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Ansam_00210 : CDS information

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Organism
StrainATCC 31565
Entry nameAnsamitocin
Contig
Start / Stop / Direction37,959 / 39,095 / + [in whole cluster]
44,788 / 43,652 / - [in contig]
Location37959..39095 [in whole cluster]
complement(43652..44788) [in contig]
TypeCDS
Length1,137 bp (378 aa)
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Category3.4 other modification
ProductC-3 O-acyltransferase
Product (GenBank)3-O-acyltransferase
Gene
Gene (GenBank)asm19
EC number2.3.1.-
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[12047169] Identification of asm19 as an acyltransferase attaching the biologically essential ester side chain of ansamitocins using N-desmethyl-4,5-desepoxymaytansinol, not maytansinol, as its substrate. (J Am Chem Soc. , 2002)
[12060743] The biosynthetic gene cluster of the maytansinoid antitumor agent ansamitocin from Actinosynnema pretiosum. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2002)
[14624546] The post-polyketide synthase modification steps in the biosynthesis of the antitumor agent ansamitocin by Actinosynnema pretiosum. (J Am Chem Soc. , 2003)
comment
[PMID:12047169](2002) abstract
ansamitocinの強力な抗癌活性は、macrolactam環のC-3-Oにエステル化した短いacyl基に絶対的に依存する。asm19はこのエステル化を触媒するacyltransferaseをコードすると考えられている。

asm19不活化mutant HGF052はansamitocin P-3も、対応するalcohol(maytansinol)も産生せず、N-desmethyl-4,5-desepoxymaytansinolを蓄積する。よって、acylationはansamitocin生合成で最終ステップではない。

生物変換実験とE.coliで発現したrecombinant Asm19を使ったin vitro実験から、Asm19がacyl基質に対しては乱雑だが、alcohol基質に対してはとても特異的で、maytansinol ではなくN-desmethyl-4,5-desepoxymaytansinol を変換することが示された。

---
[PMID:12060743](2002)
Actinosynnema pretiosum ssp. auranticum ATCC 31565のcosmid libraryから、ansamitocin生合成に必要な2つのgene clustersをクローニング。

<cluster I>
Asm19(378aa) : 3-O-acyltransferase

本文記載内容は[PMID:12047169]の引用。

---
[PMID:14624546](2003)
Actinosynnema pretiosumのansamitocin生合成gene clusterにある6genesの機能を、遺伝子不活化とmutantの化学分析によって調査。

それらはそれぞれ
halogenase (asm12),
carbamoyltransferase (asm21),
20-O-methyltransferase (asm7),
3-O-acyltransferase (asm19),
epoxidase (asm11),
N-methyltransferase (asm10)
をコードし、ansamitocin形成において6つのPKS後修飾ステップを担う。

ここでもAsm19に関する実験結果は[PMID:12047169]の引用。

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selected fasta
>C-3 O-acyltransferase [3-O-acyltransferase]
MTPGPVLPPRLPSLTGIRAPLALLVFVAHALGSARFFADESVNSLGFLLPYGPAALSLFF
VLSGFVLVWSEPWREGVGPYFRRRVVRILPTHVLTWAAVLLLLAALGPLPLLGPLPEVGP
ALVNLSLLQSLVPLPDYLLSVNGINWSVSCEVVFYLLLPLLSRPLLRVPDHRLWACFGVL
AAVVLALPGVIGALVDGPPWALWPPLSFEQAWLVNFFPLTRLPEFLMGVVLARIVATGRW
RPVRAWWPLLGVAAVWALLPVLPQVYARSAIAAVPLALLVPVIAVRDLEGRRSVLSRRWV
RVAGDMSYATYLLHWPLLAVAKHVAGDRLLGLGEGLLLVAALYALTQGLSLLLHRWVERP
LLRRAHRPRRSPAPDPAG
selected fasta
>C-3 O-acyltransferase [3-O-acyltransferase]
ATGACCCCCGGTCCCGTCCTCCCTCCTCGGCTTCCCTCCCTCACCGGCATCCGCGCGCCG
CTGGCCCTGCTCGTGTTCGTGGCCCACGCGCTCGGCTCCGCCCGGTTCTTCGCCGACGAA
TCGGTCAACTCGCTCGGGTTCCTCCTGCCCTACGGGCCCGCGGCGCTGTCGTTGTTCTTC
GTGCTCAGCGGGTTCGTGCTGGTGTGGTCGGAGCCGTGGCGCGAGGGCGTGGGCCCCTAC
TTCCGACGCCGGGTCGTGCGCATCCTGCCCACCCACGTGCTGACGTGGGCCGCGGTGCTG
CTGCTCCTGGCGGCGCTCGGCCCGCTGCCGCTGCTGGGGCCGCTGCCCGAGGTGGGGCCC
GCGCTGGTCAACCTGTCGCTGCTCCAGTCGCTCGTGCCGCTGCCCGACTACCTGCTGTCG
GTCAACGGCATCAACTGGTCGGTGTCCTGCGAGGTGGTGTTCTACCTGCTGCTGCCGCTG
CTGTCCCGGCCGCTGCTGCGGGTGCCCGACCACCGGTTGTGGGCGTGCTTCGGCGTGCTC
GCCGCGGTGGTGCTCGCGCTGCCGGGCGTGATCGGGGCGCTGGTGGACGGGCCGCCGTGG
GCGCTGTGGCCGCCGCTGTCGTTCGAGCAGGCGTGGCTGGTGAACTTCTTCCCGCTGACC
CGGTTGCCGGAGTTCCTGATGGGCGTGGTGCTCGCCAGGATCGTGGCCACCGGGCGGTGG
CGGCCGGTGCGGGCGTGGTGGCCGCTGCTGGGGGTGGCGGCGGTGTGGGCGCTGCTGCCG
GTGCTGCCGCAGGTGTACGCGCGCAGCGCGATCGCGGCGGTCCCGCTGGCGCTGCTCGTC
CCCGTCATCGCCGTGCGGGACCTGGAGGGGCGGCGGTCCGTGCTGTCCCGGCGGTGGGTG
CGGGTCGCGGGGGACATGAGCTACGCGACCTACCTGCTGCACTGGCCGCTGCTCGCGGTC
GCCAAGCACGTGGCGGGGGACCGGCTGCTCGGGCTGGGGGAGGGGCTGCTGCTGGTGGCG
GCGCTGTACGCGCTCACCCAGGGGCTCAGCCTGCTGCTGCACCGGTGGGTGGAGCGTCCG
CTGCTGCGGCGCGCCCACCGGCCGAGGCGGTCGCCCGCCCCGGACCCGGCGGGGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002656 Acyltransferase 3 (Domain)
[12-350] 3e-25 PF01757
PF01757   Acyl_transf_3
SignalP
[1-34] 0.939 Signal
Eukaryota   
[1-30] 0.605 Signal
Bacteria, Gram-negative   
[1-30] 0.66 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM
[13-32] Transmembrane (i-o) [47-69] Transmembrane (o-i) [90-112] Transmembrane (i-o) [144-166] Transmembrane (o-i) [173-195] Transmembrane (i-o) [210-232] Transmembrane (o-i) [245-262] Transmembrane (i-o) [266-285] Transmembrane (o-i) [298-320] Transmembrane (i-o) [335-357] Transmembrane (o-i)
Transmembrane 10   
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