C1027_00470 C1027_00470   C1027_00490 C1027_00490

C1027_00480 : CDS information

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Organism
StrainC-1027
Entry nameC-1027
Contig
Start / Stop / Direction60,935 / 62,014 / + [in whole cluster]
60,935 / 62,014 / + [in contig]
Location60935..62014 [in whole cluster]
60935..62014 [in contig]
TypeCDS
Length1,080 bp (359 aa)
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Category4.1 transcriptional regulator
Producttranscriptional activator
Product (GenBank)regulatory protein
GenesgcR1
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
  • ORF40
Reference
ACC
PmId
[12183628] Biosynthesis of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. (Science. , 2002)
[19159491] Role of sgcR3 in positive regulation of enediyne antibiotic C-1027 production of Streptomyces globisporus C-1027. (BMC Microbiol. , 2009)
[20551990] Manipulation of pathway regulation in Streptomyces globisporus for overproduction of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. (J Antibiot (Tokyo). , 2010)
[21250756] Improvement of the enediyne antitumor antibiotic C-1027 production by manipulating its biosynthetic pathway regulation in Streptomyces globisporus. (J Nat Prod. , 2011)
comment
[PMID:12183628]
C-1027の生合成遺伝子クラスターの報告

Fig.2のclusterで記載されているのみ。


[PmId 19159491]
制御遺伝子として同定されたSgcR1,R2,R3のSgcR3に関しての機能解析。

cross-complementation studyにて、SgcR3がプロモーター領域に直接結合することでsgcR1R2の転写を活性化することを示した。


[PMID:20551990]
SgcR1,SgcR2の機能解析論文。

SgcR1過剰発現株はsgcR1,sgcR2,sgcR3の過剰発現株よりも力価の改善でより効果的であったことから、SgcR1による一つ、あるいは多数の遺伝子の制御がC-1027の生産のボトルネックになっていると予想している。

sgcR1の過剰発現株では、enedyne生合成メカニズムの早期段階でheptaeneの生産を活性化した。また、sgcR2,sgcR3の過剰発現株で産生したheptaeneの力価はWTより高かったことから、SgcR1,SgcR2,SgcR3はpositiveなregulatorであると同定した。


[PMID:21250756]
C-1027 regulation proteinsの解析

sgcR欠損株においてsgcR1の過剰発現させると、C-1027産生は約7倍に上がったことをみている。

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selected fasta
>transcriptional activator [regulatory protein]
MKSDSAQRAVERSRRVVRIDELIPADSPRLNGIDRSHVQRLATVYASLPPVLVHRPTMRV
VDGMHRIGAARLKGLDTVEVTFFEGAEEQVFLRSVAANITNGLPLSVADRKTAAARILAS
HPTLSDRAVAAHVGLDAKTVAGVRTCSAAGSPLLNMRTGADGRVHPLDRTAERLHAAALL
TQDPGLPLRSVVEQTGLSLGTAHDVRRRLLRGEDPVPQNRQSAMLEPGLAPQKKATAKPP
VGPAARPVPKVPPAVAGRPPVSPRSRAPLEALRKLSNDPSLRHSDQGRELMRWLHNRFVV
DEAWRRRADAVPAHCVDSMAELAQHCSDAWHRFAEEMVRRRHSAAADGSGLRTTQPTRR
selected fasta
>transcriptional activator [regulatory protein]
GTGAAAAGTGACTCTGCCCAACGCGCCGTGGAGCGATCACGCCGTGTCGTACGGATCGAT
GAACTCATTCCCGCCGATTCCCCGCGCCTGAACGGAATCGATCGTTCCCATGTGCAGCGC
CTCGCGACCGTGTACGCGTCCCTGCCGCCGGTCCTGGTGCACCGCCCGACCATGCGGGTC
GTCGACGGCATGCACCGCATCGGCGCGGCCCGCCTGAAGGGGCTGGACACGGTCGAGGTC
ACCTTCTTCGAGGGCGCCGAGGAGCAGGTGTTCCTGCGTTCCGTCGCGGCGAACATCACC
AACGGCCTGCCGTTGTCGGTGGCCGACCGCAAGACCGCCGCGGCCCGCATTCTGGCCTCC
CACCCGACCCTGTCCGACCGCGCGGTCGCCGCACACGTCGGCCTCGACGCCAAGACCGTG
GCGGGGGTACGGACGTGTTCAGCCGCGGGTTCTCCGCTGCTGAACATGCGCACCGGGGCG
GACGGCCGCGTCCACCCGTTGGACCGCACCGCCGAACGCCTGCACGCGGCCGCGCTGCTG
ACCCAGGACCCGGGACTCCCGTTGCGCTCCGTCGTCGAGCAGACGGGGCTGTCGCTGGGC
ACGGCCCACGACGTCCGCCGTCGGCTGCTGCGGGGCGAGGACCCGGTCCCGCAGAACCGG
CAGAGCGCGATGCTGGAGCCGGGACTCGCCCCGCAGAAGAAGGCGACGGCCAAGCCGCCC
GTCGGCCCGGCCGCCCGTCCGGTCCCGAAGGTGCCGCCCGCCGTCGCCGGCAGGCCGCCG
GTGTCACCGCGGTCCCGGGCCCCGCTGGAGGCGCTGCGCAAGCTCTCCAACGACCCCTCC
CTGCGCCACTCCGACCAGGGGCGCGAACTCATGCGCTGGCTGCACAACCGGTTCGTCGTC
GACGAGGCGTGGCGCCGGCGCGCGGACGCGGTCCCGGCCCACTGCGTCGACTCGATGGCG
GAGCTGGCGCAGCACTGCTCGGACGCCTGGCACCGGTTCGCCGAGGAGATGGTTCGGCGC
CGGCACAGCGCCGCGGCCGACGGCTCCGGACTCCGCACGACTCAGCCAACTCGCCGTTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR003115 ParB-like nuclease (Domain)
[17-99] 9.10000000000001e-07 PF02195
PF02195   ParBc
[14-101] 1.49999977583352e-08 SSF110849
SSF110849   ParBc
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
C1027_00470 C1027_00470   C1027_00490 C1027_00490
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