| Category | 3.4 other modification |
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| Product | putative epoxide hydrolase/cyclase |
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| Product (GenBank) | putative epoxide hydrolase |
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| Gene | |
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| Gene (GenBank) | slnBIII |
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| EC number | |
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| Keyword | |
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| Note | - Belongs to polyether epoxide hydrolase(PEH)-B group.
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| Note (GenBank) | |
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| Reference | - ACC
- H6D586
- PmId
[22156425] Cloning and characterization of the polyether salinomycin biosynthesis gene cluster of Streptomyces albus XM211. (Appl Environ Microbiol. , 2012) - comment
- polyetherに特異的なepoxidaseの配列に基づいた縮重プライマーを用いてStreptomyces albus XM211からsalinomycin(sln)生合成gene clusterを同定。
SlnBIII (153aa) : Epoxide hydrolase
slnBII と slnBIII はputative epoxide hydrolase genesであり、8bpのオーバーラップがある。
slnBII, slnBIII mutantではsalinomycin非検出。
slnBI mutantと違って、retention timeの短い新規ピークあり。
提唱されているsalinomycin生合成経路において、SlnBII と SlnBIII はepoxide-opening と閉環反応に割り当てられている。
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| Related Reference | - ACC
- H1ZZV0
- NITE
- Salino_01080
- PmId
[22076845] A late-stage intermediate in salinomycin biosynthesis is revealed by specific mutation in the biosynthetic gene cluster. (Chembiochem. , 2012) - comment
- 配列は[H6D586]と全く同じ。株違い。
monC gene-based hybridisation probeを使って、Streptomyces albus DSM 41398からsalinomycin(sal)生合成gene clusterを同定。
salBII (153aa) : epoxide hydrolase/cyclase
MonB-like epoxide hydrolasesは、他のpolyether gene clusterで1〜2つコードされるのに対し、sal clusterでは3つある。このうちsalBI と salBII を一緒に削除してもsalinomycin産生量に変化なし。
残るSalBIII がこれらの欠損を代償するかどうかは確認されていない。
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- ACC
- B6ZK72
- NITE
- Lasal_00210
- PmId
[18710235] Epoxide hydrolase Lsd19 for polyether formation in the biosynthesis of lasalocid A: direct experimental evidence on polyene-polyepoxide hypothesis in polyether biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2008)
[21375229] Enzymatic epoxide-opening cascades catalyzed by a pair of epoxide hydrolases in the ionophore polyether biosynthesis. (Org Lett. , 2011)
[22388816] Enzymatic catalysis of anti-Baldwin ring closure in polyether biosynthesis. (Nature. , 2012) - comment
- Blast 2nd, id60%, 3e-41(C-term) > id36%, 3e-16(N-term)
Streptomyces lasaliensis_lsd19
Epoxide hydrolase
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[PMID:18710235](2008)
Lsd19をE.coliにて発現、クローニング、精製し活性を見ている。
incubationによりsingle deastereomerである6-endo-tet cyclization productを産生。trichloroacetic acidでbisepoxideを処理すると5-exo-tet cyclization modeを介してisolasalocid Aを産生する。
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[PMID:21375229](2011)
site-directed mutagenesis, domain dissection analysisにより機能解析をしている。
D170A,E197Aでは一つ目のtetrahydrofuran環の形成で止まった化合物ができる。
lsd19A(N-term domain): 5-exo cyclization (bisepoxyprelasalocid A -> monocyclized intermediate)
lsd19B(C-term domain): 6-endo cyclization (monocyclized intermediate -> lasalocid A)
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[PMID:22388816](2012)
結晶構造解析、および、触媒メカニズムの予測を行っている。
Lsd19Bの酵素活性中心における重要なアミノ酸はH146,D170,E197,Y251を挙げている。
polyether epoxide hydrolaseについてまとめて解析あり（構造モデリングと配列alignment）。
配列alignmentから、Lsd19A(N末)に似たPEH-AとLsd19B(C末)に似たPEH-Bに分類される。
Nigericinのような長めの基質で働くPEH-AはC末に余剰領域あり。
構造モデリングで、PEH-Aは深いbinding pocketが見られ、internal cyclic ethersの形成を担うとされている。PEH-Bは浅いbinding pocketが見られ、terminal cyclic ethersの形成を担うとされている。
NanI のN末, MonBI, NigBI はLsd19Bに似たPEH-Bに分類されている。
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- ACC
- Q846W7
- NITE
- Monen_00240
- PmId
[16632258] Evidence for the role of the monB genes in polyether ring formation during monensin biosynthesis. (Chem Biol. , 2006) - comment
- Blast 5th, id43%, 3e-28
Streptomyces cinnamonensis_monBI
Probable monensin biosynthesis isomerase
monBI and/or monBII genesの削除は、monensins A and Bの代わりにC-3-O-demethylmonensinsと多くのminor components(C-9-epi-monensin Aを含む)のmixtureを産生する株をもたらす。これら全てのminor componentsは、酸の処理によってmonensinsに効率的に変換された。
MonBI- and MonBII-欠損mutantsの産物のパターンは同一。
よってepoxide開環と随伴性のpolyether環形成がMonB enzymesによって触媒されると示唆される。
これに一致して、MonB-type enzymesの構造がRhodococcus erythropolis由来limonene-1,2-epoxide hydrolaseの構造に近しく似ていることがhomology modelingで示された。
MonBI and MonBIIがheterodimerを形成し、epoxide hydrolase/cyclaseとして働くことが提唱されている。
MonBI, MonBII それぞれの役割はわかっていない。
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Salino3_00290
Location
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![[15-130] 2.2e-11 PF12680](../../img/H.gif "[15-130] 2.2e-11 PF12680"){kind=small}
