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Pier_00110 : CDS information

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Organism
Strain
Entry namePiericidin
Contig
Start / Stop / Direction46,881 / 47,654 / + [in whole cluster]
46,881 / 47,654 / + [in contig]
Location46881..47654 [in whole cluster]
46881..47654 [in contig]
TypeCDS
Length774 bp (257 aa)
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Category3.2 modification methylation
Productputative O-methyltransferase
Product (GenBank)PieB2
GenepieB2
Gene (GenBank)
EC number2.1.1.-
Keyword
  • C-4'
Note
Note (GenBank)
  • methyltransferase
Reference
ACC
PmId
[22365607] Elucidation of Piericidin A1 biosynthetic locus revealed a thioesterase-dependent mechanism of alpha-pyridone ring formation. (Chem Biol. , 2012)
comment
Piericidin A1生合成gene clusterの報告。

PieB2: Methyltransferase
homolog: Methyltransferase [Stigmatella aurantiaca]

配列解析から、2つのO-methyltransferase PieB1, PieB2がPiericidin A1のtailoringに関与するとしている。

17kb fragment(pieA4-B2)を置換したdeletion mutantはPiericidin A1の産生を完全に廃止した。
Related Reference
ACC
W0C915
PmId
comment
Blast id69%
Streptomyces sp. SCSIO 03032
PieB2

深海由来Streptomyces sp. SCSIO 03032からpiericidin A1 gene clusterを同定。
in vivo and in vitro実験で、4'-hydroxylaseとしてPieEが、4'-O-methyltransferaseとしてPieB2が検証され、これによってpiericidin A1生合成に関与するPKS後修飾段階が解明された。

3つの異なる株由来のpiericidin A1 gene clustersにはそれぞれ、methyltransferaseをコードする遺伝子が2つずつある(pieB1, pieB2)。

pieB1不活化株ではpiericidin A1に関連する化合物を検出しない。
pieB2不活化株では化合物 4 (4'-O-demethyl-piericidin A1)を産生した。

pieB1 and pieB2をクローニングして可溶性タンパクとして精製し、in vitro assayに使用した。
PieB2はSAM存在下で化合物 4をpiericidin A1へと変換したが、PieB1ではできなかった。よって、PieB2がpiericidin A1生合成を仕立てる特異的な4'-O-methyltransferaseであると確認された。

PieB1のin vitro assayは推定基質を欠くためにできていないが、pieB1不活化株ではpiericidin A1産生がなくなることから、PieB1はその生合成に関与し、おそらく5'-O-methyl基形成を担う。

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selected fasta
>putative O-methyltransferase [PieB2]
MAVDNDVYNTHSWWHDDQPFATLEAFTPARFDYFHDVLTNRLRLDLAGLRVLDVGCGGGL
LAELYAKAGCKVTGMDPSGPSLEAARAHAAESGLEIEYQQGFAEKLPFPDGTFDVVYCCD
TLEHVTSVDQAVAEAVRVLKPGGYYLYDTINRTFRSKLAMIKMAQDWKSVSFAPKDLHDW
KSFIKPAELHEVFRRHGLANQDLIGFASKRPQLELLKAMRSRARGEITYGELGRQFQLGV
HKDTSVIYAGYARKAAN
selected fasta
>putative O-methyltransferase [PieB2]
ATGGCTGTCGACAACGACGTCTACAACACACACTCCTGGTGGCACGACGACCAGCCGTTC
GCCACCCTGGAGGCGTTCACCCCGGCCCGGTTCGACTACTTCCACGACGTGCTGACCAAC
CGGCTGCGGCTGGACCTCGCCGGCCTTCGCGTGCTCGACGTGGGCTGCGGCGGCGGCCTG
CTCGCCGAGCTCTACGCCAAGGCCGGCTGCAAGGTCACCGGCATGGACCCGTCCGGCCCC
TCGTTGGAGGCCGCCCGCGCCCACGCCGCCGAGTCCGGCCTGGAGATCGAGTACCAGCAG
GGCTTCGCCGAGAAGCTGCCCTTCCCGGACGGCACCTTCGACGTCGTCTACTGCTGCGAC
ACGCTGGAGCACGTCACCTCGGTGGACCAGGCGGTCGCCGAGGCGGTCCGGGTCCTCAAG
CCGGGCGGCTACTACCTGTACGACACGATCAACCGCACCTTCCGGTCCAAGCTCGCGATG
ATCAAGATGGCGCAGGACTGGAAGTCGGTCAGCTTCGCGCCCAAGGACCTCCACGACTGG
AAGAGCTTCATCAAGCCGGCCGAGCTGCACGAGGTCTTCCGCCGTCACGGCCTGGCCAAC
CAGGACCTGATCGGATTCGCCTCCAAGCGGCCGCAGTTGGAGCTGCTGAAGGCGATGCGG
AGCCGGGCCCGCGGCGAGATCACGTACGGCGAGCTGGGGCGGCAGTTCCAGCTCGGCGTT
CACAAGGACACGTCGGTGATCTACGCCGGCTATGCACGAAAGGCAGCAAACTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR010233 Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase (Family)
[11-207] 1.2e-47 TIGR01983
TIGR01983   UbiG
IPR013216 Methyltransferase type 11 (Domain)
[52-145] 2.2e-28 PF08241
PF08241   Methyltransf_11
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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