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Mith_00260 : CDS information

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Organism
StrainATCC 12956
Entry nameMithramycin
Contig
Start / Stop / Direction29,634 / 30,824 / + [in whole cluster]
29,634 / 30,824 / + [in contig]
Location29634..30824 [in whole cluster]
29634..30824 [in contig]
TypeCDS
Length1,191 bp (396 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
ProductD-oliose glycosyltransferase
Product (GenBank)glycosyltransferase
Gene
Gene (GenBank)mtmGIII
EC number
Keyword
  • trisaccharide 2nd D-oliose
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[10660060] Characterization of two glycosyltransferases involved in early glycosylation steps during biosynthesis of the antitumor polyketide mithramycin by Streptomyces argillaceus. (Mol Gen Genet. , 2000)
comment
mtmGII の上流約2kbにある2580bp領域のシークエンスからmtmGIV, mtmGIIIを同定。
これらの産物はglycosyltransferasesに似ていて、motif保存もある。

mtmGIII mutantは、糖を含まないpremithramycinoneと、C-12a-OにひとつだけD-olivoseの付着したpremithramycin A1を蓄積。
mtmGIV mutantは、premithramycinoneと4-demethyl-premithramycinoneを蓄積。
それぞれの遺伝子発現で相補されたが、交差相補はできなかった。

4つのglycosyltransferase genes(mtmGI-GIV)と2つのmethyltransferase genes(mtmMI and mtmMII)を欠いたmutantは4-demethyl-premithramycinoneを蓄積。このmutant株でのmtmGIV or mtmGIII どちらかのみの発現は、4-demethyl-premithramycinoneをglycosylationしなかった。
mtmMI and mtmMII と一緒にmtmGIII and mtmGIV が発現されたとき、糖鎖付加派生体 premithramycins A1, A2 and A3(それぞれtrisaccharideの糖を1つ、2つ、3つ含む)が産生された。
4-demethyl-premithramycinoneが糖鎖付加された化合物は生成されず、mtmMI がこの構築物からなくなるとglycosylationは起こらなかったので、4-demethyl-premithramycinoneのC-4 O-methylationは、trisaccharide鎖の1つめの糖の導入に必須であると示唆される。

これら実験結果とMtmGI, GII に関する過去の実験的証拠から、mithramycin生合成におけるglycosylation stepsの順序を提唱。MtmGIII はC-12a-Oでのtrisaccharide鎖2つめの糖(D-oliose)の付着に関与する。

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selected fasta
>D-oliose glycosyltransferase [glycosyltransferase]
MRVLVTTSPWPTHYFVVQPLAAAFRAAGHEVLVAAQPSMADLVTRSGLPMAAVGSDIDMV
DIRRKTLSQELDARQKPGEPARADDGGQVFDTWQQATLANLDPVMDLARTWKPDLVLADT
MCPPGLVAAQELGVPGIRHLWGWDFYGSAGSEQILAELPGFYDVYRAHGLDVQGDPARRT
VDPCPPSLQPPASPARLQVQYVPYNGAGRAPGPELRRTDKSRPRVCLTWGRSITRIMGER
AFLLPRVVRALDGLDIEIVVAADAATHAKLGELPDNVRVLDSPPLHLLLDDCDAIVHQGG
SGTVLNAIRVGLGQLAISHMADQDNISAALAGSGAGIHLRGEQAAEEAIRAAVIRLLEDP
DIRMSADRLRAEMLSQPTPAQVAAGLDELATAHAHH
selected fasta
>D-oliose glycosyltransferase [glycosyltransferase]
ATGCGCGTTCTGGTGACCACGTCCCCGTGGCCCACCCATTACTTCGTCGTCCAGCCGCTG
GCCGCCGCGTTCCGCGCGGCGGGCCACGAAGTCCTCGTGGCGGCCCAGCCGTCCATGGCG
GACCTGGTCACCCGGTCCGGCCTGCCCATGGCCGCCGTCGGCAGCGACATCGACATGGTG
GACATCCGCCGCAAGACGCTCTCCCAGGAACTGGACGCCCGTCAGAAGCCCGGGGAACCC
GCCCGGGCCGACGACGGCGGTCAGGTCTTCGACACCTGGCAGCAGGCCACCCTCGCCAAC
CTCGACCCGGTCATGGACCTCGCCCGGACCTGGAAACCGGACCTGGTGCTCGCCGACACC
ATGTGCCCGCCGGGCCTCGTCGCCGCACAGGAACTCGGCGTGCCGGGGATCCGCCACCTG
TGGGGCTGGGACTTCTACGGCTCGGCCGGCAGCGAGCAGATCCTCGCCGAACTCCCGGGC
TTCTACGACGTGTACCGCGCCCACGGACTGGACGTCCAGGGCGATCCCGCACGGCGCACC
GTGGACCCCTGCCCGCCGAGCCTCCAGCCGCCCGCCTCGCCCGCCCGGCTCCAGGTGCAG
TACGTGCCGTACAACGGTGCGGGCCGCGCCCCAGGACCGGAGTTGCGTCGCACGGACAAG
TCCAGGCCGCGGGTGTGCCTCACCTGGGGAAGGTCGATCACCCGGATCATGGGCGAGCGG
GCCTTCCTGCTGCCGCGGGTCGTCCGGGCGCTCGACGGCCTGGACATCGAGATCGTGGTC
GCCGCCGACGCCGCCACCCACGCGAAGCTCGGCGAACTCCCCGACAACGTCCGCGTCCTC
GACTCGCCGCCCCTGCACCTGCTGCTCGACGACTGCGACGCCATCGTCCACCAGGGCGGC
TCGGGCACCGTGCTCAACGCGATCCGGGTCGGCCTCGGCCAGCTGGCCATCTCGCACATG
GCCGACCAGGACAACATCTCCGCCGCGCTCGCCGGGTCGGGCGCCGGCATCCACCTGCGC
GGCGAGCAGGCCGCCGAGGAGGCCATCCGCGCCGCGGTGATCAGGCTCCTCGAGGACCCG
GACATCCGCATGTCGGCGGACCGGCTGCGCGCCGAGATGCTCTCCCAGCCCACCCCCGCC
CAGGTGGCCGCCGGACTCGACGAGCTGGCCACCGCCCACGCCCACCACTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR004276 Glycosyl transferase, family 28 (Domain)
[13-139] 5.6e-10 PF03033
PF03033   Glyco_transf_28
IPR010610 Domain of unknown function DUF1205 (Domain)
[181-278] 4.9e-26 PF06722
PF06722   DUF1205
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Mith_00250 Mith_00250   Mith_00270 Mith_00270
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