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Mith_00320 : CDS information

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Organism
StrainATCC 12956
Entry nameMithramycin
Contig
Start / Stop / Direction37,327 / 39,813 / + [in whole cluster]
37,327 / 39,813 / + [in contig]
Location37327..39813 [in whole cluster]
37327..39813 [in contig]
TypeCDS
Length2,487 bp (828 aa)
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Category4.4 resistance
ProductUvrA-like protein
Product (GenBank)MtrX
Gene
Gene (GenBank)mtrX
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[8757400] An ABC transporter is essential for resistance to the antitumor agent mithramycin in the producer Streptomyces argillaceus. (Mol Gen Genet. , 1996)
[10779713] Insertional inactivation of mtrX and mtrY genes from the mithramycin gene cluster affects production and growth of the producer organism Streptomyces argillaceus. (FEMS Microbiol Lett. , 2000)
comment
[PMID:8757400](1996)
S.albusに外因性mithramycinへの抵抗性を与えるS. argillaceusの最小DNA領域(3.9kb)がシークエンス、配列解析され、不完全なORF(mtrX)と完全ORFs 3つ(mtrY, A, B)が予測された。

mtrXの推定産物は、DNA修復を担うABC excision nuclease systemsの3つのsubunitsのひとつ(UvrA)に似ている。

mtrX と mtrYの各frameshift mutantは、外因性mithramycinに対する抵抗性に影響がない。しかし、内因性に合成されたmithramycinに対する防御と分泌に関与するかもしれないという可能性は残っている。

---
[PMID:10779713](2000)
mtrXはmithramycin生合成に必須ではないが、不活化で成長率に影響あり。
mtrX異種性発現でmithramycin抵抗性をやや増加させる。

mtrA and mtrBによってコードされるABC transporterは高いmithramycin抵抗性を与えるので、MtrXはABC transporter排出を免れたmithramycinによるminor DNA damagesの修復をする二次的な自己抵抗性機構として働きうると提唱している。
Related Reference
ACC
Q70J73
NITE
Chro_00250
PmId
[17768249] Involvement of a chromomycin ABC transporter system in secretion of a deacetylated precursor during chromomycin biosynthesis. (Microbiology. , 2007)
comment
Blast 2nd, id53%, 0.0
Streptomyces griseus subsp. griseus_cmrX
UV-repair protein

cmrXを不活化するとchromomycinに感受性のある低産生株となる。
S. albusで異種性にcmrA and cmrB または cmrX を発現するとchromomycin抵抗性が低くなる。
したがって、高レベルの抵抗性を達成するには、cmrA, cmrB, cmrXを同時発現する必要がある。
CmrAB ABC transporterは4A,4E-O-dideacetyl-chromomycin A3への高レベル抵抗性を与える。

これらの結果から提唱されているモデルは、生物活性の低い中間体dideacetyl-chromomycin A3をABC transporter CmrABによって認識し、それから膜結合CmmAによってacetyl化して、できあがった完全活性型chromomycin A3は細胞外に分泌される、というもの。
CmrXは低生物活性を持つ中間体に対して産生者を保護することで関与するとされている。

