FD891_00070 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces graminofaciens
Strain	A-8890
Entry name	FD-891
Contig	AB469193
Start / Stop / Direction	71,390 / 72,226 / + [in whole cluster] 71,390 / 72,226 / + [in contig]
Location	71390..72226 [in whole cluster] 71390..72226 [in contig]
Type	CDS
Length	837 bp (278 aa)

Annotation

Category	3.2 modification methylation
Product	putative O-methyltransferase
Product (GenBank)	methyltransferase
Gene
Gene (GenBank)	gfsG
EC number	2.1.1.-
Keyword	C-25
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC E0D208 PmId [20589823] Cloning and characterization of the biosynthetic gene cluster of 16-membered macrolide antibiotic FD-891: involvement of a dual functional cytochrome P450 monooxygenase catalyzing epoxidation and hydroxylation. (Chembiochem. , 2010) [26630077] Parallel Post-Polyketide Synthase Modification Mechanism Involved in FD-891 Biosynthesis in Streptomyces graminofaciens A-8890. (Chembiochem. , 2016) comment [PMID: 20589823](2010) FD-891生合成gene clusterの報告。 Table 1.は[Chembiochem. 2010 Sep 3;11(13):1798]で修正されている。 gfsG: methyltransferase GfsGはさまざまなS-adenosyl methionine (SAM)-dependent methyltransferaseと少しの類似性を示したことから、FD-892あるいは他の関連した生合成中間体のC-25位でhydroxyl基のメチル化を触媒していると推測された。またGfsFに関する実験で、C25位でのメチル化がGfsFの基質認識に重要であることが示されている。
Related Reference	ACC Q8KI52 PmId [12619684] ( , ) comment BLAST id40% Nocardia aerocolonigenes Methyltransferase_rbmM(rebM) indolocarbazole抗生物質であるrebeccamycin生合成クラスターに関する文献。 rebeccamycin生合成クラスターの11個の遺伝子のうち、 9個の遺伝子について各々のmutantを作成し、生成物を調べることによって各遺伝子の機能を調べている。NMRとLCMSの解析結果より、rebM mutantではrebeccamycinは検出されず、4'-O-demethylrebeccamycinが生成されるに留まっていたことから、rebMはglucose部分の4-hydroxy基をメチル化しているとしている。
	ACC Q9X5Q9 PmId [10099135] ( , ) [11439066] ( , ) comment BLAST id42% Streptomyces lavendulae_mitM MitM --- [PMID:10099135](1999) Mitomycin C(MC)の生合成クラスターの解析。配列解析により、47遺伝子で構成されるクラスターであることを同定。また、そのうちの22の遺伝子についてmutantを作製し、MC産生の有無を確認。配列解析でmethyltransferaseと推定されるmitMのmutantではMCの産生がされないことから、 MC産生でmethyltransferaseとして機能することが示唆された。 --- [PMID:11439066](2001) 同じグループの続報。 mitM deletion mutantでmitomycin C産生は完全に廃止されたが、9a-demethyl mitomycin Aが分離された。過剰発現したMitMで活性測定。9a-demethyl mitomycin A から aziridine N-methylated product(9-epi-mitomycin B) への変換を確認。さらにmitomycin A, B, Cを基質としてmethyltransferase活性を見たところ、mitomycin Aのみが基質として役立ち、aziridineのNでメチル化されたmitomycin Fを産生した。よってMitMは、C7にmethoxy基のあるmitomycinsを基質として受け入れるが、C7にamino基のあるmitomycinsは受け入れない。 wild株でも産生されるmitomycin AがmitM deletion mutantでは検出されないことから、mitomycin C産生の廃止は9a-demethyl mitomycin A → 9-epi-mitomycin Bへのルートのブロックによると考えられる。
	ACC Q9S0N6 NITE Aver_00030 PmId [9469930] Cloning of the gene encoding avermectin B 5-O-methyltransferase in avermectin-producing Streptomyces avermitilis. (Gene. , 1998) comment BLAST id41% Streptomyces avermitilis_aveD C5-O-methyltransferase avermectin B 5-O-methyltransferaseを欠いたmutantからのaveDクローニング。 AveDのThr23-->Ileへの置換は、O-methyltransferase activityの不活化を引き起こす。

Sequence

>putative O-methyltransferase [methyltransferase]
MGPANSEGTMFDAFSREVGDYYDQANELLRAMFTDNVHYGYWPDPSSIDPLAEAGERMTE
QLYERLDVSAGHKVLDVGCGVGKPAAWLARKTGATVKGANVSRNQLEVARDRVRSEGLED
RVSFDLADAMHLPYADDSFDRIWAIESMIHMPDRDQVMREMARVLRPGGRLAIADIVVRG
TLDDVATAVVEGFCTLSTARSLEHIDNYPALVEKAGLDLLELTDVSEQTRPTGPAVLPAF
DVLLPTLGEEGVAQSKKAWGDMFDLPQYGYVLLTAGKP

>putative O-methyltransferase [methyltransferase]
ATGGGACCAGCGAATTCGGAGGGAACGATGTTCGACGCGTTCAGCCGCGAGGTCGGCGAC
TATTACGACCAGGCCAATGAACTGCTCCGCGCCATGTTCACGGACAACGTTCACTATGGG
TACTGGCCGGATCCGTCCAGCATCGATCCGCTCGCCGAGGCCGGTGAGCGGATGACCGAG
CAGCTCTACGAACGGCTCGACGTGAGCGCGGGGCACAAGGTGCTGGACGTGGGATGCGGC
GTAGGGAAGCCCGCCGCGTGGCTGGCCCGGAAGACGGGCGCCACCGTGAAGGGCGCCAAC
GTCAGCCGCAACCAGTTGGAGGTCGCGCGGGACCGGGTCCGCTCCGAGGGACTGGAGGAC
CGGGTCTCGTTCGATCTGGCCGACGCCATGCACCTCCCTTACGCCGACGATTCCTTCGAC
CGGATCTGGGCCATCGAGTCGATGATCCATATGCCGGACCGCGATCAGGTGATGCGTGAG
ATGGCGCGTGTCCTGCGGCCTGGCGGACGCCTGGCGATCGCCGACATCGTGGTGCGCGGA
ACCCTCGACGACGTGGCGACAGCAGTGGTGGAAGGTTTCTGCACGCTCAGCACGGCACGC
TCCCTGGAGCACATCGACAACTACCCCGCCCTGGTGGAGAAGGCCGGGCTCGACCTCCTG
GAACTCACCGATGTGAGCGAGCAGACACGGCCCACCGGACCGGCGGTCCTGCCCGCCTTC
GACGTCCTGCTGCCGACGCTCGGCGAGGAAGGCGTCGCCCAGTCGAAGAAGGCCTGGGGA
GACATGTTCGACCTGCCCCAATACGGCTACGTGCTGCTCACCGCCGGCAAACCGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR013216 Methyltransferase type 11 (Domain) PF08241 Methyltransf_11
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

FD891_00060 FD891_00080