Mith_00350 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces argillaceus
Strain	ATCC 12956
Entry name	Mithramycin
Contig	X89899
Start / Stop / Direction	41,587 / 42,288 / + [in whole cluster] 41,587 / 42,288 / + [in contig]
Location	41587..42288 [in whole cluster] 41587..42288 [in contig]
Type	CDS
Length	702 bp (233 aa)

Annotation

Category	4.3 transport
Product	mithramycin resistance ABC transporter permease protein
Product (GenBank)
Gene
Gene (GenBank)	mtrB
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	membrane protein involved in mithramycin resistance
Reference	ACC Q194P0 PmId [8757400] An ABC transporter is essential for resistance to the antitumor agent mithramycin in the producer Streptomyces argillaceus. (Mol Gen Genet. , 1996) comment mithramycin産生株S.argillaceusはvivoでmithramycinに高い抵抗性を示すが、関連薬剤chromomycin and olivomycinには感受性である。 S.albusに外因性mithramycinへの抵抗性を与えるS. argillaceusの最小DNA領域(3.9kb)がシークエンス、配列解析され、不完全なORF(mtrX)と完全ORFs 3つ(mtrY, A, B)が予測された。 MtrAは抗生物質産生株で自己抵抗性に関連したABC transportersと類似性を示す。 mtrBは6つのputative transmembrane helicesを持つ膜内在性タンパク質をコードする。 mithramycin非産生mutantでmtrAを遺伝子置換により不活化すると、外因性mithramycinに対して感受性になった。また、mithramycin産生株でのmtrA不活化mutantは得られなかったので、mithramycin産生株でのmtrA不活化は致命的であると示唆される。よってmtrABによってコードされるputative ABC transporterは、mithramycin産生株S.argillaceusにおけるmithramycin抵抗性に必須である。
Related Reference	ACC Q70J76 NITE Chro_00220 PmId [17768249] Involvement of a chromomycin ABC transporter system in secretion of a deacetylated precursor during chromomycin biosynthesis. (Microbiology. , 2007) comment Blast 8th, id48%, 7e-42 Streptomyces griseus subsp. griseus_cmrB Membrane protein cmrXを不活化するとchromomycinに感受性のある低産生株となる。 S. albusで異種性にcmrA and cmrB または cmrX を発現するとchromomycin抵抗性が低くなる。したがって、高レベルの抵抗性を達成するには、cmrA, cmrB, cmrXを同時発現する必要がある。 CmrAB ABC transporterは4A,4E-O-dideacetyl-chromomycin A3への高レベル抵抗性を与える。これらの結果から提唱されているモデルは、生物活性の低い中間体dideacetyl-chromomycin A3をABC transporter CmrABによって認識し、それから膜結合CmmAによってacetyl化して、できあがった完全活性型chromomycin A3は細胞外に分泌される、というもの。

Sequence

>mithramycin resistance ABC transporter permease protein
MAQKRMGLLIGLVQPFVYMALFGPLLVKMLPEDGPAAWQVYIPGLLVQLGLFATALRRFG
LIPDVRSGYLERLRVTPASRLGLLLGRVLWDVLALFIQSVVIVLIALLFGLRAPFGGVVA
AIALMMLVGISLAFLSYALAMKLTSEWLFAPVLNAIALPLMLLSGILLPLTYAPGWLQAI
GDANPLRYAVDAMRDFFTGDYTSHHVVVGVAVVLGLMVVSAVGGTRIFAKYNA

>mithramycin resistance ABC transporter permease protein
GTGGCCCAAAAGAGGATGGGTCTCCTCATCGGCCTCGTCCAGCCGTTCGTCTACATGGCC
CTGTTCGGCCCCCTCCTGGTCAAGATGCTGCCGGAGGACGGCCCGGCCGCCTGGCAGGTC
TACATCCCGGGCCTGCTGGTGCAACTGGGTCTGTTCGCCACCGCGCTACGCCGGTTCGGT
CTCATCCCCGACGTCCGTTCCGGCTACCTGGAACGGCTGCGGGTGACCCCGGCGAGCCGG
CTCGGTCTGCTCCTCGGCAGGGTCCTCTGGGACGTCCTGGCCCTGTTCATCCAGTCGGTG
GTCATCGTCCTCATCGCCCTGCTCTTCGGCCTGCGCGCGCCGTTCGGCGGCGTCGTGGCC
GCCATCGCCCTGATGATGCTCGTCGGCATCAGTCTGGCCTTCCTCTCCTACGCGCTGGCC
ATGAAGCTGACATCGGAGTGGCTCTTCGCCCCCGTCCTCAACGCCATCGCCCTGCCTCTG
ATGCTGCTGTCCGGCATCCTCCTGCCCCTGACCTACGCCCCCGGCTGGCTCCAGGCCATC
GGCGACGCCAACCCCCTGCGCTACGCGGTGGACGCCATGCGCGACTTCTTCACCGGCGAC
TACACCTCCCACCACGTCGTGGTCGGCGTGGCCGTGGTGCTCGGCCTGATGGTCGTCTCG
GCGGTGGGTGGCACCCGCATCTTCGCCAAGTACAACGCGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR000412 ABC-2 (Family) PS51012 ABC_TM2 IPR013525 ABC-2 type transporter (Domain) PF01061 ABC2_membrane
SignalP	No significant hit
TMHMM	Transmembrane 6

Mith_00340 last last