Tauto_00260 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces spiroverticillatus
Strain
Entry name	Tautomycin
Contig	EF990140
Start / Stop / Direction	92,509 / 91,736 / - [in whole cluster] 92,509 / 91,736 / - [in contig]
Location	complement(91736..92509) [in whole cluster] complement(91736..92509) [in contig]
Type	CDS
Length	774 bp (257 aa)

Annotation

Category	1.4 Other
Product	putative type II thioesterase
Product (GenBank)	probable thioesterase
Gene
Gene (GenBank)	ttmT
EC number
Keyword	type II thioesterase
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC C0SMX9 PmId [18708355] Characterization of the tautomycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces spiroverticillatus unveiling new insights into dialkylmaleic anhydride and polyketide biosynthesis. (J Biol Chem. , 2008) comment tautomycin (TTM) biosynthetic gene clusterについての文献。 ttmT(257a.a.): thioesterase ttmTの機能実験は無いが、polyketide鎖伸長時のTtmHIJ PKSsのediting enzymeとして機能することが予測されている。
Related Reference	ACC Q7BUF9 NITE Rifam_00540 PmId [19103602] Structure and functional analysis of RifR, the type II thioesterase from the rifamycin biosynthetic pathway. (J Biol Chem. , 2009) comment Blast 5th, id63%, 8e-85 Amycolatopsis mediterranei_rifR RifR [Rifam_00540]type II thioesterase orf12=rifR RifRは、acyl-CoAsよりもacyl carrier domainのphosphopantetheinyl armからのacyl unitsを加水分解する(Steady-state kinetics)。 helical lidの運動が、RifR active siteへの基質のアクセスを調節する(立体構造解析)。 RifRがCoA基質よりACP基質への反応を好むことは、type II thioesteraseがcarrier domainsから異常unitsを除くようなhousekeeping functionsをすると考えられていることに一致する。
	ACC Q846W2 NITE Monen_00290 PmId [16984884] Identification of NanE as the thioesterase for polyether chain release in nanchangmycin biosynthesis. (Chem Biol. , 2006) comment Blast 15th, id54%, 1e-67 Streptomyces cinnamonensis_monAX Thioesterase [Monen_00290]type II thioesterase 対照実験として。 MonAXはdiketide-SNACを加水分解したが、polyether-SNACを加水分解しなかった。よって、polyether鎖の放出には関与しない。
	ACC Q6W5Q5 NITE FR008_00110 PmId [18836004] Selective removal of aberrant extender units by a type II thioesterase for efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. strain FR-008. (Appl Environ Microbiol. , 2008) comment Blast 52nd, id48%, 1e-58 Streptomyces sp. FR-008_fscTE FscTE [FR008_00110]type II thioesterase fscTEはputative type II thioesterase (TEII)をコードする。 fscTE deletionでFR-008/candicidin産生は約90%減。 type I thioesteraseを不活化させたとき、FscTEは成熟伸長したpolyketideの放出を代償することができなかった。 FscTE and TylOのHydrolytic activitiesは、 propionyl-S-N-acetylcysteamine > methylmalonyl-S-N-acetylcysteamine acetyl-S-N-acetylcysteamine > malonyl-S-N-acetylcysteamine したがって、TEII はacyl carrier proteins(ACP)に結合するnon-elongatable residuesを選択的に除去することにより、効果的なpolyketide生合成を維持することが結論付けられる。

Sequence

>putative type II thioesterase [probable thioesterase]
MTGSTEYFENWVSTFNPAPSAAVRLACLPHAGGSASFFFPLAKAFGPDVEVMAVQYPGRQ
ARRNEPGIDNVPEYADHIFAALRQLADRPLALFGHSMGAVLAYEVALRMREAGLPAPVRL
FASGRRAPSRYRDEQVHKGTDVQIVAELRGLGGPNQSMLTDPEVLALILPAVRGDYRAIE
RYRHDPDARLDCPVTVLVGDEDPRVTLDEARAWAEHTTGPTELEVFGGGHFYLVDHGKEV
IDLLARRLSTQGTEPIR

>putative type II thioesterase [probable thioesterase]
GTGACGGGTTCGACTGAGTATTTCGAGAATTGGGTGTCGACGTTCAACCCGGCCCCGAGC
GCGGCGGTGCGTCTGGCCTGCCTGCCGCATGCCGGTGGCTCGGCGAGCTTTTTCTTCCCG
CTGGCCAAGGCGTTCGGTCCCGACGTCGAGGTGATGGCGGTGCAGTATCCCGGCCGCCAA
GCCCGGCGGAACGAACCGGGCATCGACAACGTACCCGAGTACGCGGACCACATTTTCGCG
GCGCTGCGGCAGCTGGCCGACCGGCCGCTGGCGTTGTTCGGTCACAGCATGGGCGCGGTG
CTCGCCTACGAGGTGGCGCTGCGGATGCGGGAAGCGGGGCTGCCCGCGCCTGTGCGGCTG
TTCGCCTCGGGGCGGCGCGCGCCCTCCCGGTACCGCGACGAGCAGGTGCACAAGGGCACG
GACGTGCAGATCGTGGCGGAGCTGCGGGGCCTCGGCGGGCCCAACCAGTCCATGCTCACC
GATCCGGAAGTGCTCGCCCTGATCCTCCCGGCCGTGCGCGGCGACTATCGCGCCATCGAA
CGCTATCGGCACGATCCCGATGCGCGCCTCGACTGCCCGGTGACGGTGCTCGTCGGTGAC
GAGGACCCTCGCGTCACCCTCGACGAGGCGCGGGCCTGGGCGGAGCACACCACCGGTCCG
ACGGAGCTGGAGGTGTTCGGCGGCGGGCACTTCTACCTCGTCGACCACGGCAAAGAAGTG
ATCGACCTACTGGCGCGCCGACTGAGCACGCAGGGAACCGAGCCCATCCGCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001031 Thioesterase (Domain) PF00975 Thioesterase
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Tauto_00250 Tauto_00270