Teicp_00110 : CDS information

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Organism
StrainDSM 43866 (=NBRC 13999)
Entry nameTeicoplanin
Contig
Start / Stop / Direction12,342 / 13,523 / + [in whole cluster]
12,342 / 13,523 / + [in contig]
Location12342..13523 [in whole cluster]
12342..13523 [in contig]
TypeCDS
Length1,182 bp (393 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
Productglycosyltransferase
UDP-N-acetyl-glucosamine transferase
Product (GenBank)glycosyltransferase
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
  • Bht6
Note
Note (GenBank)
  • ORF1
Reference
ACC
PmId
[15113000] Biosynthetic gene cluster of the glycopeptide antibiotic teicoplanin: characterization of two glycosyltransferases and the key acyltransferase. (Chem Biol. , 2004)
comment
[PMID: 15113000](2004)
DSM 43866株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。

tei orf1: Glycosyltransferase

putative glycosyltransferases Orf1 and Orf10*を異種性発現、精製し、teicoplanin (pseudo)aglyconeとのインキュベーション産物をLC-MSで解析した。Orf1は、teicoplanin heptapeptide aglyconeの3-chloro-beta-hydroxytyrosine-6 (3-Cl-6βHty)に、UDP-N-acetyl-glucosamineのみを特異的に移すglycosyltransferaseである。vancomycin aglycone、UDP-glucosamine, GDP-mannoseを基質として使用することはできない。
Related Reference
ACC
Q6ZZJ7
NITE
Teicp2_00170
PmId
[11386360] Teicoplanin biosynthesis genes in Actinoplanes teichomyceticus. (Antonie Van Leeuwenhoek. , 2000)
[14702401] Organization of the teicoplanin gene cluster in Actinoplanes teichomyceticus. (Microbiology. , 2004)
[17661468] Kinetic analysis of teicoplanin glycosyltransferases and acyltransferase reveal ordered tailoring of aglycone scaffold to reconstitute mature teicoplanin. (J Am Chem Soc. , 2007)
comment
DSM 43866株でのtei orf1とAA配列完全一致。
UniProt同一entry.

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[PMID: 11386360](2000)
balhimycin clusterのbgtfAを用いてteicoplanin gene clusterを同定。

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[PMID: 14702401](2004)
ATCC 31121株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。

tcp ORF8: Glycosyltransferase GtfA

ORF8はaa6を典型的にglycosylateするGtfA proteinsに最も関連する。

ORF8によってコードされるtGtfAを過剰発現したE. coli抽出物は、teicoplanin aglycone, UDP-N-acetyl-glucosamineと共にインキュベーションされ新しいピークをもたらした。このピークは、標準化合物4(aa6にUDP-N-acetyl-glucosamineが付加したaglycone)と一致した。

teicoplanin aglyconeの代わりに、化合物4やvancomycin aglyconeを用いても産物は得られなかった。
UDP-N-acetylgalactosamine, U/TDP-glucose, UDP-galactoseも基質とはならなかった。

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[PMID: 17661468](2007)
teicoplanin glycosyltransferases (tGtfA and tGtfB) と acyltransferase (tAtf) の詳細な動態特徴づけの報告。基質による活性の違いから反応の順番が確定している。

まずtGtfBが架橋済teicoplanin aglyconeのpositoin 4に、その次にtGtfAがposition 6にglycosylateする。acyltransferase tAtfはteicoplaninに繋がれた糖で働く。

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selected fasta
>glycosyltransferase [glycosyltransferase]
MRVLFSSYGTRGDVEPLVALAVRLRELGAEVRMCASPDYVERLAEVEVPMVPIGQPVRAG
ARKGAAPPGAPEAVAEVIAEQFDRVPPFAEGCDAVVASGLVSTAVAVRSVAEKLGIHHYA
YAVLSPSFLRAPGVTDSRDLRARANQGAYRQFGGPLNSHRAAVGLPPVEKVIDYAFTERP
WLAADPVLDPLRPTDPDVVQTGAWILPDQRPLSAELEGFLRAGSPPVYVGFGSGPAPAEA
ARVAIEAVRAQGRRVVLSSGWAGLGRIDEGDDCLVVGEVNHQVLFGRVAAVVHHGGAGTT
TAVTRAGAPQVVVPQKADQPYYAGRVADLGVGVAHDGPTPTVESLSAALATALTPGIRAR
AAAVAGTIRTDGTTVAAKLLLEAISRQRSSVPA
selected fasta
>glycosyltransferase [glycosyltransferase]
ATGCGCGTGCTGTTTTCGTCCTACGGGACACGCGGAGATGTCGAGCCCCTGGTGGCATTG
GCCGTGCGACTGCGGGAACTCGGTGCGGAGGTCCGGATGTGCGCGTCGCCGGACTACGTG
GAGCGGCTGGCCGAGGTCGAAGTGCCGATGGTGCCGATCGGCCAGCCGGTGCGCGCGGGG
GCCCGCAAGGGTGCAGCGCCTCCGGGGGCGCCCGAGGCCGTGGCCGAGGTGATCGCCGAG
CAGTTCGACAGGGTCCCGCCGTTCGCCGAAGGGTGTGACGCGGTGGTGGCCAGCGGTCTG
GTGTCCACCGCCGTCGCCGTGCGGTCGGTCGCCGAGAAGCTGGGCATCCACCACTACGCC
TACGCCGTGCTCTCGCCGTCCTTTCTGCGCGCGCCCGGCGTGACCGACAGCCGGGACCTG
CGGGCCCGGGCCAACCAGGGCGCCTATCGACAGTTCGGTGGCCCGCTCAACAGCCATCGG
GCCGCGGTCGGCCTGCCGCCGGTGGAGAAGGTCATCGACTACGCCTTCACCGAGCGCCCC
TGGTTGGCGGCGGACCCGGTCCTGGACCCGCTGCGGCCGACGGACCCGGACGTGGTGCAG
ACCGGCGCGTGGATCCTGCCCGACCAGCGGCCGTTGTCGGCGGAGTTGGAGGGGTTCTTG
AGGGCTGGCTCGCCTCCGGTGTACGTGGGTTTCGGCAGTGGGCCGGCGCCTGCCGAGGCC
GCGCGGGTGGCCATCGAGGCGGTTCGGGCTCAGGGCCGCCGGGTGGTGCTGTCCAGTGGT
TGGGCCGGGTTGGGCCGGATCGACGAGGGGGATGACTGTCTGGTGGTGGGCGAGGTGAAC
CATCAGGTGCTGTTCGGCCGGGTGGCCGCCGTCGTCCACCACGGCGGGGCGGGCACGACG
ACCGCGGTGACCCGGGCGGGCGCTCCGCAGGTCGTGGTGCCCCAGAAGGCGGATCAGCCC
TACTATGCCGGTCGGGTGGCTGACCTGGGTGTCGGCGTGGCGCATGACGGTCCGACCCCG
ACCGTCGAGTCCCTGTCCGCGGCGCTGGCCACGGCGTTGACCCCGGGGATCCGGGCGCGA
GCGGCGGCGGTGGCCGGCACGATCCGCACCGACGGGACGACGGTGGCCGCGAAACTGCTC
CTCGAGGCGATCAGCCGGCAGAGATCGTCGGTTCCCGCGTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09
show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR004276 Glycosyl transferase, family 28 (Domain)
 [3-118]  4.5e-23 PF03033
PF03033   Glyco_transf_28
IPR007235 Glycosyl transferase, family 28, C-terminal (Domain)
 [290-358]  0.00014 PF04101
PF04101   Glyco_tran_28_C
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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