Mith_00340 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces argillaceus
Strain	ATCC 12956
Entry name	Mithramycin
Contig	X89899
Start / Stop / Direction	40,562 / 41,524 / + [in whole cluster] 40,562 / 41,524 / + [in contig]
Location	40562..41524 [in whole cluster] 40562..41524 [in contig]
Type	CDS
Length	963 bp (320 aa)

Annotation

Category	4.3 transport
Product	mithramycin resistance ABC transporter ATP-binding protein
Product (GenBank)
Gene
Gene (GenBank)	mtrA
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	ATP-binding protein involved in mithramycin resistance
Reference	ACC Q194P1 PmId [8757400] An ABC transporter is essential for resistance to the antitumor agent mithramycin in the producer Streptomyces argillaceus. (Mol Gen Genet. , 1996) comment mithramycin産生株S.argillaceusはvivoでmithramycinに高い抵抗性を示すが、関連薬剤chromomycin and olivomycinには感受性である。 S.albusに外因性mithramycinへの抵抗性を与えるS. argillaceusの最小DNA領域(3.9kb)がシークエンス、配列解析され、不完全なORF(mtrX)と完全ORFs 3つ(mtrY, A, B)が予測された。 MtrAは抗生物質産生株で自己抵抗性に関連したABC transportersと類似性を示す。 mtrBは6つのputative transmembrane helicesを持つ膜内在性タンパク質をコードする。 mithramycin非産生mutantでmtrAを遺伝子置換により不活化すると、外因性mithramycinに対して感受性になった。また、mithramycin産生株でのmtrA不活化mutantは得られなかったので、mithramycin産生株でのmtrA不活化は致命的であると示唆される。よってmtrABによってコードされるputative ABC transporterは、mithramycin産生株S.argillaceusにおけるmithramycin抵抗性に必須である。
Related Reference	ACC Q70J75 NITE Chro_00230 PmId [17768249] Involvement of a chromomycin ABC transporter system in secretion of a deacetylated precursor during chromomycin biosynthesis. (Microbiology. , 2007) comment Blast 2nd, id55%, 2e-86 Streptomyces griseus subsp. griseus_cmrA ATP-binding protein cmrXを不活化するとchromomycinに感受性のある低産生株となる。 S. albusで異種性にcmrA and cmrB または cmrX を発現するとchromomycin抵抗性が低くなる。したがって、高レベルの抵抗性を達成するには、cmrA, cmrB, cmrXを同時発現する必要がある。 CmrAB ABC transporterは4A,4E-O-dideacetyl-chromomycin A3への高レベル抵抗性を与える。これらの結果から提唱されているモデルは、生物活性の低い中間体dideacetyl-chromomycin A3をABC transporter CmrABによって認識し、それから膜結合CmmAによってacetyl化して、できあがった完全活性型chromomycin A3は細胞外に分泌される、というもの。

Sequence

>mithramycin resistance ABC transporter ATP-binding protein
MIQAKGLAKTFTTKQGPVEAVAGVDFTVHTGEIVGFLGPNGAGKTTTMRMLTTLLPPSSG
TAVIAGRDLLHEPAKVRTHIGYVSQAGGAKPSSPVRRDLVLQGRLYGMSRSEAEARADEV
ITQLGLEELADRIIQTLSGCQARRVDMALGLMHQPELLFLDEPTANLDPESRNDVWEHIR
RLRDERGTTVFLTTHYLDEADSLCDRVLIIDKGRIIAEDSPRSLKAAISHDTIEIEVADD
TARATELLAAHRDVHEVSVNGTVLSISCRDAERLLADLLRTLESARIRVESLRVLKPTLD
DVFMTLTDRRSQRGADAVHA

>mithramycin resistance ABC transporter ATP-binding protein
ATGATCCAGGCCAAGGGGCTGGCCAAGACGTTCACCACCAAGCAGGGCCCGGTCGAGGCG
GTGGCCGGAGTCGACTTCACCGTCCACACGGGCGAGATCGTGGGCTTCCTGGGGCCCAAC
GGCGCCGGCAAGACCACCACCATGCGGATGCTGACCACGCTGCTCCCGCCGAGTTCGGGC
ACGGCCGTCATCGCCGGCCGCGATCTGCTGCACGAGCCCGCGAAGGTCCGCACGCACATC
GGCTACGTCTCCCAGGCGGGCGGCGCCAAGCCGAGCTCCCCGGTCCGCCGGGACCTCGTC
CTCCAAGGCCGCCTCTACGGCATGTCCCGCTCCGAGGCCGAGGCCCGCGCCGACGAGGTG
ATCACCCAGCTCGGCCTCGAAGAACTCGCGGACCGGATCATCCAGACCCTCTCCGGCTGT
CAGGCCCGCCGCGTCGACATGGCGCTGGGCCTGATGCACCAGCCGGAGCTGCTCTTCCTC
GACGAACCCACCGCCAACCTCGACCCCGAGAGCCGCAACGACGTCTGGGAGCACATCCGT
CGCCTGCGTGACGAGCGCGGCACCACCGTGTTCCTCACCACCCACTACCTCGACGAGGCC
GACAGCCTCTGCGACCGCGTCCTGATCATCGACAAGGGCCGCATCATCGCCGAGGACAGT
CCGCGGAGCCTGAAGGCCGCCATCTCCCACGACACCATCGAGATCGAGGTGGCCGACGAC
ACCGCACGGGCCACCGAACTGCTCGCCGCCCACCGCGACGTCCACGAGGTGTCGGTGAAC
GGCACGGTTCTGTCGATCAGTTGCCGCGACGCCGAGCGCCTCCTCGCCGACCTGCTGCGC
ACGCTGGAGTCCGCGCGCATCCGGGTGGAGTCCCTGCGGGTGCTGAAGCCCACGCTCGAC
GACGTCTTCATGACCCTGACCGACCGACGTTCGCAGCGCGGCGCGGACGCCGTCCACGCC
TGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR003439 ABC transporter-like (Domain) PF00005 ABC_tran PS50893 ABC_TRANSPORTER_2 IPR003593 AAA+ ATPase domain (Domain) SM00382 AAA IPR005894 Daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit (Family) TIGR01188 DrrA
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

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