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Rever_00220 : CDS information

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Organism
StrainSN-593
Entry nameReveromycin
Contig
Start / Stop / Direction50,747 / 51,664 / + [in whole cluster]
50,747 / 51,664 / + [in contig]
Location50747..51664 [in whole cluster]
50747..51664 [in contig]
TypeCDS
Length918 bp (305 aa)
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Category5.1 general function
Productputative esterase
Product (GenBank)putative thioesterase
Gene
Gene (GenBank)revN
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[21642985] Reveromycin A biosynthesis uses RevG and RevJ for stereospecific spiroacetal formation. (Nat Chem Biol. , 2011)
comment
配列解析によりrevNのfunctionをEsteraseとしている。また、revE〜revNでPost-PKS modificationとしている。実験情報は無し。
Related Reference
ACC
O52270
PmId
[9464382] ( , )
comment
Blast 46th, id43%, 1e-48
Pseudomonas sp. B11-1_lipP
Lipase

クローニングして酵素精製、活性を調べている。

アミノ酸配列は、 Antarctic Moraxella TA144由来のLipase 2 や哺乳類hormone-sensitive　lipaseなどのcold-adapted lipasesが持つGXSXG（GDSAG) motifを保存しており、おそらくActive siteはSerであると推測をしている。<=Oxzol_00010はGASAG(180-184)で保存されている。

また、Zn2+, Cu2+, Fe3+,　Hg2+で活性阻害を受けることや、酵素の温度依存性に関しても調べている
ACC
Q8NKS0
PmId
comment
Blast 96th, id39%, 2e-45
Pyrobaculum calidifontis_Pc-est
Esterase
超好熱古細菌のesteraseを分離、アミノ酸配列を調べたところmammalian hormone-sensitive lipasesと30%の相同性があった。
lipase活性を調べたが、esteraseとの明確な差異が分からなかった。
carboxylesteraseとタイトルではしているが、最終的にはesteraseで落ち着いている。

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selected fasta
>putative esterase [putative thioesterase]
MPLDPAVKAVLDILDAAGDRQLHELPMPLARANYDQLAGLGGEPAAIGRTERTTADGVPV
RLYWPDSPGPHPILLFFHGGGWVLGSLDGYDGVARDLSAHADCLVVSVGYRLAPDHCFPA
AVEDALTVAKWAMRTGDAYGGDTQRLAVAGDSAGGNLSAVLVNELPGRFRAQALLYPVTD
QTRKHPSVRENGQGYLLTEDTLRWFSENYLGDQDPRHPWASPLFAADEVLAAAPPTLVVT
GEFDPLRDEGEAYADRLRALGVHVENRRYDGMIHAFFSMRGMVPAAGEALRQVTDFLQEA
WTQHT
selected fasta
>putative esterase [putative thioesterase]
ATGCCACTCGACCCCGCGGTCAAGGCCGTCCTCGACATCCTTGACGCCGCCGGCGACAGG
CAGCTGCACGAGCTGCCGATGCCCCTCGCGCGGGCGAACTATGACCAACTCGCCGGGCTC
GGCGGCGAACCGGCGGCGATCGGCCGCACCGAGCGCACCACCGCCGACGGGGTGCCGGTC
CGGCTGTACTGGCCGGACAGCCCGGGCCCGCACCCGATCCTGCTCTTCTTCCACGGCGGC
GGCTGGGTGCTCGGCAGCCTCGACGGGTACGACGGCGTGGCCCGCGACCTGAGCGCGCAC
GCCGACTGCCTGGTGGTCAGCGTCGGCTACCGCCTCGCCCCCGACCACTGCTTCCCCGCC
GCGGTCGAGGACGCCCTCACCGTCGCCAAGTGGGCGATGCGGACGGGCGACGCGTACGGC
GGCGACACCCAGCGGCTGGCGGTGGCCGGCGACTCGGCGGGCGGCAACCTCAGTGCCGTG
CTCGTCAACGAACTGCCCGGCCGGTTCCGGGCGCAGGCGCTGCTCTACCCCGTCACCGAC
CAGACTAGGAAGCACCCCTCGGTCCGCGAGAACGGGCAGGGCTACCTGCTCACCGAGGAC
ACCCTGCGCTGGTTCAGCGAGAACTACCTCGGCGACCAGGACCCGCGCCACCCGTGGGCG
TCGCCGCTGTTCGCCGCCGACGAGGTGCTCGCGGCCGCGCCCCCGACCCTCGTGGTCACC
GGCGAGTTCGACCCGCTGCGCGACGAGGGCGAGGCCTACGCCGACCGGCTGCGCGCGCTC
GGCGTCCACGTCGAGAACCGCCGCTACGACGGCATGATCCACGCCTTCTTCTCCATGCGC
GGGATGGTGCCGGCCGCCGGCGAGGCCCTGCGCCAGGTGACGGACTTCCTCCAGGAAGCC
TGGACGCAACACACGTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR013094 Alpha/beta hydrolase fold-3 (Domain)
[74-277] 1.5e-70 PF07859
PF07859   Abhydrolase_3
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Rever_00210 Rever_00210   Rever_00230 Rever_00230
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