Mith_00070 Mith_00070   Mith_00090 Mith_00090

Mith_00080 : CDS information

close this sectionLocation

Organism
StrainATCC 12956
Entry nameMithramycin
Contig
Start / Stop / Direction11,381 / 10,620 / - [in whole cluster]
11,381 / 10,620 / - [in contig]
Locationcomplement(10620..11381) [in whole cluster]
complement(10620..11381) [in contig]
TypeCDS
Length762 bp (253 aa)
Click on the icon to see Genetic map.

close this sectionAnnotation

Category5.1 general function
Productputative oxidoreductase
Product (GenBank)ketoreductase
Gene
Gene (GenBank)mtmTII
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[10102355] Analysis of two chromosomal regions adjacent to genes for a type II polyketide synthase involved in the biosynthesis of the antitumor polyketide mithramycin in Streptomyces argillaceus. (Mol Gen Genet. , 1999)
[16856198] Premithramycinone G, an early shunt product of the mithramycin biosynthetic pathway accumulated upon inactivation of oxygenase MtmOII. (Angew Chem Int Ed Engl. , 2006)
comment
[PMID: 10102355](1999)
mithramycin PKSの上流・下流に位置する2つの染色体領域のクローニング、シークエンスから、8genesを同定。

mtmTII はPKSの上流領域に含まれる。
抗生物質生合成に関与するpolyketide ketoreductasesに似ている。

MtmTI, MtmTII and MtmTIII はshort-chain dehydrogenase/reductase protein family (SDR)に属するreductasesに似ている。

提唱経路への割当はされていない。

--
[PMID: 16856198](2006)
mtmOII 不活化mutantからshunt産物 premithramycinone Gを同定、構造解析。
13C-labeled acetateの取り込み実験。

その構造と配列解析から、oxygenase MtmOI-OIII とketoreductase MtmTII を生合成経路に割り当てている。alpha酸化の後、2-oxoacyl-ACP reductase_MtmTII による還元が続くと考えられている。

mtmOII 不活化の際、すぐ下流にあるmtmTII もpolar effectにより不活化され、shunt産物premithramycinone Gが形成された可能性がある。
Related Reference
ACC
P23238
PmId
[3286259] ( , )
comment
Blast 438th, id36%, 1e-29
Zoogloea ramigera_phbB
Acetoacetyl-CoA reductase(EC 1.1.1.36)

Zoogloea ramigeraのAcetoacetyl-CoA reductaseの遺伝子をE. coliで過剰発現させて精製し、活性を調べている。

close this sectionSequence

selected fasta
>putative oxidoreductase [ketoreductase]
MDMGLTGRRVLVTGGSSGIGAAVARAYADEGARVALTYRGGDEAAERLARELGAGRHAAM
AVRYSLGEPDTVESAVATVTERWGGVDVLVANAVRWAPRRAPGTRFEEVASGDWRGFLDD
NLAPTLRTVQLVVAGMRARSWGRIVLISSHVALDGHRGQEFYGAAKSALHGFARSLAWDV
GRDGVLVNVVCPGLTTTERVLTGLPDEIRERELGSTPTGRLSSPEDIAGAVLFLGSAANA
NTTGQTLTVSGGR
selected fasta
>putative oxidoreductase [ketoreductase]
ATGGACATGGGACTGACAGGCCGCAGGGTGCTCGTCACGGGCGGGTCCTCCGGAATCGGT
GCGGCCGTCGCGCGCGCCTACGCGGACGAGGGGGCGCGGGTCGCCCTCACCTACCGCGGC
GGCGACGAGGCGGCCGAACGGCTCGCCCGTGAACTCGGCGCGGGCCGGCACGCGGCAATG
GCGGTGCGGTACTCCCTCGGGGAGCCGGACACCGTGGAGTCGGCCGTCGCCACGGTGACC
GAACGCTGGGGCGGGGTGGACGTGCTCGTCGCGAACGCGGTGCGCTGGGCTCCCCGCCGG
GCGCCCGGCACCCGGTTCGAGGAGGTCGCGTCCGGGGACTGGCGGGGTTTCCTCGACGAC
AACCTGGCGCCGACCCTGCGTACCGTGCAGCTGGTGGTGGCCGGGATGCGGGCGCGGTCC
TGGGGCAGGATCGTGCTCATCTCCTCGCATGTGGCCCTCGACGGCCACCGCGGGCAGGAG
TTCTACGGCGCCGCCAAGTCGGCGCTGCACGGCTTCGCCCGCAGTCTGGCCTGGGACGTG
GGCCGTGACGGTGTCCTGGTGAACGTCGTGTGCCCGGGGCTGACCACCACCGAGCGCGTG
CTCACCGGGCTGCCCGACGAGATCCGCGAGCGTGAGCTCGGCTCGACCCCCACCGGTCGG
CTCAGCAGCCCCGAGGACATCGCCGGCGCGGTGCTCTTCCTGGGCTCGGCGGCCAACGCC
AACACGACGGGCCAGACCCTCACGGTCTCCGGCGGCCGCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002198 Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (Family)
[84-95] 1.60000065022528e-05 PR00080 [142-150] 1.60000065022528e-05 PR00080 [162-181] 1.60000065022528e-05 PR00080
PR00080   SDRFAMILY
IPR002347 Glucose/ribitol dehydrogenase (Family)
[9-26] 8.5000302480906e-36 PR00081 [84-95] 8.5000302480906e-36 PR00081 [136-152] 8.5000302480906e-36 PR00081 [162-181] 8.5000302480906e-36 PR00081 [183-200] 8.5000302480906e-36 PR00081 [217-237] 8.5000302480906e-36 PR00081
PR00081   GDHRDH
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[5-252] 1.29999999999998e-67 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
IPR020904 Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site (Conserved_site)
[149-177] PS00061
PS00061   ADH_SHORT
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Mith_00070 Mith_00070   Mith_00090 Mith_00090
Page top