C1027_00480 C1027_00480   C1027_00500 C1027_00500

C1027_00490 : CDS information

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Organism
StrainC-1027
Entry nameC-1027
Contig
Start / Stop / Direction62,040 / 62,894 / + [in whole cluster]
62,040 / 62,894 / + [in contig]
Location62040..62894 [in whole cluster]
62040..62894 [in contig]
TypeCDS
Length855 bp (284 aa)
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Category4.1 transcriptional regulator
ProductAraC family transcriptional activator
Product (GenBank)putative regulatory protein
GenesgcR2
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
  • ORF41
Reference
ACC
PmId
[12183628] Biosynthesis of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. (Science. , 2002)
[19159491] Role of sgcR3 in positive regulation of enediyne antibiotic C-1027 production of Streptomyces globisporus C-1027. (BMC Microbiol. , 2009)
[20551990] Manipulation of pathway regulation in Streptomyces globisporus for overproduction of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. (J Antibiot (Tokyo). , 2010)
comment
[PMID:12183628]
C-1027の生合成遺伝子クラスターの報告

Fig.2のclusterで記載されているのみ。
遺伝子欠損の結果より、sgcB1-sgcR3がC-1027生合成クラスターであると提案している。このORFの機能解析はされていない。


[PMID:19159491]
制御遺伝子として同定されたSgcR1,R2,R3のSgcR3に関しての機能解析論文。

cross-complementation studyにて、SgcR3がプロモーター領域に直接結合することでsgcR1R2の転写を活性化することを示した。


[PMID:20551990]
SgcR1,SgcR2の機能解析論文。

sgcR1,sgcR2,sgcR3の過剰発現株を各作製し、これらの株におけるC-1027とheptaene産生の変化および生物活性を見ている。
C-1027の生産にpositive activatorとして機能していることが示された。

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selected fasta
>AraC family transcriptional activator [putative regulatory protein]
MTTNTIEDAVRRVVEYMHVNLGQNLTIDDMARTAMFSKFHFTRIFREVTGTSPGRFLSAL
RIQEAKRLLVHTALSVADISSQVGYSSVGTFSSRFKACVGLSPSAYRDFGGVQPGFPSAA
ARLTPTAHNPSVRGRIHSAPGDRPGRIFVGLFPGRMRQGRPARWTVMESPGAFELRDVPV
GTWHILVHSFPAGHRPHQLDSEPLLLGHSGPLVVHPGALLRPADILLRAVDALDPPVLLA
HFALESRLTSPYSPSSVALRASAGRAWVRQPPGVRRRYADRDRG
selected fasta
>AraC family transcriptional activator [putative regulatory protein]
GTGACCACGAACACCATCGAGGACGCGGTCCGCCGGGTCGTCGAGTACATGCACGTCAAC
CTGGGTCAGAACCTCACGATCGATGACATGGCGCGCACGGCGATGTTCAGCAAGTTCCAT
TTCACCCGCATCTTCCGCGAAGTCACCGGTACCTCTCCCGGGCGTTTCCTGTCCGCCTTA
CGGATTCAGGAGGCCAAGAGACTTCTCGTGCACACTGCACTCAGTGTGGCCGATATCAGC
AGTCAGGTCGGCTACAGCAGTGTCGGTACTTTCAGTTCTCGCTTCAAGGCCTGTGTGGGG
CTTTCCCCGAGCGCCTATCGCGACTTCGGCGGGGTGCAGCCGGGTTTTCCCTCCGCCGCG
GCCCGTCTCACTCCCACCGCGCACAATCCCTCCGTGCGCGGCCGCATTCACTCCGCCCCG
GGTGACAGGCCCGGAAGGATCTTCGTGGGCCTGTTCCCCGGCAGGATGCGCCAGGGCCGC
CCGGCGCGCTGGACCGTCATGGAGAGTCCCGGGGCCTTCGAGCTCCGGGACGTGCCCGTG
GGCACCTGGCACATCCTGGTCCACTCCTTCCCCGCCGGACACCGGCCGCACCAGCTCGAC
TCCGAACCGCTGTTGCTCGGGCACAGCGGACCGCTCGTGGTGCACCCCGGTGCCCTGCTC
CGGCCGGCGGACATCCTCCTGCGCGCGGTGGACGCCCTCGATCCACCGGTCCTGCTGGCC
CACTTCGCGCTGGAGAGCCGCCTCACCTCGCCGTACTCACCGTCATCGGTAGCCCTCCGC
GCATCCGCAGGGAGAGCATGGGTTCGGCAACCGCCCGGTGTCCGGCGACGGTACGCAGAT
CGAGATCGCGGGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR009057 Homeodomain-like (Domain)
[7-60] 1e-25 G3DSA:1.10.10.60 [61-108] 1.3e-21 G3DSA:1.10.10.60
G3DSA:1.10.10.60   Homeodomain-rel
[6-57] 2.70000183580794e-11 SSF46689 [60-108] 1.29999924468179e-13 SSF46689
SSF46689   Homeodomain_like
IPR018060 DNA binding HTH domain, AraC-type (Domain)
[24-107] 1.3000049540733e-33 SM00342
SM00342   HTH_ARAC
[11-109] PS01124
PS01124   HTH_ARAC_FAMILY_2
IPR018062 HTH domain AraC-type, conserved site (Conserved_site)
[61-103] PS00041
PS00041   HTH_ARAC_FAMILY_1
IPR020449 Transcription regulator HTH, AraC- type (Family)
[76-91] 8.59999720482718e-06 PR00032 [91-107] 8.59999720482718e-06 PR00032
PR00032   HTHARAC
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
C1027_00480 C1027_00480   C1027_00500 C1027_00500
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