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Mith_00220 : CDS information

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Organism
StrainATCC 12956
Entry nameMithramycin
Contig
Start / Stop / Direction25,452 / 24,466 / - [in whole cluster]
25,452 / 24,466 / - [in contig]
Locationcomplement(24466..25452) [in whole cluster]
complement(24466..25452) [in contig]
TypeCDS
Length987 bp (328 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
ProductNDP-hexose C-4 ketoreductase
Product (GenBank)D-oliose 4-ketoreductase
Gene
Gene (GenBank)mtmU
EC number
Keyword
  • D-oliose
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[11254130] The mtmVUC genes of the mithramycin gene cluster in Streptomyces argillaceus are involved in the biosynthesis of the sugar moieties. (Mol Gen Genet. , 2001)
comment
Streptornyces argillaceus ATCC 12956 cosmid clone cosAR3から3852bpのDNA領域をシークエンスしたところ、mtmV, mtmU, mtmCの3ORFsが見つかった。

mtmU (987nt, 328aa, Mr34891)は、配列解析から3-reductaseをコードすると考えられた。これを検証するために作成されたmtmU(-) mutantは、糖鎖付加のない中間体premithramycinoneと、C-12a-Oでtrisaccharideの1st sugar D-olivoseのみを含むpremithramycin A1を蓄積。よってMtmUの機能はD-olivoseには影響しないが、trisaccharide 2nd sugar D-olioseの生合成をブロックする。D-olivoseとD-olioseの違いは4-keto基の立体配置だけなので、mtmUはD-oliose生合成に特異的に関与する4-ketoreductaseをコードすると想定された。

mtmU(-) mutantはermEpの調節下にあるmtmU(pLP2)で相補されるため、polar effectはない。また、pLP2はL-daunosamine生合成でC4 keto基還元を担うreductaseをコードするdnmVのmutantも相補した。

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selected fasta
>NDP-hexose C-4 ketoreductase [D-oliose 4-ketoreductase]
MPEDRGPLRLGLLGCAGFARRRALPSLARLTEITLTAVASRDAGRAKLFAGEFGGEPVAG
YEELLARDDLDAVYVPLPAALHAPWTGRALEAGLHVLVEKPAAATAAEADRLTRAARERG
LVVMENFGFVHHAQQEAARSLLDEGAIGELRSLTAEFAFPPLPDTDIRYQPGLGGGALLD
AGVYPIRTARLFLGDELEVTGASLREDPGRGVDVAGAALLTGPTGISAHLGFGFVHSYRC
GYTLWGSAGRIGLNRAYSARDDFTPTLTLERDGRVEERRLVPDQQFTTLFRRFAAAVRDQ
DVAGPAHDLAQQARLVERIAATARRLPL
selected fasta
>NDP-hexose C-4 ketoreductase [D-oliose 4-ketoreductase]
GTGCCCGAGGACCGTGGCCCGCTCCGCCTGGGCCTGCTGGGCTGCGCCGGCTTCGCCCGG
CGTCGCGCCCTGCCCTCGCTCGCCCGCCTCACGGAGATCACCCTCACCGCGGTCGCCAGC
AGGGACGCCGGCAGAGCGAAGCTCTTCGCCGGTGAATTCGGCGGCGAACCGGTCGCCGGA
TACGAGGAACTGCTCGCCCGGGACGATCTCGACGCGGTGTACGTACCGCTGCCCGCCGCG
CTGCACGCCCCCTGGACCGGCCGGGCGCTCGAAGCCGGACTGCACGTCCTGGTGGAGAAA
CCGGCGGCGGCCACGGCCGCGGAGGCCGACCGTCTGACCCGCGCGGCCCGCGAGCGCGGC
CTGGTCGTGATGGAGAACTTCGGTTTCGTCCACCACGCCCAGCAGGAGGCGGCCCGTTCC
CTGCTGGACGAGGGCGCCATCGGGGAACTGCGGTCGCTCACGGCCGAGTTCGCCTTCCCC
CCGCTGCCGGACACCGACATCCGCTACCAACCGGGCCTCGGCGGCGGTGCGCTGCTGGAC
GCGGGCGTGTACCCGATCCGGACGGCCCGGCTGTTCCTGGGCGACGAGCTGGAGGTGACC
GGTGCCTCGCTGCGCGAGGACCCCGGCCGCGGGGTGGACGTCGCCGGTGCGGCGCTGCTG
ACCGGGCCGACCGGGATCAGCGCCCATCTGGGCTTCGGCTTCGTCCACTCCTACCGCTGC
GGCTACACCCTGTGGGGCTCGGCGGGACGGATCGGCCTGAACCGTGCCTACAGCGCCCGG
GACGACTTCACGCCGACGCTCACGCTGGAGCGCGACGGACGGGTGGAGGAGCGCCGGCTG
GTGCCCGACCAGCAGTTCACCACGCTCTTCCGGCGGTTCGCCGCCGCCGTCCGTGACCAG
GACGTCGCCGGTCCGGCCCACGACCTCGCCCAGCAGGCGCGCCTGGTGGAGCGGATCGCC
GCCACCGCGCGGCGCCTTCCCCTGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR000683 Oxidoreductase, N-terminal (Domain)
[8-126] 1.5e-24 PF01408
PF01408   GFO_IDH_MocA
IPR004104 Oxidoreductase, C-terminal (Domain)
[139-243] 9.20000000000002e-10 PF02894
PF02894   GFO_IDH_MocA_C
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[6-149] 3.7e-42 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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