCGGGTTTCCGCTGCTCTCGGACCCCGACGGCGTG
GTGCGCGACCGGTTCGGCGTGACGCGGGGCTTCTCCCTCGCGCCGACGAAGCGCGTCACG
TTCGTCATCGGCCGGGACCGCACCGTCACCGAGGTGGTCCGCAGCGAGCTGCGCATGAGC
GCCCACGCCGACCGCGCCCTCGAAGCCGTGCGCCGACTGCGCGAGAGCGCGGCCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR000866 Alkyl hydroperoxide reductase subunit C/ Thiol specific antioxidant (Domain)
[7-131] 4.29999999999998e-29 PF00578
PF00578   AhpC-TSA
IPR012336 Thioredoxin-like fold (Domain)
[5-155] PS51352
PS51352   THIOREDOXIN_2
[6-154] 4.9e-37 G3DSA:3.40.30.10
G3DSA:3.40.30.10   Thioredoxin_fold
[1-153] 2.1000026783403e-47 SSF52833
SSF52833   Thiordxn-like_fd
SignalP
[1-52] 0.097 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
Oxzol_00030 Oxzol_00030   Oxzol_00050 Oxzol_00050
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