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Actino_00120 : CDS information

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Organism
StrainA3(2) (=NBRC 15146)
Entry nameActinorhodin
Contig
Start / Stop / Direction10,671 / 11,012 / + [in whole cluster]
5,001 / 5,342 / + [in contig]
Location10671..11012 [in whole cluster]
5001..5342 [in contig]
TypeCDS
Length342 bp (113 aa)
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Category3.3 modification reduction
ProductC-6 monooxygenase
Product (GenBank)
GeneactVA-ORF6
Gene (GenBank)actVA 6
EC number
Keyword
  • alternative
  • quinone formation
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[1766437] Organisation and functions of the actVA region of the actinorhodin biosynthetic gene cluster of Streptomyces coelicolor. (Mol Gen Genet. , 1991)
[9209048] Identification of a monooxygenase from Streptomyces coelicolor A3(2) involved in biosynthesis of actinorhodin: purification and characterization of the recombinant enzyme. (J Bacteriol. , 1997)
[19246012] Biosynthesis of actinorhodin and related antibiotics: discovery of alternative routes for quinone formation encoded in the act gene cluster. (Chem Biol. , 2009)
comment
[PMID: 1766437](1991)
actinorhodin biosynthetic gene clusterのactVA領域の配列解析。

---
[PMID:9209048](1997)
actVA-ORF6をE.coliで発現、精製、特徴づけ。
ActVA-ORF6はTcmHに似ている。
ActVA-ORF6は、TcmHが担うTcmF1→TcmD3のmonooxygenationを触媒できた。
通常は必要とされる補欠分子族は要らない。酸素分子だけでOK。
His-53を欠いたmutantsは活性がとても減った。

--
[PMID:19246012](2009)
deletion mutantでvivo活性検討。
emodinanthroneを基質としてvitro活性測定。
emodinanthroneは化学構造的にTcmF1よりも6-DDHKに類似。
ActVA-ORF6よりActVA-ORF5/ActVBのほうがKm値が低い＝親和性高い。

BIQsのquinone形成におけるC-6 oxygenationにおいて、
主要ルートはActVA-ORF5/ActVBによって触媒され、
actVBが削除されたとき（またはActVB発現が低いとき）、
代替ルートとしてActVA-ORF6が触媒すると提唱。

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selected fasta
>C-6 monooxygenase
MAEVNDPRVGFVAVVTFPVDGPATQHKLVELATGGVQEWIREVPGFLSATYHASTDGTAV
VNYAQWESEQAYRVNFGADPRSAELREALSSLPGLMGPPKAVFMTPRGAILPS
selected fasta
>C-6 monooxygenase
ATGGCTGAAGTGAACGATCCCCGGGTGGGCTTCGTCGCGGTCGTCACCTTCCCGGTGGAC
GGCCCCGCCACCCAGCACAAGCTGGTGGAGCTGGCCACCGGCGGGGTGCAGGAGTGGATC
CGCGAGGTGCCCGGCTTCCTGTCGGCCACGTATCACGCGAGCACGGACGGGACCGCGGTC
GTCAACTACGCCCAGTGGGAGAGCGAGCAGGCCTACCGGGTGAACTTCGGCGCCGACCCG
CGCTCGGCGGAGCTGCGGGAGGCGCTGAGCTCGCTGCCCGGGCTCATGGGGCCGCCGAAG
GCCGTGTTCATGACTCCGCGGGGGGCGATCCTGCCGTCCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR007138 Antibiotic biosynthesis monooxygenase (Domain)
[11-76] 3.7e-14 PF03992
PF03992   ABM
IPR011008 Dimeric alpha-beta barrel (Domain)
[1-113] 1.4e-24 SSF54909
SSF54909   Dimeric alpha+beta barrel
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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