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Ansam_00440 : CDS information

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Organism
StrainATCC 31565
Entry nameAnsamitocin
Contig
Start / Stop / Direction85,408 / 85,022 / - [in whole cluster]
2,662 / 2,276 / - [in contig]
Locationcomplement(85022..85408) [in whole cluster]
complement(2276..2662) [in contig]
TypeCDS
Length387 bp (128 aa)
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Category5.1 general function
Productputative anti-sigma factor antagonist
Product (GenBank)unknown
Geneasm40
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
  • ORF3
Reference
ACC
PmId
[12060743] The biosynthetic gene cluster of the maytansinoid antitumor agent ansamitocin from Actinosynnema pretiosum. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2002)
comment
Actinosynnema pretiosum ssp. auranticum ATCC 31565のcosmid libraryから、ansamitocin生合成に必要な2つのgene clustersをクローニング。

cluster II を削除するとansamitocinsの産生がなくなるが、AHBAを補充すると産生は回復するので、cluster II はAHBA形成のみに必要な遺伝子を含む。

<cluster II>
Asm40(128aa) : Sigma factor actagonist(Function of homologue)

本文にコメントなし。
Related Reference
ACC
Q56QW5
PmId
comment
10th, id38%, 8e-08
Streptomyces clavuligerus
Stage II sporulation protein

S. coelicolorにおいて気菌糸形成と抗生物質産生を調節するputative anti-anti-sigma factor bldG, putative anti-sigma factor protein orf3に相同なタンパクを、S. clavuligerusで同定している。

bldG null mutantはcephamycin C と clavulanic acid を産生できない。BldGは、これら二次代謝産物の生合成遺伝子発現を調節するregulator CcaR and ClaRの上流で機能するregulatory proteinである。

---
このentryはbldGに相当する。
ACC
Q9WVX8
PmId
comment
28th, id36%, 6e-07
Streptomyces coelicolor_rsbV(bldG, SCO3549)
Anti-sigma-B factor antagonist

B.subtilisのSpoIIAA and RsbV anti-anti-sigma factorsに似たBldGの解析。
ATPを使ったBldGのリン酸化が、形態分化や抗生物質産生に必須である。

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selected fasta
>putative anti-sigma factor antagonist [unknown]
MSELDAAAVVTVASDVVRGVPVLRVAGEIDANVADEVRRALLPWLDGLRGPGVLDLTGVR
FMASTGLSLLVEAARRGRARLVLATAQRGVLRPLQLTGMSALLPTHPTVDLAVDAQRGAD
LTRMPSTA
selected fasta
>putative anti-sigma factor antagonist [unknown]
GTGTCCGAGCTGGATGCAGCCGCGGTGGTCACGGTGGCTTCCGACGTGGTGCGCGGGGTG
CCCGTGCTGCGCGTCGCCGGGGAGATCGACGCCAACGTCGCGGACGAGGTCCGCCGGGCG
CTGCTGCCCTGGTTGGACGGGTTGCGCGGGCCGGGGGTGCTCGACCTGACCGGGGTGCGG
TTCATGGCCTCCACGGGGTTGTCGCTGCTGGTCGAGGCGGCTCGGCGCGGCCGGGCGCGG
CTGGTGCTGGCCACCGCGCAGCGCGGCGTGCTCCGGCCGCTGCAGCTGACCGGGATGAGC
GCGCTGCTCCCCACGCACCCCACCGTGGACCTGGCCGTCGACGCCCAGCGCGGGGCCGAC
CTGACCAGGATGCCCAGCACGGCCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002645 STAS domain (Domain)
[10-114] 7.99999145876753e-20 SSF52091
SSF52091   STAS
[18-111] 9.60000000000001e-11 PF01740
PF01740   STAS
[14-115] 8.80000000000003e-19 G3DSA:3.30.750.24
G3DSA:3.30.750.24   STAS
[10-116] PS50801
PS50801   STAS
IPR003658 Anti-sigma factor antagonist (Family)
[11-110] 1.6e-25 TIGR00377
TIGR00377   Ant_ant_sig
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Ansam_00430 Ansam_00430   Ansam_00450 Ansam_00450
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