Polk_00180 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces diastatochromogenes
Strain	Tü6028
Entry name	Polyketomycin
Contig	FJ483966
Start / Stop / Direction	25,763 / 24,720 / - [in whole cluster] 25,763 / 24,720 / - [in contig]
Location	complement(24720..25763) [in whole cluster] complement(24720..25763) [in contig]
Type	CDS
Length	1,044 bp (347 aa)

Annotation

Category	3.2 modification methylation
Product	6-methylsalicylyl-CoA C-3 C-methyltransferase
Product (GenBank)	PokMT1
Gene
Gene (GenBank)	pokMT1
EC number	2.1.1.-
Keyword	3,6-dimethylsalicylic acid
Note
Note (GenBank)	C-methyltransferase
Reference	ACC C0JWB3 PmId [19266534] Organisation of the biosynthetic gene cluster and tailoring enzymes in the biosynthesis of the tetracyclic quinone glycoside antibiotic polyketomycin. (Chembiochem. , 2009) comment polyketomycin生合成clusterの解析論文。 pokMT1: C-methyltransferase PokMT1はSAM-dependent methyltransferaseであると配列解析から提唱される。 pokMT1不活化mutantは、主要産物として3,6-dimethyl-salicylic acid部分を含まないpolyketomycin(POK-MD1)を産生。また、6-methyl-salicylic acid部分を持つ化合物POK-MD2もわずかに産生。よって、PokMT1は6-methyl-salicylic acidのC-3をmethyl化して3,6-dimethyl-salicylic acidを形成する。 POK-MD1>>POK-MD2であることから、3,6-dimethyl-salicylic acidとなってから他の部分と結合すると考えられる。
Related Reference	ACC B0BLM5 NITE Madu_00160 PmId [20718468] Enediyne antitumor antibiotic maduropeptin biosynthesis featuring a C-methyltransferase that acts on a CoA-tethered aromatic substrate. (J Am Chem Soc. , 2010) comment Blast 2nd, id72%, 1e-142 Actinomadura madurae_mdpB1 C-methyltransferase MdpB1,MdpB2の機能解析。 mdpB1を大腸菌にて過剰発現・精製し、6-methylsalicylic acidを合成したことを確認した。実験した全ての条件下でS-adenosyl-L-methionine存在下で6-methylsalicylic acidをメチル化出来なかったことから、提案してきた経路を改変する必要性を認めた。 MdpB2についても大腸菌で発現・精製し、in vitroで予測されたCoA ligase activityを確かめた。ATP or CoA存在下でMdpB2とともに6-methylsalicylic acidをincubaeさせると、新規産物が得られた。これは、CoA thioesterと一致した。つまり、MdpB2はMdpB1よりも以前に反応することを示した。反応速度論的解析により、MdpB1はCoA-tethered aromatic substrate特異的なC-methyltransferaseであることを示した。

Sequence

>6-methylsalicylyl-CoA C-3 C-methyltransferase [PokMT1]
MASGTITVSEADYLRILIHGTTAFELLRTGLEFDLFERLEAAEGMDVEEVAEAIGTEAQP
ARILLLGLASLRLLEKKDNKYVNSEMVRRKLLRSSPRFLGPLVDIQADIINRSLGDFAES
MRQNTNVGLRHIEGPGDTLYERLTAHPELQEVFYRNMGDASKKAFAQILDRYDFSGLHHV
IDIGGGDGTNSIELARRYPHLEVTVFDQESVTRIAAQRTEDAELSKRVHFHPGDLFTDAL
PEGADGIMFFHIFEIWSLERNTELLRKCYEALPPGGVCLVYNFVSNDEGTGSMSGGLVSP
YFLTLASGEGMTYAPKDMDKAIRDAGFSRVERYDGLGFSHSLVVGHK

>6-methylsalicylyl-CoA C-3 C-methyltransferase [PokMT1]
ATGGCCAGCGGCACCATCACCGTCAGCGAAGCGGACTACCTGCGGATCCTCATTCACGGC
ACGACCGCGTTCGAACTGCTGCGCACGGGGCTTGAGTTCGACCTCTTCGAGCGCCTGGAG
GCGGCCGAGGGCATGGATGTCGAGGAGGTCGCGGAGGCGATCGGCACCGAGGCCCAGCCC
GCCCGCATCCTGCTCCTCGGGCTCGCCTCGCTGCGGCTTCTGGAGAAGAAGGACAACAAG
TACGTCAACAGCGAGATGGTGCGGCGCAAGCTGCTCAGGTCGAGCCCGCGCTTCCTGGGC
CCGCTGGTGGACATCCAGGCCGACATCATCAACCGCTCCCTCGGCGACTTCGCCGAGTCG
ATGCGGCAGAACACCAACGTGGGCCTGCGCCACATCGAGGGTCCCGGCGACACGCTGTAC
GAACGGCTCACGGCGCACCCCGAGTTGCAGGAGGTGTTCTACCGGAACATGGGCGACGCG
TCGAAGAAGGCGTTCGCGCAGATCCTCGACCGGTACGACTTCTCCGGGCTGCACCATGTC
ATCGACATCGGCGGCGGCGACGGCACCAACAGCATCGAACTGGCCCGCCGCTACCCGCAC
CTGGAGGTGACGGTCTTCGACCAGGAGAGCGTCACCCGCATCGCGGCGCAGCGGACCGAG
GACGCCGAGCTGAGCAAGCGGGTGCACTTCCACCCGGGCGACCTGTTCACCGACGCGCTG
CCCGAGGGCGCCGACGGGATCATGTTCTTCCACATCTTCGAGATCTGGTCGCTGGAGCGG
AACACCGAGCTGCTGCGCAAGTGCTACGAGGCCCTGCCGCCCGGCGGTGTCTGCCTGGTC
TACAACTTCGTCTCGAACGACGAGGGCACCGGCTCGATGAGCGGCGGGCTGGTCTCGCCC
TACTTCCTCACCCTCGCCTCCGGAGAGGGCATGACGTACGCCCCGAAGGACATGGACAAG
GCCATTCGCGACGCCGGCTTCTCCCGCGTCGAGCGCTACGACGGCCTCGGGTTCAGCCAC
TCCCTGGTCGTCGGCCACAAGTAG

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001077 O-methyltransferase, family 2 (Domain) PF00891 Methyltransf_2 IPR011991 Winged helix-turn-helix transcription repressor DNA-binding (Domain) G3DSA:1.10.10.10 Wing_hlx_DNA_bd IPR016461 O-methyltransferase, caffeic acid-type (Family) PIRSF005739 O-mtase
SignalP	Eukaryota
TMHMM	No significant hit

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