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selected fasta
>UvrA-like protein [MtrX]
MGTGEHAIEVVGARTHNLDDLTVSVPKGRVVAFTGVSGSGKTSLLIDTIHAEAQLRYLEG
ISPFVRQFITPRDRPQVTRIEGLPPTLAVDQRIPARSPRSTLATVTGVGDYLGLAFARLP
PLARDWDPTLGAALKTAQFNPAMPEGCCAQCRGSGGRARSAEALLITEPGRPLLDGASPW
FAMARAPERATVQALCPRRFAADLGQPWREQPEEVRRVVLHGTGEEAVEIAYEATMKKSG
TTVSVRDSRPWPGAIAEAERLYSGAAGPAVRATYEPFVRNEPCAACEGTGLGVVARTVRL
GGRRLHELLDRPVEDVLGWAEGLAATLGPAQREAAQAVLPALRARLRLLVRLGVGHLQLS
RPAPTLSGGELQRARVAAQLCTDLSGVAFVLDEPSPGLHPDKRVWANSSRNCCGSGNTVL
MIEHDPELISRADWVIDVGPGAGRGGGRLVAQGAPREIAAVPESLTGRYLAMPGGRVRRA
RRPVRADRMLSLTDVDVRTVRADRIDIPLGALTCLTGVSGSGKSTLLMDGVAGAVQARLD
GTSAPGVGGVDWTGPLHWATVVDQEPIGRTPRSNPATYTKAFNLIRNLFAGTDAAARRGL
TAGSFSFNSPGGRCEPCTGYGVRQVDMNFLPDVWVTCDVCDGRRFGPEVLAVTYQGLAID
EVLDLTIDEASELLDTPALRPVLTALRRTGLGYMRLGQRRHRAVRAARAQRLKLAALLLT
KGAAGSPDSWCLDEPVTGLHPADVQVLVDARFDVLIAAGNTWSSPSMIFICAAADWLVDM
GPGSRRAGGTVLHCGPPDVLRPDSGPTAGYLCGLLAGRGAPTASVDAV
selected fasta
>UvrA-like protein [MtrX]
ATGGGGACCGGGGAGCACGCCATCGAGGTGGTCGGCGCCCGAACGCACAACCTGGACGAT
CTGACGGTCTCCGTGCCCAAGGGCCGGGTCGTCGCGTTCACGGGAGTGAGCGGCAGCGGC
AAGACCTCACTGCTGATCGACACCATCCACGCCGAGGCCCAGCTGCGGTATCTGGAGGGG
ATCAGCCCGTTCGTACGGCAGTTCATCACTCCGCGGGATCGCCCGCAGGTGACCCGGATC
GAGGGGCTGCCCCCCACGCTCGCCGTCGACCAGCGGATCCCGGCGCGCAGCCCGCGCTCC
ACGCTGGCCACCGTCACCGGAGTCGGCGACTACCTTGGTCTCGCCTTCGCCCGGCTGCCT
CCGCTGGCCAGGGACTGGGACCCGACGCTGGGCGCGGCGCTGAAGACGGCGCAGTTCAAC
CCGGCCATGCCGGAGGGGTGCTGCGCGCAGTGCCGCGGCAGCGGAGGCCGGGCCCGGTCA
GCAGAGGCCCTGCTGATCACCGAGCCCGGTCGGCCGCTGCTGGACGGGGCGTCGCCGTGG
TTCGCCATGGCGCGCGCCCCCGAGCGGGCGACGGTCCAGGCGCTGTGCCCGCGGCGCTTC
GCGGCGGATCTCGGCCAGCCCTGGCGCGAGCAGCCCGAGGAGGTCCGGCGGGTGGTGCTG
CACGGAACCGGCGAGGAAGCGGTGGAGATCGCCTACGAGGCGACCATGAAGAAGAGCGGC
ACGACGGTCAGTGTCCGTGACAGCCGCCCGTGGCCGGGGGCGATCGCCGAGGCGGAGCGG
CTGTACAGTGGCGCGGCCGGTCCCGCCGTCCGGGCGACGTACGAGCCGTTCGTCCGCAAC
GAGCCCTGTGCCGCGTGCGAGGGGACGGGCCTGGGCGTGGTCGCCCGTACCGTGCGGCTC
GGCGGCCGGCGCCTGCACGAACTCCTCGACCGTCCGGTCGAGGACGTGCTCGGCTGGGCC
GAAGGCCTGGCCGCGACGCTCGGGCCGGCCCAACGGGAGGCGGCGCAGGCGGTTCTGCCC
GCCCTCCGGGCGCGGCTCAGGCTGCTGGTCCGGCTCGGGGTCGGACACCTCCAGCTCTCC
CGCCCGGCTCCCACGCTGTCCGGCGGGGAACTGCAGCGGGCCCGGGTGGCGGCCCAGCTG
TGCACCGATCTGTCGGGGGTGGCGTTCGTCCTGGACGAGCCGTCGCCGGGGCTGCACCCG
GACAAGCGCGTCTGGGCGAACTCATCGAGGAACTGCTGCGGCTCCGGGAACACCGTCCTC
ATGATCGAACACGATCCCGAGCTGATCTCCCGGGCGGACTGGGTGATCGACGTCGGTCCG
GGGGCCGGGCGCGGGGGCGGAAGGCTGGTGGCCCAAGGCGCTCCGCGGGAGATCGCGGCC
GTCCCCGAATCGCTGACCGGCCGCTATCTGGCGATGCCGGGCGGACGGGTGCGGCGCGCG
CGGCGCCCGGTGCGCGCCGACCGGATGCTCAGCCTGACCGATGTCGACGTGCGGACCGTG
CGAGCCGACCGGATCGACATCCCGCTGGGCGCGCTGACCTGCCTCACGGGCGTGAGCGGC
AGCGGCAAGAGCACGCTGCTCATGGACGGCGTGGCCGGGGCGGTACAGGCTCGGCTCGAC
GGGACGAGCGCGCCGGGTGTCGGCGGGGTGGACTGGACGGGCCCGCTGCACTGGGCGACC
GTGGTCGACCAGGAGCCCATCGGCAGGACACCGCGCTCCAATCCGGCGACGTACACCAAG
GCGTTCAACCTGATCCGCAATCTGTTCGCGGGCACTGACGCCGCCGCCCGCCGCGGACTG
ACGGCGGGCTCGTTCTCCTTCAACTCGCCGGGCGGACGCTGCGAACCGTGCACCGGGTAC
GGCGTACGGCAGGTCGACATGAACTTCCTGCCCGACGTCTGGGTCACCTGTGACGTGTGC
GACGGCAGGCGGTTCGGGCCCGAGGTGCTGGCGGTGACCTACCAGGGGCTGGCCATCGAC
GAGGTGCTGGACCTGACCATCGACGAGGCGAGCGAGTTGCTGGACACGCCTGCGCTGCGG
CCGGTGCTCACGGCGCTGCGGCGGACGGGGCTGGGCTACATGCGGCTGGGGCAGAGGCGC
CACCGTGCTGTCCGGGCGGCGAGGGCGCAGCGGCTGAAGCTCGCCGCGCTGCTGCTCACC
AAGGGCGCGGCCGGCAGCCCGGACTCGTGGTGCCTGGACGAGCCGGTCACCGGTCTGCAT
CCGGCGGACGTGCAAGTGCTGGTCGACGCCCGGTTCGACGTGCTGATCGCCGCGGGCAAC
ACGTGGTCCTCGCCGAGCATGATCTTCATCTGCGCCGCCGCGGACTGGCTGGTCGACATG
GGCCCGGGCAGCCGGCGCGCTGGCGGCACGGTGTTGCACTGCGGCCCTCCGGACGTCCTC
CGCCCGGACTCGGGCCCCACCGCCGGGTATCTGTGCGGGCTGCTCGCCGGCCGAGGTGCT
CCCACAGCATCAGTCGATGCCGTATAG

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR017871 ABC transporter, conserved site (Conserved_site)
[366-380] PS00211
PS00211   ABC_TRANSPORTER_1
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Mith_00310 Mith_00310   Mith_00330 Mith_00330
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