C1027_00110 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces globisporus
Strain	C-1027
Entry name	C-1027
Contig	AY048670
Start / Stop / Direction	14,643 / 14,212 / - [in whole cluster] 14,643 / 14,212 / - [in contig]
Location	complement(14212..14643) [in whole cluster] complement(14212..14643) [in contig]
Type	CDS
Length	432 bp (143 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	C-1027 apoprotein
Product (GenBank)	C-1027 apoprotein
Gene	cagA
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	CagA
Reference	ACC Q79S99 PmId [12183628] Biosynthesis of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. (Science. , 2002) comment Streptomyces globisporus_cagA C-1027 apoprotein clusterで登録された配列のエントリ− [PMID:12183628] C-1027の生合成遺伝子クラスターの報告 Fig.2に表示されているが、特に記述なし。
Related Reference	ACC Q06110 PmId [1368692] ( , ) [1369059] ( , ) [8373405] ( , ) [19845765] Disruption of cagA, the apoprotein gene of chromoprotein antibiotic C-1027, eliminates holo-antibiotic production, but not the cytotoxic chromophore. (FEMS Microbiol Lett. , 2009) comment Streptomyces globisporus_cagA Antitumor antibiotic C-1027 apoprotein C-1027-AG このエントリはcagA単独配列で登録されているIDで、クラスターで登録されているQ79S99とはアミノ酸配列100%一致。 [PMID:1368692] abst only C-1027-AGと呼んでいる。酵素精製後、アミノ酸の同定をしている。 [PMID:1369059] C-1027 apoproteinのcloningとsequence解析 chromophore productionに依存したearly growth phaseでmonocistronicな転写を行う。 142AAをコードするCagAはmatureなCagA apoproteinを産生する為に32AAのlead peptideを切断することにより加工される。 [PMID:8373405] chromophoreとapoprotein間の特異的相互作用 chromophoreとapoproteinが1:1で結合することを確認。 chromophoreが選択的にapoproteinに取り込まれ、apoproteinによってそのDNA切断活性の損失から強く保護される事を証明。 [PMID:none(1999)] Enediyne biosynthesis and self-resistance: a progress report. Bioorg. Chem.27:172-188. クロモフォアプロテインenediynesはアポプロテインがhistoneを切断しDNAを暴露させ、その後chromophoreによりDNAを破壊するという二面攻撃を経由してin vivoで実際に機能しているかもしれないと推測。また、apoproteinが恒常的に発現しており、chromophoreの産生に依存する事から、 chrmophoreは捕捉されており、apoproteinは極端な細胞毒性をもつ天然化合物に対して自己耐性の機能を持つ可能性が推測された。 C1027非生産株の培養液からapoproteinは検出出来なかった（data unpublished）ことから、apoproteinはchromophoreと結合しないと分泌されないと推測された。 [PMID:19845765] CagAの機能解析 apoprotein gene cagA欠損株はantibacterial assayによって検出されるC-1027 holo-antibiotic 生産ができなかった。野生株でのcagA過剰発現はC-1027 productionが増加した。 ESI- MSやESI-MS/MSによる解析は、cagA-disrupted mutantでC-1027 enediyne chromophoreやそのaromatized productの生産を検出した。リアルタイム逆転写PCRの結果はこれと一致しており、positive regulator sgcR3,structural genes sgcA1,sgcC4,sgcD6,sgcEの転写は野生株や相補株と同様cagA-disrupted mutant株で検出された。 C-1027のapoproteinはenediyne chromophoreのself-resistance mechanismに必須ではない事を初めて示した。

Sequence

>C-1027 apoprotein [C-1027 apoprotein]
MSLRHMSRRASRFGVVAVASIGLAAAAQSVAFAAPAFSVSPASGLSDGQSVSVSVSGAAA
GETYYIAQCAPVGGQDACNPATATSFTTDASGAASFSFVVRKSYTGSTPEGTPVGSVDCA
TAACNLGAGNSGLDLGHVALTFG

>C-1027 apoprotein [C-1027 apoprotein]
ATGTCGTTACGTCACATGTCCCGCCGTGCTTCCAGGTTCGGCGTCGTGGCCGTCGCATCC
ATCGGCCTGGCCGCCGCCGCACAGTCCGTCGCCTTCGCCGCGCCCGCCTTCTCCGTCAGT
CCCGCCTCGGGTCTGAGTGACGGACAGAGCGTGTCGGTGTCGGTCAGCGGTGCCGCCGCC
GGCGAGACCTACTACATCGCCCAGTGCGCTCCGGTCGGTGGCCAGGACGCGTGCAACCCG
GCGACCGCGACGTCCTTCACCACGGACGCGTCCGGAGCGGCGTCGTTCAGCTTCGTCGTG
CGCAAGTCGTACACGGGCTCCACGCCCGAAGGCACGCCGGTCGGCAGCGTCGACTGCGCC
ACGGCCGCCTGTAACCTCGGCGCCGGCAACTCCGGGCTCGACCTCGGCCACGTGGCTCTG
ACCTTCGGCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR002186 Neocarzinostatin-type antitumour, antibiotic chromoprotein (Family) PR01885 MACROMOMYCIN G3DSA:2.60.40.230 no description SSF49319 Actinoxanthin-like PF00960 Neocarzinostat PD012709 CAGA_STRGL_Q06110;
SignalP	Bacteria, Gram-positive Eukaryota Bacteria, Gram-negative
TMHMM	Transmembrane 1

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