| Category | 5.4 hypothetical protein |
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| Product | hypothetical protein |
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| Product (GenBank) | OxyI |
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| Gene | oxyI
otcY2-2 |
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| Gene (GenBank) | oxyI |
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| EC number | |
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| Keyword | |
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| Note | |
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| Note (GenBank) | - putative fourth ring cyclase; similar to MtmX from the mithramycin PKS
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| Reference | - ACC
- Q3S8Q7
- PmId
[16597959] Engineered biosynthesis of a novel amidated polyketide, using the malonamyl-specific initiation module from the oxytetracycline polyketide synthase. (Appl Environ Microbiol. , 2006)
[17631493] Investigation of early tailoring reactions in the oxytetracycline biosynthetic pathway. (J Biol Chem. , 2007) - comment
- [PMID:16597959](2006)
oxytetracycline gene clusterのシークエンス、配列解析。
resistance genes otrAとotrBの間に全21genesを同定。
わかりやすくするため、gene namesがotc → oxyに変更され、振り直されている。
oxyI (otcY2-2): Cyclase
MtmXと相同なsmall proteinで、A ring(4th ring)形成をたぶん触媒すると述べられている。
機能解析はされていない。
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[PMID:17631493](2007)
異種性に6-methylpretetramidを産出するために要求されるoxytetracycline生合成経路由来酵素の最小セットを同定している。
CH999株でamidated decaketide tetracycline骨格を産生するにはOxyABCDJで必要十分であることがわかっている。これに2つのcyclase genes (oxyK and oxyN)を追加したplasmidにすると4環化合物が蓄積された。よって、tetracyclineの4環すべての環化に必要なのはOxyK and OxyNのみ。
pWJ83(oxyABCDJKN)またはpWJ90(oxyABCDJKNI )の発現産物の特性は同じなので、OxyI は明らかなcyclase機能を持たない。
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| Related Reference | - ACC
- Q9ZAT9
- NITE
- Adria_00050
- PmId
[9864344] Doxorubicin overproduction in Streptomyces peucetius: cloning and characterization of the dnrU ketoreductase and dnrV genes and the doxA cytochrome P-450 hydroxylase gene. (J Bacteriol. , 1999)
[10631513] A two-plasmid system for the glycosylation of polyketide antibiotics: bioconversion of epsilon-rhodomycinone to rhodomycin D. (Chem Biol. , 1999) - comment
- Blast 16th, id46%, 6e-24, N末50aaほど余る
Streptomyces peucetius_dpsH(dnmW)
Daunorubicin biosynthesis enzyme
[DoBISCUIT]hypothetical protein
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[PMID: 9864344](1999)
dpsH::aphII mutantは、有意な量のRHOを蓄積したが、daunorubicin (DNR) or doxorubicin (DXR)はしなかった。(TLC and HPLC analysis)
このmutantでの相補実験もしたがdpsH geneの役割についての明白な結論に到達できなかった。
dpsHはdaunosamine生合成またはRHOへのdaunosamine付着に関連する可能性あり？
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[PMID: 10631513](1999)
dpsH(dnmW) geneの役割の再評価をしている。
dpsH in-frame mutantは、RHOの蓄積が増える(160-273%)が、DNR(23-34%) and DXR(10-24%)の産生もまだいくらかある。
よってdpsHは、anthracycline glycosides RHOD, DNR and DXRの形成において、重要ではあるが絶対的に必要ではない。これを受けてdpsH→dnmWへ改名している。
DiscussionにdnmQ or dnmWどちらかの欠損は厳しくdTDP-daunosamineの形成を減らす、との記述があるがdTDP-daunosamine量を測定している実験の記載はなく由来不明。
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- ACC
- Q2PA04
- NITE
- Stref_00110
- PmId
[16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006) - comment
- Blast 21st, id43%, 5e-21
Streptomyces steffisburgensis_stfX
Cyclase
[DoBISCUIT]hypothetical protein
StfXはpolyketideの4番目の環化をすると考えられていたが、stfX不活化mutantでも4th ring cyclizationされたcompound 1を検出。
よってこの環化は自発的に発生し、StfXはこの過程を促進するとされている。
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- ACC
- Q53925
- NITE
- Actino_00020
- PmId
[17227452] Possible involvement of ActVI-ORFA in transcriptional regulation of actVI tailoring-step genes for actinorhodin biosynthesis. (FEMS Microbiol Lett. , 2007) - comment
- Blast 37th, id36%, 8e-12
Streptomyces coelicolor_ORFA
Hydroxylacyl-CoA dehydrogenase
[DoBISCUIT]hypothetical protein
actVI-ORFA mutantはactinorhodin産生減少、中間体(S)-DNPAとshunt産物(S)-NHABを蓄積。相補で回復。
また、同じmutantでactVI-ORF1発現量が減少。相補で回復。
よってActVI-ORFAは、post-PKS tailoring enzymeであるactVI-ORF1の発現を通してactinorhodin産生に影響を与えるregulatory roleを持つ可能性あり。
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Oxtet_00080
Location
