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Actino_00100 : CDS information

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Organism
StrainA3(2) (=NBRC 15146)
Entry nameActinorhodin
Contig
Start / Stop / Direction8,652 / 9,536 / + [in whole cluster]
2,982 / 3,866 / + [in contig]
Location8652..9536 [in whole cluster]
2982..3866 [in contig]
TypeCDS
Length885 bp (294 aa)
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Category3.4 other modification
Producthypothetical protein
Product (GenBank)
GeneactVA-ORF4
Gene (GenBank)actVA 4
EC number
Keyword
  • dimerization
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[1766437] Organisation and functions of the actVA region of the actinorhodin biosynthetic gene cluster of Streptomyces coelicolor. (Mol Gen Genet. , 1991)
[22765902] Identification of the actinorhodin monomer and its related compound from a deletion mutant of the actVA-ORF4 gene of Streptomyces coelicolor A3(2). (Bioorg Med Chem Lett. , 2012)
[25690356] Structure and biosynthetic implication of 5R-(N-acetyl-L-cysteinyl)-14S-hydroxy-dihydrokalafungin from a mutant of the actVA-ORF4 gene for actinorhodin biosynthesis in Streptomyces coelicolor A3(2). (J Antibiot (Tokyo). , 2015)
comment
[PMID: 1766437](1991)
actinorhodin biosynthetic gene clusterのactVA領域の配列解析。

actVA-ORF3とactVA-ORF5(たぶんactVA-ORF4も)は、act mutantsの相補実験からC-6 hydroxylationに関与するとされている。
使用されているphage KC591はactVA-ORF5のN末が欠けており、actVA-ORF5も相補ORF候補となるため、たぶん、とされている。

actVA-ORF1-5を含むpIJ2315をmedermycin産生株に導入するとhybrid化合物mederrhodin A(8-hydroxymedermycin)を産生するので、C-8 hydroxylationへの関与についても述べられている。

---
[PMID: 22765902](2012)
actinorhodinは8-hydroxy-dihydrokalafungin (DHK)から成る2量体。
actVA-ORF4 deletion mutantで、単量体unitである8-hydroxy-DHKとその還元物質が同定された。
よってActVA-ORF4はactinorhodin生合成において必須であり、C-C結合形成を介した二量体化に特異的である。

---
[PMID: 25690356](2015)
actVA-ORF4のdeletion mutant株における新規化合物5(Compound Z = 5R-AcCys-14S-OH-DHK) の分離、同定。ActVA-ORF4の機能解明には直接関係しない。

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selected fasta
>hypothetical protein
MPDENKPVLVLGATGKQGGSAARYLLERGWTVRAFVRDPGAPKAKELRELGASLHTGDLE
DAGSVRAAMKGAYGVFSIQTPMTPAGVEGEERQGKICADAARDLGVQHYVHSSVGGAERP
EGVNWRLSKLAIEQRIQENALRFTFLRPSYFMENLNHDMSPLVMEDGVLTFRRGLGPANT
LQMISGPDIGYFAADAFDDPDTFGGAKIELAGDELTGEQIAAAFGRHTGLPARFVSVPIP
ELHRTGFEWQAISYTWLNGIGYHADIPTLRARFPQLLTLDQWLARTGWTPRDPA
selected fasta
>hypothetical protein
ATGCCCGATGAGAACAAGCCCGTACTGGTCCTCGGCGCCACCGGAAAGCAAGGCGGCTCC
GCGGCCCGGTACCTGCTGGAACGCGGCTGGACAGTCCGGGCCTTCGTCCGGGACCCCGGC
GCGCCCAAGGCCAAGGAGCTGCGTGAGCTGGGGGCGAGCCTGCACACCGGCGACCTGGAG
GACGCCGGCTCGGTGCGCGCCGCGATGAAGGGTGCGTACGGCGTGTTCAGCATCCAAACG
CCGATGACACCGGCCGGCGTGGAGGGCGAGGAGCGGCAGGGCAAGATATGCGCCGACGCC
GCCCGCGACCTCGGCGTCCAGCACTACGTCCACAGCTCGGTGGGCGGCGCGGAACGGCCG
GAGGGCGTGAACTGGCGGCTGTCCAAGCTCGCGATCGAGCAGCGGATCCAGGAGAACGCG
CTCCGGTTCACCTTCCTGCGGCCGTCGTACTTCATGGAGAACCTGAACCACGACATGTCG
CCCCTCGTCATGGAGGACGGCGTGCTGACCTTCCGGAGGGGGCTCGGGCCGGCCAACACC
CTGCAGATGATCAGCGGCCCCGACATCGGGTACTTCGCGGCCGACGCCTTCGACGACCCC
GACACCTTCGGCGGCGCCAAGATCGAGCTGGCCGGGGACGAGCTGACCGGCGAGCAGATC
GCGGCCGCGTTCGGCCGGCACACCGGGCTGCCCGCCCGCTTCGTGTCGGTGCCGATACCG
GAGCTGCACCGCACGGGGTTCGAGTGGCAGGCGATCTCGTACACCTGGCTCAACGGCATC
GGCTATCACGCCGACATCCCCACGCTGCGCGCCCGGTTCCCGCAGCTGCTCACCCTCGAC
CAGTGGCTGGCCAGGACCGGCTGGACCCCGAGGGACCCGGCATGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR008030 NmrA-like (Domain)
[8-235] 7.9e-44 PF05368
PF05368   NmrA
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[4-224] 1.3e-68 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   no description
SignalP
[1-34] 0.075 Signal
Eukaryota   
TMHMM No significant hit
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